Bakterier almindelig substantiv bakterier, singulær bakterie) udgør et stort domæne af prokaryote mikroorganismer. Typisk nogle få mikrometer lange har bakterier en række former, der spænder fra kugler til stænger og spiraler. Bakterier var blandt de første livsformer, der skulle ses på Jorden og er til stede i de fleste af dets levesteder. Bakterier befinder sig i jord, vand, sure varme kilder, radioaktivt affald og de dybe dele af jordskorpen. Bakterier lever også i symbiotiske og parasitære forhold med planter og dyr. De fleste bakterier er ikke blevet karakteriseret, og kun omkring halvdelen af bakteriefilen har arter, der kan dyrkes i laboratoriet. Undersøgelsen af bakterier er kendt som bakteriologi, en gren af mikrobiologi.
Der er typisk 40 millioner bakterieceller i et gram jord og en million bakterieceller i en milliliter ferskvand. Der er ca. 5 × 1030 bakterier på jorden, der danner en biomasse, der overstiger det for alle planter og dyr. Bakterier er afgørende i mange stadier af næringscyklusen ved at genvinde næringsstoffer som fiksering af nitrogen fra atmosfæren. Næringscyklusen omfatter nedbrydning af døde kroppe, og bakterier er ansvarlige for putrefaction-scenen i denne proces. I de biologiske samfund, der omgiver hydrotermiske udluftninger og koldt sigt, giver ekstremfibile bakterier de nødvendige næringsstoffer til at opretholde livet ved at omdanne opløste forbindelser, såsom hydrogensulfid og metan, til energi. I marts 2013 blev data offentliggjort af forskere i oktober 2012 offentliggjort. Det blev foreslået, at bakterier trives i Mariana Trench, som med en dybde på op til 11 kilometer er den dybeste kendte del af oceanerne. Andre forskere rapporterede beslægtede undersøgelser om, at mikrober trives inde i klipper op til 580 meter under havbunden under 2,6 kilometer hav ud for kysten af det nordvestlige USA. Ifølge en af forskerne, "Du kan finde mikrober overalt - de er yderst tilpasselige til forholdene og overlever hvor de end er.