easy Primer Design

easy Primer Design

Пра гэту праграму

easy Primer Design - гэта інструмент, які дапамагае вам распрацоўваць праймеры для ПЦР дзе заўгодна і з эканоміяй часу: на лаўцы падчас чакання эксперыменту, па дарозе на працу, з працы, або ў офісе. Проста ўстаўце сваю нуклеатыдную паслядоўнасць і ўкажыце свае патрабаванні для стварэння паслядоўнасцей праймераў для вашай праграмы кланавання ПЦР.

Асаблівасці:
- Выкарыстоўвайце кнопку ўстаўкі, каб увесці паслядоўнасць. Уведзены CDS/паслядоўнасць змяшчае лічбы, прабелы, разрывы радкоў, вялікія ці малыя літары? Усё роўна! easy Primer Design выдаляе лічбы, прабелы і разрывы радкоў і мяняе ўсё на вялікія літары!
-увядзіце сваю паслядоўнасць без пачатковага і стоп-кадонаў (і атрымайце паведамленне з папярэджаннем, калі вы забыліся выдаліць адзін з іх), каб быць гнуткім для распрацоўкі праймера для плазмід з N-канцавымі або C-канцавымі тэгамі.
-выбірайце з больш чым 20 розных сайтаў рэстрыкцыйных ферментаў, кланаванне Golden Gate падтрымліваецца праз BsaI і BsbI, вы нават можаце ўвайсці ў навес
-get Папярэджанне, калі абраны вамі фермент разрэжа ўведзеную паслядоўнасць
-максімальная гібкасць з дапамогай опцыі фермента рэстрыкцыі "іншае", увядзіце сайт фермента рэстрыкцыі, калі яго няма ў спісе - падтрымліваюцца непаліндромныя паслядоўнасці! Калі ўведзены вамі сайт абмежаванняў прысутнічае ва ўведзенай паслядоўнасці або ў яе зваротным дапаўненні, вы атрымаеце паведамленне з папярэджаннем!
- атрымаць паведамленне з папярэджаннем, каб пазбегнуць распаўсюджаных памылак «капіраваць-ўставіць», калі ўведзеная паслядоўнасць утрымлівае няпоўны кодон!
- уключыце паслядоўнасць KOZAK у праймер, калі хочаце
-выберыце, ці патрэбны вам пачатковы кодон, і калі вам патрэбны стоп-кодон (можна выбраць усе 3 агульныя стоп-кодоны)
-увядзіце тэмпературу плаўлення для грунтовак, разлічаную з выкарыстаннем тэмпературы плаўлення, скарэкціраванай соллю
-увядзіце канцэнтрацыю солі (Na+)
-увядзіце пашырэнне 5'-канца для абодвух вашых праймераў
-праймеры генеруюцца, каб заканчвацца на G або C
-адлюстроўваецца тэмпература плаўлення, утрыманне G/C і даўжыня грунтоўкі
-празрысты працэс праектавання! усе прамежкавыя крокі адлюстроўваюцца! Выбраныя вамі параметры адлюстроўваюцца пад канчатковымі вынікамі!
кнопка -copy, каб скапіяваць увесь вынік і адправіць яго па электроннай пошце на ваш настольны ПК для наступных этапаў праектавання або захаваць у выглядзе файла!
- Абнаўленне да версіі 0.03: новая функцыя «DeletionIn»: дапамагае распрацоўваць праймеры для ПЦР з пашырэннем перакрыцця, каб выдаліць пэўныя ўнутраныя вобласці з паслядоўнасці (напрыклад, выдаліць дамены)
- Абнаўленне да версіі 0.045: новая функцыя «Мутацыя» дапамагае распрацоўваць праймеры для ПЦР з пашырэннем перакрыцця, каб мутаваць пэўны кодон у вашай паслядоўнасці для кадавання іншай амінакіслоты
- Абнаўленне да версіі 0.060: новая функцыя: «DeletionNC» - дапамагае распрацоўваць праймеры для выдалення N(5')- або C(3')-канцавых абласцей з вашай паслядоўнасці.
- Абнаўленне да версіі 0.080: новая функцыя: «Устаўка» - правядзіце пальцам улева ў верхнім галоўным меню і знайдзіце даведку па распрацоўцы праймераў для ПЦР з пашырэннем перакрыцця, каб уставіць паслядоўнасць устаўкі ў паслядоўнасць
- Абнаўленне да версіі 0.085: новая функцыя: «Замяніць» - правядзіце пальцам улева ў верхнім галоўным меню, каб атрымаць дапамогу па распрацоўцы праймераў для ПЦР з пашырэннем перакрыцця, якія замяняюць унутраную вобласць уведзенай устаўленай паслядоўнасцю

Калі ласка, звярніце ўвагу: мабільнае прыкладанне easy Primer Design не забяспечвае гатовыя да выкарыстання паслядоўнасці праймераў, яно падтрымлівае вас толькі ў працэсе распрацоўкі праймераў. Карыстальнік павінен старанна праверыць правільнасць кожнай часткі згенераванага выніку і правесці ўсе іншыя неабходныя тэсты!

Шчаслівага кланавання! - Спадзяюся, гэта дапамагае :)

Што новага

Update for current Android versions
minor bug fixes