CEToolbox-applikationen er en lommeregner til kapillærelektroforese. Det sigter mod at tilvejebringe adskillige informationer om adskillelse af forbindelser som den hydrodynamiske injektion, volumenet af kapillæren, injektionspropens længde eller mængden af injiceret analyt. Applikationen fungerer med enhver type CE-system.
CEToolbox er et gratis program, udviklet med Java og frigivet under Apache-licensen. Kildekoden er tilgængelig på GitHub-webstedet. Yderligere information kan fås på https://cetoolbox.github.io.