PHREEQC plus
+۵۰
بارگیری‌ها
مناسب برای همه
info
درباره این برنامه
توضیحات و استفاده:
PHREEQC (نویسندگان: David L. Parkhurst، C.A.J. Appelo) یک کد ژئوشیمیایی مورد علاقه است که برای مدل‌سازی گونه‌ها استفاده می‌شود. برنامه ما به دلیل ادغام MOPAC (نویسنده: James JP Stewart)، CHEMSOL (نویسندگان: Jan Florián، Arieh Warshel)، XTB (نویسندگان: C. Bannwarth، E. Caldeweyher، S. Ehlert)، تجربه قابلیت های گسترده را برای کاربران به ارمغان می آورد. A. Hansen, P. Pracht, J. Seibert, S. Spicher, S. Grimme, P. Shushkov, M. Stahn, H. Neugebauer, J.-M. Mewes, V. Asgeirsson, C. Bauer, J. Koopman ) و DFTB+ (نویسندگان: B. Hourahine, B. Aradi, V. Blum, F. Bonafé, A. Buccheri, C. Camacho, C. Cevallos, M. Y. Deshaye, T. Dumitrică, A. Dominguez, S. Ehlert, M الستنر، تی. ون در هاید، جی. هرمان، اس. ایرل، جی. جی. کرانز، سی. کوهلر، ت. کوالچیک، تی. کوبا، آی. اس. لی، وی. لوتسکر، آر. Negre، T. A. Niehaus، A. M. N. Niklasson، A. J. Page، A. Pecchia، G. Penazzi، M. P. Persson، J. Řezáč، C. G. Sánchez، M. Sternberg، M. Stöhr، F. Stuckenberg، A. Wkatchenko، V. یو، تی. فراونهایم). هر گونه سفارشی که در پایگاه داده های داخلی وجود ندارد را می توان در برنامه محاسبه کرد و نتایج را در مدل مورد استفاده قرار داد (به عبارت دیگر، یک پایگاه داده جدید و خاص می تواند در هر اجرا به طور جداگانه ساخته شود). علاوه بر این، بسته فعلی شامل پایگاه‌های داده غیر متعارف متعددی است که از داده‌های تجربی و پیش‌بینی‌شده/محاسبه‌شده از پایگاه‌های داده بزرگ مانند CHNOSZ، ModelSEED، کتابخانه Alexandria، KEGG و دیگر منابع تحت اللفظی استفاده می‌کند.
به جز حالت تعادل، کد از مدل‌سازی سینتیک نیز پشتیبانی می‌کند، که برای آن بلوک‌های کلیدواژه مربوطه می‌توانند به طور خودکار بر اساس محاسبات حالت انتقالی قبلی تولید شوند. به عنوان جایگزینی برای سیستم‌های غیرآبی، مدل‌سازی گونه‌بندی FastChem Cond نیز موجود است. تمام ویژگی های برنامه به صورت آفلاین در دسترس هستند.
هشدار در مورد دقت محاسباتی: MOPAC یک سازش معقول بین قدرت دستگاه/زمان محاسبه و دقت پیش‌بینی برای انواع زیادی از انواع ترکیبات از مولکول‌های کوچک تا متوسط را نشان می‌دهد. با این حال، دقت محدود است. به منظور تنظیم انرژی‌های حاصل، مدل COSMO از MOPAC و همچنین مدل‌های حل‌پذیری CHEMSOL ادغام شده‌اند، اگرچه CHEMSOL در ابتدا قصد دارد در ارتباط با ساختارها و بارهای محاسبه‌شده در سطوح بالاتر تئوری استفاده شود. بنابراین، تمام ثابت‌های تعادل و نرخ محاسبه‌شده باید با احتیاط رفتار شود و در مواردی که داده‌های تجربی (از پایگاه‌های داده گنجانده شده) در دسترس نیست، به عنوان یک تخمین تقریبی در نظر گرفته شوند. ادغام XTB و DFTB+ تاکنون آزمایشی است.
مهم !!!
اگرچه این برنامه از کدها و منابع منبع باز تشکیل شده است، مجوزهای برخی مؤلفه ها از کاربران می خواهد که هنگام انتشار نتایج به منابع اصلی استناد کنند. لطفاً تمام اطلاعات مجوز را در زیر دکمه‌های «مجوز» و «درباره برنامه» بررسی کنید.
تمامی کاربران برنامه PHREEQC PLUS با دانلود، نصب و استفاده از آن، تمامی شرایط مجوز تک تک اجزای نرم افزار را رعایت کرده و مسئولیت نگهداری آنها را بر عهده می گیرند.
کد منبع برنامه: https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus
مخاطب:
گردآوری کد منبع برای اندروید و همچنین توسعه برنامه اندروید توسط Alan Liška (alan.liska@jh-inst.cas.cz) و Veronika Růžičková (sucha.ver@gmail.com)، موسسه J. Heyrovský Physical Chemistry of the CAS, v.v.i., Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8, جمهوری چک.
وب سایت: http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm
لیست نرم افزارهای شخص ثالث مورد استفاده:
ACPDFVIEW، ANDROID SHELL، BLAS، CHEMSOL، DFTB+، DFTD4، EIGEN3، FASTCHEM Cond، GMP، GRAPHVIEW، LAPACK، MCTC-LIB، MOPAC، MSTORE، MULTICHARGE، OPENBABEL، OPENMOBLAS، OPSH، OPENMOPLAS, OPSH QCXMS، S-DFTD3، STDA، TBLITE، TEST-DRIVE، TOML-F، TRANSPOSE، X11-BASIC، XTB، XTB4STDA.
اطلاعات بیشتر در مورد مجوزها و مراجع - لطفاً به اطلاعات مجوز در داخل برنامه مراجعه کنید.
PHREEQC (نویسندگان: David L. Parkhurst، C.A.J. Appelo) یک کد ژئوشیمیایی مورد علاقه است که برای مدل‌سازی گونه‌ها استفاده می‌شود. برنامه ما به دلیل ادغام MOPAC (نویسنده: James JP Stewart)، CHEMSOL (نویسندگان: Jan Florián، Arieh Warshel)، XTB (نویسندگان: C. Bannwarth، E. Caldeweyher، S. Ehlert)، تجربه قابلیت های گسترده را برای کاربران به ارمغان می آورد. A. Hansen, P. Pracht, J. Seibert, S. Spicher, S. Grimme, P. Shushkov, M. Stahn, H. Neugebauer, J.-M. Mewes, V. Asgeirsson, C. Bauer, J. Koopman ) و DFTB+ (نویسندگان: B. Hourahine, B. Aradi, V. Blum, F. Bonafé, A. Buccheri, C. Camacho, C. Cevallos, M. Y. Deshaye, T. Dumitrică, A. Dominguez, S. Ehlert, M الستنر، تی. ون در هاید، جی. هرمان، اس. ایرل، جی. جی. کرانز، سی. کوهلر، ت. کوالچیک، تی. کوبا، آی. اس. لی، وی. لوتسکر، آر. Negre، T. A. Niehaus، A. M. N. Niklasson، A. J. Page، A. Pecchia، G. Penazzi، M. P. Persson، J. Řezáč، C. G. Sánchez، M. Sternberg، M. Stöhr، F. Stuckenberg، A. Wkatchenko، V. یو، تی. فراونهایم). هر گونه سفارشی که در پایگاه داده های داخلی وجود ندارد را می توان در برنامه محاسبه کرد و نتایج را در مدل مورد استفاده قرار داد (به عبارت دیگر، یک پایگاه داده جدید و خاص می تواند در هر اجرا به طور جداگانه ساخته شود). علاوه بر این، بسته فعلی شامل پایگاه‌های داده غیر متعارف متعددی است که از داده‌های تجربی و پیش‌بینی‌شده/محاسبه‌شده از پایگاه‌های داده بزرگ مانند CHNOSZ، ModelSEED، کتابخانه Alexandria، KEGG و دیگر منابع تحت اللفظی استفاده می‌کند.
به جز حالت تعادل، کد از مدل‌سازی سینتیک نیز پشتیبانی می‌کند، که برای آن بلوک‌های کلیدواژه مربوطه می‌توانند به طور خودکار بر اساس محاسبات حالت انتقالی قبلی تولید شوند. به عنوان جایگزینی برای سیستم‌های غیرآبی، مدل‌سازی گونه‌بندی FastChem Cond نیز موجود است. تمام ویژگی های برنامه به صورت آفلاین در دسترس هستند.
هشدار در مورد دقت محاسباتی: MOPAC یک سازش معقول بین قدرت دستگاه/زمان محاسبه و دقت پیش‌بینی برای انواع زیادی از انواع ترکیبات از مولکول‌های کوچک تا متوسط را نشان می‌دهد. با این حال، دقت محدود است. به منظور تنظیم انرژی‌های حاصل، مدل COSMO از MOPAC و همچنین مدل‌های حل‌پذیری CHEMSOL ادغام شده‌اند، اگرچه CHEMSOL در ابتدا قصد دارد در ارتباط با ساختارها و بارهای محاسبه‌شده در سطوح بالاتر تئوری استفاده شود. بنابراین، تمام ثابت‌های تعادل و نرخ محاسبه‌شده باید با احتیاط رفتار شود و در مواردی که داده‌های تجربی (از پایگاه‌های داده گنجانده شده) در دسترس نیست، به عنوان یک تخمین تقریبی در نظر گرفته شوند. ادغام XTB و DFTB+ تاکنون آزمایشی است.
مهم !!!
اگرچه این برنامه از کدها و منابع منبع باز تشکیل شده است، مجوزهای برخی مؤلفه ها از کاربران می خواهد که هنگام انتشار نتایج به منابع اصلی استناد کنند. لطفاً تمام اطلاعات مجوز را در زیر دکمه‌های «مجوز» و «درباره برنامه» بررسی کنید.
تمامی کاربران برنامه PHREEQC PLUS با دانلود، نصب و استفاده از آن، تمامی شرایط مجوز تک تک اجزای نرم افزار را رعایت کرده و مسئولیت نگهداری آنها را بر عهده می گیرند.
کد منبع برنامه: https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus
مخاطب:
گردآوری کد منبع برای اندروید و همچنین توسعه برنامه اندروید توسط Alan Liška (alan.liska@jh-inst.cas.cz) و Veronika Růžičková (sucha.ver@gmail.com)، موسسه J. Heyrovský Physical Chemistry of the CAS, v.v.i., Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8, جمهوری چک.
وب سایت: http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm
لیست نرم افزارهای شخص ثالث مورد استفاده:
ACPDFVIEW، ANDROID SHELL، BLAS، CHEMSOL، DFTB+، DFTD4، EIGEN3، FASTCHEM Cond، GMP، GRAPHVIEW، LAPACK، MCTC-LIB، MOPAC، MSTORE، MULTICHARGE، OPENBABEL، OPENMOBLAS، OPSH، OPENMOPLAS, OPSH QCXMS، S-DFTD3، STDA، TBLITE، TEST-DRIVE، TOML-F، TRANSPOSE، X11-BASIC، XTB، XTB4STDA.
اطلاعات بیشتر در مورد مجوزها و مراجع - لطفاً به اطلاعات مجوز در داخل برنامه مراجعه کنید.
تاریخ به‌روزرسانی
ایمنی با درک اینکه توسعه‌دهندگان چگونه داده‌های شما را جمع‌آوری و هم‌رسانی می‌کنند شروع می‌شود. شیوه‌های حفظ امنیت و حریم خصوصی داده‌ها ممکن است براساس استفاده، منطقه، و سن شما متفاوت باشد. توسعه‌دهنده این اطلاعات را ارائه کرده است و ممکن است آن را درطول زمان به‌روزرسانی کند.
هیچ داده‌ای با اشخاص ثالث هم‌رسانی نمی‌شود
درباره نحوه اعلام هم‌رسانی داده‌ها توسط توسعه‌دهندگان بیشتر بدانید
هیچ داده‌ای جمع‌آوری نمی‌شود
درباره نحوه اعلام جمع‌آوری داده‌ها توسط توسعه‌دهندگان بیشتر بدانید
ویژگی‌های جدید
Fixed compatibilty of the plotting options on Android 7 devices.
