easy Primer Design

easy Primer Design

Описание

easy Primer Design — это инструмент, который поможет вам разработать праймеры для ПЦР в любом месте и с минимальными затратами времени: на рабочем столе в ожидании эксперимента, по дороге на работу или с работы, или в офисе. Просто вставьте свою нуклеотидную последовательность и укажите свои требования для создания последовательностей праймеров для вашего приложения клонирования ПЦР.

Функции:
-Используйте кнопку вставки, чтобы ввести последовательность. Введенная CDS/последовательность содержит цифры, пробелы, разрывы строк, прописные или строчные буквы? Это не имеет значения! easy Primer Design удаляет цифры, пробелы и разрывы строк и заменяет все буквы в верхнем регистре!
- введите свою последовательность без стартового и стоп-кодона (и получите предупреждающее сообщение, если вы забыли удалить один из них), чтобы быть гибким для дизайна праймеров для плазмид с N-концевыми или C-концевыми метками.
- выбор из более чем 20 различных сайтов рестрикционных ферментов, клонирование Golden Gate поддерживается через BsaI и BsbI, вы даже можете войти в выступ
-получать предупреждающие сообщения, если выбранный вами фермент будет сокращать введенную вами последовательность
-Максимальная гибкость благодаря опции рестрикционного фермента «другое», введите свой сайт рестрикционного фермента, если его нет в списке - поддерживаются непалиндромные последовательности! Если введенный вами сайт рестрикции присутствует в введенной вами последовательности или в ее обратном дополнении, вы получите предупреждающее сообщение!
- получить предупреждающее сообщение, чтобы избежать распространенных ошибок «копировать-вставить», если введенная последовательность содержит неполный кодон!
- включите последовательность KOZAK в предварительный праймер, если хотите
-выберите, нужен ли вам стартовый кодон и нужен ли вам стоп-кодон (все 3 общих стоп-кодона можно выбрать)
- введите температуру плавления для ваших грунтовок, она рассчитывается с использованием температуры плавления с поправкой на соль
-введите концентрацию соли (Na+)
- введите 5'-концевое удлинение для обоих ваших праймеров
-праймеры оканчиваются на G или C
-отображаются температура плавления, содержание G/C и длина грунтовки
-Прозрачный процесс проектирования! отображаются все промежуточные шаги! Выбранные вами параметры отображаются под окончательными результатами!
-Копировать, чтобы скопировать весь вывод и отправить его по электронной почте на ваш настольный ПК для следующих этапов проектирования или сохранить его в виде файла!
-Обновление версии 0.03: новая функция «DeletionIn»: помогает создавать праймеры для ПЦР с удлинением перекрытия для удаления определенных внутренних областей из последовательности (например, удаления доменов).
- Обновление версии 0.045: новая функция «Мутация» помогает вам создавать праймеры для ПЦР с удлинением перекрытия, чтобы мутировать определенный кодон в вашей последовательности для кодирования другой аминокислоты.
-Обновление версии 0.060: новая функция: «DeletionNC» — помогает создавать праймеры для удаления N(5')- или C(3')-концевых областей из вашей последовательности.
-Обновление версии 0.080: новая функция: «Вставка» — проведите пальцем влево в верхнем главном меню и найдите справку по разработке праймеров для ПЦР с удлинением перекрытия, чтобы вставить последовательность вставки в вашу последовательность.
- Обновление версии 0.085: новая функция: «Заменить» — проведите пальцем влево в верхнем главном меню, чтобы получить помощь по разработке праймеров для ПЦР с расширением перекрытия, которые заменяют внутреннюю область введенной последовательностью вставки.

Обратите внимание: мобильное приложение easy Primer Design не предоставляет готовые к использованию последовательности праймеров, а только поддерживает вас в процессе разработки праймеров. Пользователь должен тщательно проверить правильность каждой части сгенерированного результата и выполнить все другие необходимые тесты!

Удачного клонирования! -Надеюсь, поможет :)

Новое в приложении

Update for current Android versions
minor bug fixes