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Es sind 18 Monate vergangen – nach den amerikanischen Präsidentschaftsvorwahlen – und – nach dem Tod von Agent Jack Bauers Frau. An diesem Samstagmorgen sind Präsident David Palmer und sein Sohn Keith beim Angeln. Dies muss jedoch schnell unterbrochen werden, als ein Anruf eingeht: Der Präsident muss sich sofort mit dem Regierungsstab treffen – es geht um die nationale Sicherheit. Nähere Einzelheiten sind ihm zu diesem Zeitpunkt noch nicht bekannt. Keith hat Verständnis für das Abbrechen des Ausflugs, ist aber dennoch traurig, da er seinen Vater seit seiner Scheidung nur noch sehr selten sieht.
Währenddessen besucht Jack Bauer, der seit dem Tod seiner Frau sehr zurückgezogen lebt, seine Tochter, die ihm den Tod ihrer Mutter immer noch nur schwer verzeihen kann. Sie weist ihn ab.
Kim arbeitet seit einiger Zeit bei Familie Matheson als Au-pair-Mädchen und ist deshalb auch von zuhause ausgezogen.

Jack schafft es, Eddie Grant, einer von Joseph Walds Leuten, ausfindig zu machen und schleust sich in seine Gang ein, um an Joseph Wald heranzukommen. Als Beweis seiner Treue präsentiert Jack den Kopf von Marshel Goren – den einzigen Zeugen in Walds Prozess. Dennoch wird er auf den nächsten Tag vertröstet, da heute eine wichtige Aufgabe auf Grant und seine Leute wartet.
Unterdessen kann Kim mit Megan aus dem Haus der Mathesons fliehen. Greg kann jedoch schnell anhand eines Peilsenders herausfinden, wo sich sein Zweitwagen befindet.
Präsident Palmer schafft es, in der Zwischenzeit die misstrauische Presse beruhigen. Einer der Reporter, Ron Wieland, glaubt seine Ausreden jedoch nicht und plant – mehr auf der Basis von Gerüchten als auf Beweisen – eine Pressekonferenz einzuberufen und seine Infos über den geplatzten Angelausflug des Präsidenten und der derzeitigen Situation preiszugeben. Palmer bittet deshalb um ein privates Gespräch mit Wieland.

Jack fährt mit Grant und seinen Leuten zu einer Telefonanlage irgendwo in Los Angeles. Grant & Co wollen diese sabotieren, damit sie sich als Telefontechniker ausgeben und so in die CTU kommen können. Jack ist einen Moment alleine und kann mit seinem Handy in der CTU anrufen – jedoch war Grant bereits erfolgreich – es ist kein Durchkommen. Da er dennoch dringend die CTU warnen muss, ruft er den Präsidenten an – kommt jedoch nur zu seiner Assistentin Lynn Kresge durch. Da Palmer sich zur Zeit in einer Presse-Konferenz befindet, berichtet er Lynn die Situation. Nach wenigen Sätzen muss er die Verbindung unterbrechen, da Grant zurückkommt.
Lynn Kresge erzählt NSA- Chef Rayburn von dem Anruf – dieser meint jedoch, dass es nicht nötig sei, Palmer von dem geplanten Attentat auf die CTU zu erzählen. Es hat höchste Priorität, dass Jack an Joseph Wald herankommt.
Rayburn ruft Tony in der CTU an und befielt ihm, die gesamten Daten zum nuklearen Anschlag auf den NSA- Server zu transferieren. Als Grund gibt er nur an, es sei eine Vorsichtsmassnahme. Als Michelle von Tony erfährt, was zu tun ist, fragt sie sich, warum die CTU die einzige Institution ist, bei der eine derartige Datensicherung vorgenommen werden soll…

Jack, Grant und seine Leute hören den Polizeifunk ab. Es gibt bereits mehr als ein Dutzend Tote. In der CTU herrscht Chaos. Tony und Michelle kümmern sich um die Verletzten. Eine davon ist Paula, die von der eingestürzten Treppe eingeklemmt und schwer verletzt wurde.
Kim und Megan verlassen derweil die CTU. Plötzlich bricht Megan zusammen. Ein Arzt schickt sie sofort ins Krankenhaus.
Im Operationshauptquartier des Präsidenten macht Lynn Rayburn schwere Vorwürfe. Dieser empfiehlt Lynn lieber Stillschweigen zu bewahren.
Ein Arzt vom ABC- Team erklärt Mason, dass die ersten Symptome in ca. 12 Stunden auftreten werden. Das Gespräch wird durch einen Anruf von Tony unterbrochen. Dieser meldet, es gibt bisher 19 Tote. Paula ist unter den Schwerverletzten. Nur sie kennt den Code zum entschlüsseln der Daten über den nuklearen Anschlag.
Grant befielt seinen Leuten, den Van abzufackeln und dann zu verschwinden. Darauf ruft er Joseph Wald an und erhält eine Adresse. Jack gibt sich nun als CTU Agent zu erkennen und befielt Grant, ihm die Adresse zu geben. Da dieser sich weigert, und auch die anderen etwas davon mitbekommen, kommt es zu einer Schießerei. Alle sterben – außer Jack. Dieser nimmt sich Grants Wagen und fährt weiter.

Jack schafft es, George Mason dazu zu bringen, ihn das Verhör von Nina Meyers übernehmen zu lassen, Palmer tauscht Informationen mit dem Botschafter eines Staates im Mittleren Osten aus, Tony verhört Reza, und Kim versucht Megan vor ihrem gewalttätigen Vater zu beschützen.
Ryan Chappelle bringt Nina Myers zur CTU, wo George Mason sie in Empfang nimmt. Sie will die entscheidenden Namen allerdings erst nennen, wenn sie eine Begnadigung vom Präsidenten erhält. Mason ist entsetzt, informiert aber Präsident Palmer von Ninas Forderung.
Palmer trifft sich mit dem Botschafter des Landes im Mittleren Osten, in dem der amerikanische Geheimdienst terroristische Ausbildungscamps von „The Second Wave“ geortet hatte. Der Abgeordnete versichert, energisch gegen die Terroristen in seinem Land vorgehen zu wollen. Allerdings sei dafür ein umfassender Informationsaustausch zwischen den Geheimdiensten beider Länder notwendig. Sicherheitschef Stanton rät Palmer dringend von einem solchen Austausch ab, da durch ihn die Tarnung amerikanischer Undercover-Agenten im Mittleren Osten auffliegen würde.

Beim Verhör geht Jack wenig zimperlich mit Nina um, Palmer erfährt von seiner Ex-Frau, dass irgendjemand heimlich das gesamte Militär aus Los Angeles abziehen lässt, Kim entführt Megan aus dem Krankenhaus, und Reza lenkt Tonys Verdacht auf jemand anderes.
Palmers Ex-Frau Sherry taucht ungebeten in der Kommandozentrale auf. Obwohl er nicht gerade erfreut ist über ihren Anblick, muss Palmer zugeben, dass sie wichtige Informationen für ihn hat. Sie erzählt ihm, dass irgendjemand angeordnet habe, das gesamte militärische Personal solle sich aus dem Großraum Los Angeles zurückziehen. Palmer ist schockiert, wer könnte das hinter seinem Rücken angeordnet haben? Sherry will nun genau wissen, was los ist. Außerdem bietet sie ihm ihre weiteren Dienste als Informantin an, aber kann Präsident Palmer ihr wirklich trauen?
Kim tüftelt mit ihrem Freund Miguel einen waghalsigen Plan aus, um den gewalttätigen Gary auszutricksen und Megan aus dem Krankenhaus zu entführen. Alles scheint so weit ganz gut zu laufen, bis Gary die Flüchtigen auf dem Parkplatz des Krankenhauses stellt.

Für Jack und Nina läuft nicht alles nach Plan in Visalia, Palmers Leute haben große Schwierigkeiten, plötzlich Sherry Palmer in ihren eigenen Reihen zu akzeptieren, Tony bringt Reza und Bob Warner zur CTU, und auf Kim und Miguel wartet eine furchtbare Überraschung…
Jack schickt Nina als Lockvogel in Mamud Faheens Versteck. Sie ist verwanzt und mit einer Mikrokamera ausgestattet, doch als während des Gesprächs mit dem Terroristen plötzlich das Bild der Videokamera ausfällt, lässt Jack Faheens Aufenthaltsort stürmen. Als er selbst den Raum betritt, findet er Faheen bewusstlos auf dem Fußboden vor – Nina ist spurlos verschwunden…
Tony Almeida bringt Reza Naiyeer, seine Verlobte Marie Warner und deren Vater Bob für weitere Verhöre ins CTU-Hauptquartier. Immer noch ist unklar, ob nun Reza oder Bob Kontakte zu dem gesuchten Terroristen Syed Ali hat. Bobs älteste Tochter Kate sucht indessen verzweifelt nach Beweisen, die ihren Vater entlasten könnten.
Als George Mason spürt, dass ihm die Strahlenkrankheit immer mehr zu schaffen macht, zitiert er seinen Sohn John zur CTU, um alles Notwendige vor seinem Tod zu regeln. Da John jedoch zwei Jahre nichts von seinem Vater gehört hat, verspürt er keinerlei Lust, ihn wiederzusehen. Also muss Mason zu drastischen Mitteln greifen.

Kim wird wegen Mordes verhaftet, Nina hilft Jack dabei, wichtige Informationen aus Faheen herauszubekommen, die LkW-Fahrer, die die Atombombe geladen haben, geraten in Schwierigkeiten, und Kate untersucht die Dateien auf dem Computer ihres Vaters.
Kim und Miguel werden wegen Mordes an Megans Mutter Carla verhaftet und zurück nach L.A. gebracht. In dem verzweifelten Wunsch, Megan von ihrem gewalttätigen Vater und von L.A. fernzuhalten, beruft Kim sich auf Jack bei der CTU. Da aber Jack noch im Einsatz ist, kann ihre Geschichte nicht verifiziert werden.
Jack, dem es gelungen ist, die flüchtige Nina zu stellen, kehrt mit ihr und Mamud Faheen nach L.A. zurück. Doch Faheen weigert sich vehement, irgendetwas auszusagen. Schließlich schlägt Nina vor, ihn auf arabisch zu verhören. Zögernd nimmt Jack den Vorschlag an. Tatsächlich bringt Nina Faheen zum Reden, dann jedoch tötet sie ihn mitten im Gespräch. Jetzt behauptet Nina, die einzige zu sein, die weiß, wo genau die Bombe hochgehen soll…

Jacks und Ninas Flugzeug stürzt ab, Mason nutzt einen Trick, um herauszubekommen, ob es Reza, der ihn anlügt oder Bob, und Präsident Palmer überlegt, wie er angemessen auf Wielands Nachrichtensendung reagieren soll.
Nachdem Ron Wieland in seiner Sendung seine komplette Geschichte öffentlich gemacht hat, steht Präsident Palmer unter Handlungsdruck: Er muss irgendwie darauf reagieren. Sherry rät ihm dazu, die Öffentlichkeit mit der Wahrheit zu konfrontieren…
Das Flugzeug, in dem Jack, Nina und die anderen Agenten zurück nach L.A. fliegen, wird in der Luft angeschossen und gerät ins Trudeln. Dem Piloten gelingt es nicht, die Maschine wieder in seine Gewalt zu bekommen. Es kommt zu einer Bruchlandung, die Jack und Nina jedoch wie durch ein Wunder nur leicht verletzt überstehen. Kurz darauf erscheint bereits eine Rettungsmannschaft, allerdings entpuppt die sich als militärisches Killerkommando, das auf die beiden angesetzt wurde. Im letzten Augenblick gelingt den beiden die Flucht, allerdings kommt Nina an eine Waffe, mit der sie Jack in Schach hält. Dann ruft sie bei Präsident Palmer an und nennt ihren Preis für die Information, wo die Bombe in L.A. gezündet werden soll: Sie will dafür begnadet werden, dass sie Jack Bauer erschießt!

Palmer hilft Jack, sich aus Ninas Gewalt zu befreien, Jack findet heraus, dass die Killerkommandos, die auf ihn angesetzt wurden, von der NSA geschickt wurden, Reza hilft den CTU-Agenten dabei, Bobs Computer-Dateien zu durchsuchen.
Während Palmer der Presse berichtet, die Bedrohung durch die Terroristen sei nicht der Rede wert, wird Jack immer noch von Nina festgehalten. Gerade als sie Jack eiskalt erschießen will, wird sie selbst von einem CTU-Scharfschützen in die Hand getroffen und außer Gefecht gesetzt. Jack hingegen macht sich auf, um zu der von ihr angegebenen Adresse zu gelangen und dort Syed Ali festzunehmen. Auf dem Weg zum Hubschrauber fällt ihm etwas Wichtiges auf: Einer der toten Soldaten, Mitglied des Killerkommandos, das ihn nach Absturz des Flugzeugs in Empfang nahm, trägt eine sehr auffällige Tätowierung. Später soll er erfahren, dass es sich bei dem Mann um einen Kämpfer der amerikanischen Spezialeinheit „Coral Snake“ handelt. Die Gruppe wird von einem gewissen Colonel Ron Samuels befehligt und von der NSA finanziert. Als Palmer NSA-Chef Roger Stanton zur Rede stellt, bestreitet der jeden Kontakt zu Colonel Samuels. Doch ausgerechnet Sherry Palmer bringt den Präsidenten darauf, wie Samuels und Stanton Informationen hätten austauschen können: über OPCOM, einem geheimen Nachrichtenkanal, der kürzlich von Stanton wieder reaktiviert wurde. Durch diesen wichtigen Hinweis gewinnt Sherry wieder das vollste Vertrauen ihres Ex-Mannes. Zu Recht?

Jack und Kate suchen in der Moschee nach Syed Ali, Mason und Tony erfahren, dass Marie Reza und die CTU-Agenten erschossen hat, Kim versteckt sich in den Wäldern vor der Polizei, und Palmer verhaftet Stanton und überlässt sein Verhör einem Folterspezialisten.
Jack eilt mit Kate zu der Moschee, in der man Syed Ali meint lokalisiert zu haben. Da nur Kate den Mann eindeutig identifizieren kann, erklärt sie sich bereit, als Muslimin verkleidet das Gebäude zu betreten. Aber sie kann ihn trotz aller Anstrengung nicht erkennen. Als man schließlich beim Sturm auf die Moschee einen Mann findet, der sich selbst verbrannt hat, glaubt man zunächst, man habe Ali gefunden. Doch Jack hat so seine berechtigten Zweifel.
Die flüchtige Marie erhält von Syed Ali den Auftrag, den Zünder der Bombe sicherzustellen. Er befindet sich im Arbeitsspind eines gewissen Marko Kathami. Marie erledigt den Auftrag auf ihre Weise.
Palmer lässt NSA-Chef Stanton inhaftieren und konfrontiert ihn mit seinem Wissen über Stantons Verbindung zu Colonel Samuels. Gleichzeitig bietet er ihm einen Handel an: Hilft Stanton bei der Suche nach der Bombe, erhält er völlige Straffreiheit. Andernfalls muss er mit lebenslänglicher Freiheitsstrafe oder sogar Todesstrafe rechnen. Als Stanton trotzdem die Mitarbeit verweigert, überlässt Palmer dem Secret-Service-Agenten Simmons das Verhör. Der versucht den Leiter der NSA mit Elektroschocks zum Reden zu bringen.

Jack befragt Syed Ali, Kate erfährt, dass ihre Schwester eine Terroristin sein soll, Lynne entdeckt Sherrys geheime Verbindung zu Stanton, und Kim wird von einem zwielichtigen Jäger aus der Falle befreit.
Syed Ali hält sich im Erdgeschoss der Moschee versteckt. Kurz bevor er dort von den CTU-Agenten aufgespürt wird, ruft er Marie an, um ihr mitzuteilen, dass sie nun allein den Plan durchführen muss. Dann überwältigt Jack den Terroristen und verhindert, dass er sich – wie bereits zuvor seine Handlanger – mit Zyanid das Leben nimmt. Die Spezialisten im CTU untersuchen ein Stück Papier aus Alis verbrannter Kleidung und entziffern einen Code aus Zahlen und Buchstaben. Eine Untersuchung von Alis Handy ergibt außerdem, dass er zuletzt Marie angerufen hat. Kate ist vollkommen entsetzt und kann einfach nicht glauben, dass ihre Schwester mit der Sache zu tun haben soll. Trotzdem erklärt sich dazu bereit, sie anzurufen, damit Jack versuchen kann, Marie per Funkpeilung zu orten. Aber Marie lässt sich nicht so leicht austricksen. Zwar gibt sie Kate gegenüber die Morde an Reza und den CTU-Agenten zu, doch bevor sie geortet werden kann, wirft sie ihr Handy aus dem Autofenster.

Jack erreicht endlich das Flughafengelände, auf dem die Bombe deponiert ist, aber sie ist nicht so einfach zu finden, Kim sucht Zuflucht bei einem merkwürdigen Mann und Stanton gibt endlich sein Geheimnis preis …

Jack bekommt endlich Marie zu fassen und quetscht sie wegen der Bombe aus, der todkranke Mason verlässt die CTU, Palmer verdächtigt Sherry, mit Stanton gemeinsame Sache zu machen, und Kim findet heraus, dass McRea sie hereingelegt hat.
Nachdem Jack in dem Flugzeug nur eine Attrappe der Bombe sicherstellen konnte, lässt er Omar verhören. Doch aus ihm ist nichts herauszubekommen, weil er anscheinend wirklich nicht mehr weiß. Marie, die einzige, die ihn jetzt noch zur Bombe führen könnte, ist weiterhin flüchtig. Zudem gibt ihm der Tod der Coral-Snake-Kämpfer weiterhin Rätsel auf. Jack vermutet, dass sie von ihrem eigenen Truppenführer erschossen wurden. Als Tony Almeida den Mann identifizieren kann, wird alles klar: Es handelt sich um den Profikiller Jonathan Wallace.
Ausgerechnet Kate ist es, die ihre Schwester Marie schließlich auf dem Flughafen ausfindig macht. Als sie ihr folgt, wird sie bald von Marie überwältigt, die Kate mit Waffengewalt dazu bringen will, ihr ihren CTU-Ausweis auszuhändigen. Als Kate sich weigert, will Marie abdrücken. Aber Jack kommt ihr zuvor. Er verwundet Marie, und beginnt sofort mit dem Verhör, denn ihm bleibt nicht mehr viel Zeit…

Kamikaze-Aktion für Jack: Er will die Atom-Bombe in der Wüste detonieren lassen. Als Kim von seinem Plan erfährt, reagiert sie völlig kopflos, und die CTU sichert Material, dem zu Folge drei Länder im Nahen Osten von dem geplanten Terroranschlag gewusst haben sollen. Bedeutet das Krieg?
Die Nukleartechniker, die mit der Entschärfung der Bombe betraut wurden, müssen aufgeben, denn sie wurde so konstruiert, dass jede Manipulation zu einer sofortigen Detonation führen würde. Es gibt nur noch eine Möglichkeit, die große Katastrophe zu verhindern: Der Sprengsatz muss mit einem Flugzeug so weit wie möglich aus dem Stadtgebiet entfernt werden – dazu bleiben jedoch nur noch 55 Minuten.
Präsident Palmer beruft sofort eine Krisensitzung ein, auf der darüber entschieden werden soll, ob die Bombe in den Pazifik oder in die Wüste befördert werden soll. Schließlich entscheidet man, dass es besser ist, wenn der Nuklear-Sprengsatz in der Mojave-Wüste hochgeht. Bei der wenigen Zeit, die dem Piloten bleibt, um die Bombe in die Wüste zu bringen, steht fest, dass es sich um eine Todes-Mission handelt. Daraufhin besteht Jack darauf, das Flugzeug selbst zu fliegen.

Jack und Michelle versuchen die Echtheit des Materials, das die Involvierung dreier Nahost-Staaten in den geplanten Terroranschlag vorgibt, zu überprüfen, bevor Präsident Palmer den Dritten Weltkrieg anzettelt, und Kim wird in einen Überfall auf einen Lebensmittelladen hineingezogen.
Während Tony Almeida und die Techniker der CTU von der Echtheit des Beweismaterials überzeugt sind, das die Involvierung dreier Nahost-Staaten in den geplanten Terroranschlag auf L.A. nahe legt, hegt Michelle Dessler ernsthafte Zweifel. Nach einem erneuten Gespräch mit Syed Ali, ist auch Jack davon überzeugt, dass es sich bei den Aufnahmen um Fälschungen handelt. Als Ali kurze Zeit später von einem Heckenschützen ermordet wird, bestätigt das Jacks Vermutung noch. Also versucht er Präsident Palmer vor übereilten Handlungen zu warnen. Doch der bereitet schon mit seinem Generalstab einen militärischen Gegenschlag im Nahen Osten vor. Als Palmer nach dem Gespräch mit Jack zögert, den Einsatzbefehl für die militärische Maßnahme zu geben, wird er von seinen Beratern mächtig unter Druck gesetzt. Jede Verzögerung des Angriffs würde dem Gegner mehr Zeit für die Vorbereitung von Gegenmaßnahmen lassen und so die Zahl der potentiellen Opfer auf amerikanischer Seite in die Höhe schnellen lassen.

Jack will Kate dem Mörder von Syed Ali ausliefern, Kim befindet sich in der Gewalt eines Geiselnehmers, und Präsident Palmer weigert sich, die Kriegspläne seines Generalstabs voranzutreiben, bis Jack ihm nicht eindeutige Beweise dafür liefern kann, dass die drei unter Verdacht stehenden Nahost-Staaten wirklich in die geplante Terroraktion gegen die USA verwickelt waren.
Mit Unterstützung von Yusuf Aula bringt Jack Kate Warner zu dem mit dem Mörder von Syed Ali verabredeten Treffpunkt, um sie gegen wichtige Beweise, die den Dritten Weltkrieg verhindern könnten, auszutauschen. Der Attentäter entpuppt sich als Captain Wallace, Kommandant der Coral-Snake-Einheit, die Jake und Nina nach ihrem Flugzeugabsturz hätten liquidieren sollen. Wallace erklärt, dass er im Auftrag von Hintermännern gearbeitet habe, denen aus geschäftlichen Gründen daran gelegen sei, die USA in einen Krieg mit dem Nahen Osten zu führen. Nur so könnten sie sich die dortigen Ölminen sichern. Da Wallace nach Erledigung seines Jobs nur noch ein Sicherheitsrisiko für seine Auftraggeber darstellt, versuchen sie nun ihn auszuschalten. Also will er unentdeckt ins Ausland fliehen. Dazu braucht er Kate Warner, die wegen der CIA-Verbindungen ihres Vaters jederzeit unregistrierte Flüge ins Ausland arrangieren kann. Obwohl Jack sich der Gefahr für Kate bewusst ist, geht er auf Wallaces Forderungen ein. Als Jack, Yusuf, Wallace und Kate das Gebäude verlassen wollen, werden sie von Unbekannten unter Beschuss genommen…

Mit Müh und Not entkommen Jack, Yusuf, Wallace und Kate den auf sie angesetzten Killern, Kim landet schon wieder in den Händen der Polizei, und Palmer muss sich um anti-muslimische Ausschreitungen in Georgia kümmern.
Als Jack, Wallace, Yusuf und Kate unter Beschuss eines Killerkommandos geraten, ruft Jack bei Michelle im CTU an. Da sie Einsicht in Satellitenaufnahmen der Umgebung hat, kann sie Jack in etwa sagen, um wie viele Angreifer es sich handelt und wo genau sie sich befinden. Mit ihrer Hilfe gelingt es Jack und den anderen, den Killern zu entkommen. Allerdings wird Wallace auf der Flucht schwer verletzt. Die anderen bringen ihn in die Notaufnahme, doch er stirbt nur kurze Zeit später. Vorher konnte er Jack zwar noch sagen, dass sich die Quellen-Dateien für die gefälschten Zypern-Aufnahmen auf einem Memory-Chip befinden, allerdings reichte die Zeit nicht mehr, Jack mitzuteilen, wo sich der Chip befindet. Doch als der einen Blick auf Wallaces Röntgenbild wirft, kommt ihm eine Idee, und er greift zum Skalpell…

Als Jack den Chip an sich bringt, der beweist, dass die Nahost-Staaten nicht in den Terrorakt gegen die USA verwickelt sind, begibt er sich in höchste Lebensgefahr. Da Präsident Palmer den Militärschlag gegen den Nahen Osten nicht bewilligt, soll er abgesetzt werden.
Jack hat aus Jonathan Wallaces Körper den Chip herausgeholt, der beweisen soll, dass die unter Verdacht geratenen Nahost Staaten nicht an dem Terrorakt gegen die USA beteiligt waren. Aber Yusuf Auda stellt schnell fest, dass der Chip mit einem Peilsender versehen ist, der die Killer auf Wallaces Spur hielt. Es gelingt Yusuf, den Sender vom Chip zu trennen, danach nimmt Jack den Peilsender an sich, um die Verfolger abzulenken. Yusuf und Kate sollen inzwischen zu einem sicheren Treffpunkt aufbrechen, wo sie wieder auf Jack treffen wollen. Taucht Jack nicht auf, sollen sie den Chip sicher zum CTU bringen. Schon bald gerät Jack in die Hände der Terroristen, die unter allen Umständen den Memory-Chip an sich bringen wollen. Um ihr Ziel zu erreichen, foltern sie Jack so lange, bis er leblos zusammenbricht…

Dank der Hilfe eines mitleidigen Arztes gelingt Jack die Flucht aus der Kommando-Zentrale der Verschwörer, Kate versucht verzweifelt, den Computer-Chip von den Schlägern zurück zu bekommen, die Yusuf und sie angegriffen haben, und Palmer hegt einen Verdacht gegen seinen Vize-Präsidenten. Als die Auftragskiller, die auf Jack angesetzt wurden, um ihm den Mikro-Chip abzujagen, feststellen, dass er tot ist, zwingen sie den Arzt Dr. Spire dazu, ihr Opfer wiederzubeleben. Schließlich wissen sie immer noch nicht, wo der Chip sich befindet und bekommen deshalb reichlich Druck von ihrem Auftraggeber. Als Jack wieder zu Bewusstsein kommt, schafft er es, sich die Unterstützung des Arztes zu sichern. Gemeinsam gelingt es ihnen, die Gangster zu überwältigen. Jack macht sich sofort auf den Weg zu dem mit Yusuf und Kate ausgemachten Treffpunkt. Dort findet er nur noch den schwer verletzten Yusuf, der ihm sagt, dass Kate von drei rassistischen Schlägern in ihr Haus verschleppt wurde. Als Jack endlich das Haus der Warners erreicht, kommt er gerade rechtzeitig, um zu verhindern, dass Kate von den drei Rassisten ermordet wird. Einem von ihnen gelingt es jedoch, sich im Haus zu verschanzen. Er droht, den Chip zu zerstören, wenn Jack ihn nicht in Ruhe ziehen lässt. Während Tony Almeida und Michelle Dessler verzweifelt versuchen, den Kontakt zu Jack zu halten und ihm vom Büro des CTU bestmögliche Hilfestellung zu leisten, taucht plötzlich Ryan Chapelle bei der CTU auf. Er gibt ihnen den Befehl, sofort alle Verbindungen zu Bauer zu kappen…

Palmer muss sich einer Anhörung stellen, bei der entschieden werden soll, ob er im Amt bleiben darf, Jack verfolgt eine neue Spur, und Kim kehrt zum Haus der Mathesons zurück, um ihre Sachen abzuholen.

Im Apartment des Computerhackers Alex Hewitt stößt Jack auf Sherry Palmer und ihren Bodyguard Bryce. Es gelingt Jack, den bewaffneten Bryce zu überwältigen und Sherry in seine Gewalt zu bringen. Doch sie weigert sich, ihm zu sagen, was sie in Hewitts Wohnung macht. Erst als Jack auch Hewitt in einem geheimen Raum ausfindig macht, schafft er es durch geschicktes Taktieren, etwas aus den beiden herauszubekommen: Alex Hewitt gibt zu, dass er im Auftrag von Sherry Palmer die Zypern-Aufnahmen gefälscht hat. Sherry hingegen gesteht, dass sie sich mit Kingsley zusammengetan hat, um ihren Ex-Mann zu stürzen. Da sie jedoch nicht wolle, dass die USA aus falschen Gründen einen Krieg anzetteln, verspricht sie, mit Jack zusammenzuarbeiten. Allerdings kommt es wenig später zu einem Tumult, in dessen Verlauf Sherry verletzt wird und Hewitt flieht…
Unterdessen hält der neue Präsident Prescott David Palmer in einem Raum seines Hauptquartiers in Sicherheitsverwahrung. Allerdings besorgt ihm ein loyaler Secret-Service-Mann ein Satellitentelefon, mit dem der Ex-Präsident Tony Almeida und Jack Bauer anruft, um ihnen mitzuteilen, wie wichtig es ist, dass sie die entsprechenden Beweise finden, um den nun drohenden Krieg zu verhindern…

Als Jack Bauer den flüchtigen Computer-Hacker Alex Hewitt verfolgt, um ihn zu einer Aussage zu bewegen, stürzt dieser vom Dach einer Lagerhalle und wird dabei lebensgefährlich verletzt. Jetzt ist Jack ausschließlich auf die Kooperation von Sherry Palmer angewiesen.
Red Hammond von der Division schöpft Verdacht, als Chapelle urplötzlich verschwindet. Er lässt das CTU-Gebäude durchsuchen und wird bald fündig. Sofort lässt er Tony verhaften und versagt Jack jede weitere Hilfe.
Tatsächlich erklärt sich jedoch Sherry Palmer dazu bereit, ein Treffen mit Kingsley zu arrangieren und ihn dabei in eine Falle zu locken. Kingsley verabredet sich zwar mit ihr, riecht aber den Braten und ordert an, dass Sherry das Meeting auf keinen Fall lebend verlassen darf…
Als Jack Sherry zu der Verabredung mit Kingsley fährt, wird er plötzlich von heftigen Herzschmerzen übermannt und lenkt den Wagen in den Los Angeles River…

Sherry kann sich aus dem im Fluss gelandeten Autowrack befreien und will zunächst ohne Jack fliehen. Dann besinnt sie sich jedoch eines Besseren und rettet auch ihn aus den Fluten. Schon kurze Zeit später befinden sie sich wieder auf dem Weg zu dem mit Kingsley vereinbarten Treffen. Jack befestigt eine Wanze an Sherrys Bluse, so dass ihr Gespräch mit Kingsley direkt ins Weiße Haus übertragen werden kann. Dort hat Präsident Prescott längst amerikanische Bomber in den Nahen Osten geschickt, die ihr Ziel in weniger als einer Stunde erreichen sollen. Da Novick mittlerweile doch von Jacks Mission überzeugt ist, gibt er Chapelle die Anweisung Jack jede Unterstützung zu liefern, die er braucht. Also setzt der kurzerhand Tony und Michelle wieder ins Amt und gewährt ihnen Straffreiheit für ihre Vergehen, denn nun ist er auf ihre Mithilfe angewiesen.
Unterdessen trifft Sherry auf Kingsley. Der hat einen Scharfschützen auf sie angesetzt, der sie sofort töten soll, sobald Kingsley aus ihr herausbekommen hat, wo sich der Computerexperte Hewitt befindet. Tatsächlich schafft Sherry es, Kingsley zum Sprechen zu bringen, aber dann kommt es zu einer verhängnisvollen Schießerei…