Permainan berlangsung di lapangan bermain yang terdiri dari sejumlah dinding, dengan atom tersebar di seluruh. Pemain ditugaskan untuk merakit molekul dari atom. Atom-atom harus diatur agar sama persis dengan molekul yang ditampilkan di sisi kiri layar.
Pemain dapat memilih atom dan memindahkannya ke salah satu dari empat arah mata angin. Sebuah atom yang bergerak terus meluncur ke satu arah hingga menabrak dinding atau atom lain. Memecahkan teka-teki membutuhkan perencanaan strategis dalam menggerakkan atom, dan pada tingkat selanjutnya dengan sedikit ruang kosong, bahkan menemukan ruang untuk molekul yang lengkap dapat menjadi masalah.
Setelah molekul dirakit, pemain diberi skor; semakin cepat teka-teki selesai, semakin tinggi skornya.
Setiap teka-teki harus diselesaikan dalam batas waktu. Seluruh permainan terdiri dari 30 teka-teki dengan tingkat kesulitan yang meningkat.