easy Primer Design은 실험을 기다리는 벤치, 출퇴근길, 사무실 등 언제 어디서나 시간 효율적인 방식으로 PCR 프라이머를 디자인할 수 있도록 도와주는 도구입니다. 뉴클레오티드 시퀀스를 붙여넣고 PCR 클로닝 애플리케이션을 위한 프라이머 시퀀스를 생성하기 위한 요구 사항을 지정하기만 하면 됩니다.
특징:
- 붙여넣기 버튼을 사용하여 시퀀스를 입력합니다. 입력한 CDS/시퀀스에 숫자, 공백, 줄 바꿈, 대문자 또는 소문자가 포함되어 있습니까? 그것은 중요하지 않습니다! 쉬운 Primer Design은 숫자, 공백 및 줄 바꿈을 제거하고 모든 것을 대문자로 변경합니다!
- N-말단 또는 C-말단 태그가 있는 플라스미드에 대한 프라이머 설계에 유연성을 제공하기 위해 시작 및 중지 코돈 없이 시퀀스를 입력합니다(그리고 그 중 하나를 제거하는 것을 잊은 경우 경고 메시지가 표시됨).
- 20개 이상의 다양한 제한 효소 사이트 중에서 선택, Golden Gate 클로닝은 BsaI 및 BsbI를 통해 지원되며 오버행에 들어갈 수도 있습니다.
-선택한 효소가 입력한 서열을 절단할 경우 경고 메시지를 받습니다.
- 제한 효소 옵션 '기타'를 통한 최대 유연성, 목록에 없는 경우 제한 효소 사이트를 입력하십시오 - 비 회문 서열이 지원됩니다! 입력한 제한 사이트가 입력한 시퀀스 또는 역보완에 있는 경우 경고 메시지가 표시됩니다!
-입력한 시퀀스에 불완전한 코돈이 포함된 경우 일반적인 '복사-붙여넣기' 오류를 방지하기 위해 경고 메시지를 받으십시오!
- 원하는 경우 정방향 프라이머에 KOZAK 시퀀스 포함
-시작 코돈이 필요한지, 정지 코돈이 필요한지 선택(공통 정지 코돈 3개 모두 선택 가능)
-소금 조정 용융 온도를 사용하여 계산된 프라이머의 녹는 온도를 입력합니다.
-소금 농도 입력(Na+)
-프라이머 모두에 대해 5'-end extension을 입력합니다.
-프라이머는 G 또는 C로 끝나도록 생성됩니다.
-녹는 온도, G/C 함량 및 프라이머 길이 표시
-투명한 디자인 과정! 모든 중간 단계가 표시됩니다! 선택한 옵션이 최종 결과 아래에 표시됩니다!
-복사 버튼을 눌러 전체 출력을 복사하고 다음 디자인 단계를 위해 전자 메일을 통해 데스크탑 PC로 보내거나 파일로 저장하십시오!
-버전 0.03 업데이트: 새로운 기능 'DeletionIn': 시퀀스에서 특정 내부 영역을 삭제(예: 도메인 삭제)하기 위해 중첩 확장 PCR용 프라이머를 설계하는 데 도움이 됩니다.
-버전 0.045 업데이트: 새로운 기능 '돌연변이'는 중첩 확장 PCR을 위한 프라이머를 설계하여 시퀀스의 특정 코돈을 다른 아미노산을 코딩하도록 돌연변이시키는 데 도움을 줍니다.
-버전 0.060 업데이트: 새로운 기능: 'DeletionNC' - 시퀀스에서 N(5')- 또는 C(3')-말단 영역을 삭제하기 위한 프라이머 설계를 도와줍니다.
-버전 0.080 업데이트: 새로운 기능: '삽입' - 상단 메인 메뉴에서 왼쪽으로 스와이프하고 중첩 확장 PCR용 프라이머 디자인에 대한 도움말을 찾아 삽입 시퀀스를 시퀀스에 삽입합니다.
- 버전 0.085 업데이트: 새로운 기능: '바꾸기' - 입력된 삽입 시퀀스로 내부 영역을 대체하는 중첩 확장 PCR용 프라이머 설계에 대한 도움말을 보려면 상단 메인 메뉴에서 왼쪽으로 스와이프합니다.
참고: Easy Primer Design 모바일 앱은 바로 사용할 수 있는 프라이머 시퀀스를 제공하지 않으며 프라이머 디자인 프로세스 중에만 지원합니다. 사용자는 생성된 결과의 모든 부분의 정확성을 신중하게 검증하고 필요한 모든 다른 테스트를 수행해야 합니다!
행복한 복제! -도움이 되길 바랍니다 :)