PHREEQC plus
50+
ჩამოტვირთვები
ყველა
info
ამ აპის შესახებ
აღწერა და გამოყენება:
PHREEQC (ავტორები: David L. Parkhurst, C.A.J. Appelo) არის საყვარელი გეოქიმიური კოდი, რომელიც გამოიყენება სახეობების მოდელირებისთვის. ჩვენი აპლიკაცია მომხმარებლებს სთავაზობს გაფართოებული შესაძლებლობების გამოცდილებას MOPAC-ის (ავტორი: James JP Stewart), CHEMSOL (ავტორები: Jan Florián, Arieh Warshel), XTB (ავტორები: C. Bannwarth, E. Caldeweyher, S. Ehlert,) ინტეგრაციის გამო. ა. ჰანსენი, პ. პრახტი, ჯ. ზაიბერტი, ს. სპიჩერი, ს. გრიმი, პ. შუშკოვი, მ. სტანი, ჰ. ნოიგებაუერი, ჯ.-მ. მევესი, ვ. ასგეირსონი, კ. ბაუერი, ჯ. კუპმანი ) და DFTB+ (ავტორები: B. Hourahine, B. Aradi, V. Blum, F. Bonafé, A. Buccheri, C. Camacho, C. Cevallos, M. Y. Deshaye, T. Dumitrică, A. Dominguez, S. Ehlert, M. Elstner, T. van der Heide, J. Hermann, S. Irle, J. J. Kranz, C. Köhler, T. Kowalczyk, T. Kubař, I. S. Lee, V. Lutsker, R. J. Maurer, S. K. Min, I. Mitchell, C. ნეგრე, ტ.ა. ნიჰაუსი, ა.მ. ნ. ნიკლასონი, ა.ჯ. პეიჯი, ა. პეკია, გ.პენაცი, მ. Yu, T. Frauenheim). ნებისმიერი მორგებული სახეობა, რომელიც არ არის ჩაშენებულ მონაცემთა ბაზებში, შეიძლება გამოითვალოს აპში და შედეგები გამოიყენოს მოდელში (სხვა სიტყვებით რომ ვთქვათ, ახალი, კონკრეტული მონაცემთა ბაზა შეიძლება აშენდეს თითოეულ გაშვებაში ცალკე). გარდა ამისა, მიმდინარე პაკეტი შეიცავს უამრავ არატრადიციულ მონაცემთა ბაზას, რომელიც იყენებს როგორც ექსპერიმენტულ, ასევე პროგნოზირებულ/გამოთვლილ მონაცემებს დიდი მონაცემთა ბაზებიდან, როგორიცაა CHNOSZ, ModelSEED, Alexandria ბიბლიოთეკა, KEGG და სხვა ლიტერატურული წყაროები.
წონასწორობის მდგომარეობის გარდა, კოდი ასევე მხარს უჭერს კინეტიკური მოდელირებას, რისთვისაც შესაბამისი საკვანძო სიტყვების ბლოკები შეიძლება ავტომატურად წარმოიქმნას წინა გარდამავალი მდგომარეობის გამოთვლის საფუძველზე. როგორც ალტერნატივა არაწყლიანი სისტემებისთვის, ასევე ხელმისაწვდომია FastChem Cond სახეობების მოდელირება. პროგრამის ყველა ფუნქცია ხელმისაწვდომია ოფლაინში.
გაფრთხილება გამოთვლითი სიზუსტის შესახებ: MOPAC წარმოადგენს გონივრულ კომპრომისს მოწყობილობის სიმძლავრეს/გამოთვლის დროსა და პროგნოზირების სიზუსტეს შორის ნაერთების მრავალფეროვნებისთვის, დაწყებული მცირე და საშუალო ზომის მოლეკულებამდე. თუმცა, სიზუსტე შეზღუდულია. შედეგად მიღებული ენერგიების დასარეგულირებლად, COSMO მოდელი MOPAC-დან, ისევე როგორც CHEMSOL ხსნარის მოდელები ინტეგრირებულია, თუმცა CHEMSOL თავდაპირველად განზრახული იყო გამოყენებული იქნას თეორიის უფრო მაღალ დონეზე გამოთვლილ სტრუქტურებთან და მუხტებთან დაკავშირებით. ამიტომ, წონასწორობისა და სიჩქარის ყველა გამოთვლილი მუდმივი სიფრთხილით უნდა იქნას განხილული და ჩაითვალოს უხეშ შეფასებად იმ შემთხვევებში, როდესაც არ არის ხელმისაწვდომი ექსპერიმენტული მონაცემები (ჩართული მონაცემთა ბაზებიდან). XTB და DFTB+ ინტეგრაცია ჯერჯერობით ექსპერიმენტულია.
ᲛᲜᲘᲨᲕᲜᲔᲚᲝᲕᲐᲜᲘ !!!
მიუხედავად იმისა, რომ ეს აპი შედგება ღია კოდის კოდებისა და რესურსებისგან, ზოგიერთი კომპონენტის ლიცენზიები მომხმარებლებს ავალდებულებს ორიგინალური ცნობების ციტირებას შედეგების გამოქვეყნებისას. გთხოვთ, შეამოწმოთ ყველა ლიცენზირების ინფორმაცია ღილაკების „ლიცენზია“ და „აპლიკაციის შესახებ“.
PHREEQC PLUS აპლიკაციის ყველა მომხმარებელი მისი ჩამოტვირთვის, ინსტალაციისა და გამოყენებით შეესაბამება პროგრამული უზრუნველყოფის ცალკეული კომპონენტების ლიცენზირების ყველა პირობას და იღებს პასუხისმგებლობას მათ შენარჩუნებაზე.
აპლიკაციის წყაროს კოდი: https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus
კონტაქტი:
ანდროიდისთვის წყაროს კოდის შედგენა, ასევე ანდროიდის აპლიკაციის შემუშავება განხორციელდა ალან ლიშკას (alan.liska@jh-inst.cas.cz) და ვერონიკა რიჟიჩკოვას (sucha.ver@gmail.com), ჯ. ჰეიროვსკის ინსტიტუტის მიერ. Physical Chemistry of the CAS, v.v.i., Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8, ჩეხეთის რესპუბლიკა.
საიტი: http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm
გამოყენებული მესამე მხარის პროგრამული უზრუნველყოფის სია:
ACPDFVIEW, ANDROID SHELL, BLAS, CHEMSOL, DFTB+, DFTD4, EIGEN3, FASTCHEM Cond, GMP, GRAPHVIEW, LAPACK, MCTC-LIB, MOPAC, MSTORE, MULTICHARGE, OPENBABEL, OPENMOPLAS, OPSCHEM, PENMOPLAS QCXMS, S-DFTD3, STDA, TBLITE, TEST-DRIVE, TOML-F, TRANSPOSE, X11-BASIC, XTB, XTB4STDA.
დამატებითი ინფორმაცია ლიცენზიებისა და მითითებების შესახებ - გთხოვთ, გაეცნოთ ლიცენზირების ინფორმაციას აპლიკაციის შიგნით.
PHREEQC (ავტორები: David L. Parkhurst, C.A.J. Appelo) არის საყვარელი გეოქიმიური კოდი, რომელიც გამოიყენება სახეობების მოდელირებისთვის. ჩვენი აპლიკაცია მომხმარებლებს სთავაზობს გაფართოებული შესაძლებლობების გამოცდილებას MOPAC-ის (ავტორი: James JP Stewart), CHEMSOL (ავტორები: Jan Florián, Arieh Warshel), XTB (ავტორები: C. Bannwarth, E. Caldeweyher, S. Ehlert,) ინტეგრაციის გამო. ა. ჰანსენი, პ. პრახტი, ჯ. ზაიბერტი, ს. სპიჩერი, ს. გრიმი, პ. შუშკოვი, მ. სტანი, ჰ. ნოიგებაუერი, ჯ.-მ. მევესი, ვ. ასგეირსონი, კ. ბაუერი, ჯ. კუპმანი ) და DFTB+ (ავტორები: B. Hourahine, B. Aradi, V. Blum, F. Bonafé, A. Buccheri, C. Camacho, C. Cevallos, M. Y. Deshaye, T. Dumitrică, A. Dominguez, S. Ehlert, M. Elstner, T. van der Heide, J. Hermann, S. Irle, J. J. Kranz, C. Köhler, T. Kowalczyk, T. Kubař, I. S. Lee, V. Lutsker, R. J. Maurer, S. K. Min, I. Mitchell, C. ნეგრე, ტ.ა. ნიჰაუსი, ა.მ. ნ. ნიკლასონი, ა.ჯ. პეიჯი, ა. პეკია, გ.პენაცი, მ. Yu, T. Frauenheim). ნებისმიერი მორგებული სახეობა, რომელიც არ არის ჩაშენებულ მონაცემთა ბაზებში, შეიძლება გამოითვალოს აპში და შედეგები გამოიყენოს მოდელში (სხვა სიტყვებით რომ ვთქვათ, ახალი, კონკრეტული მონაცემთა ბაზა შეიძლება აშენდეს თითოეულ გაშვებაში ცალკე). გარდა ამისა, მიმდინარე პაკეტი შეიცავს უამრავ არატრადიციულ მონაცემთა ბაზას, რომელიც იყენებს როგორც ექსპერიმენტულ, ასევე პროგნოზირებულ/გამოთვლილ მონაცემებს დიდი მონაცემთა ბაზებიდან, როგორიცაა CHNOSZ, ModelSEED, Alexandria ბიბლიოთეკა, KEGG და სხვა ლიტერატურული წყაროები.
წონასწორობის მდგომარეობის გარდა, კოდი ასევე მხარს უჭერს კინეტიკური მოდელირებას, რისთვისაც შესაბამისი საკვანძო სიტყვების ბლოკები შეიძლება ავტომატურად წარმოიქმნას წინა გარდამავალი მდგომარეობის გამოთვლის საფუძველზე. როგორც ალტერნატივა არაწყლიანი სისტემებისთვის, ასევე ხელმისაწვდომია FastChem Cond სახეობების მოდელირება. პროგრამის ყველა ფუნქცია ხელმისაწვდომია ოფლაინში.
გაფრთხილება გამოთვლითი სიზუსტის შესახებ: MOPAC წარმოადგენს გონივრულ კომპრომისს მოწყობილობის სიმძლავრეს/გამოთვლის დროსა და პროგნოზირების სიზუსტეს შორის ნაერთების მრავალფეროვნებისთვის, დაწყებული მცირე და საშუალო ზომის მოლეკულებამდე. თუმცა, სიზუსტე შეზღუდულია. შედეგად მიღებული ენერგიების დასარეგულირებლად, COSMO მოდელი MOPAC-დან, ისევე როგორც CHEMSOL ხსნარის მოდელები ინტეგრირებულია, თუმცა CHEMSOL თავდაპირველად განზრახული იყო გამოყენებული იქნას თეორიის უფრო მაღალ დონეზე გამოთვლილ სტრუქტურებთან და მუხტებთან დაკავშირებით. ამიტომ, წონასწორობისა და სიჩქარის ყველა გამოთვლილი მუდმივი სიფრთხილით უნდა იქნას განხილული და ჩაითვალოს უხეშ შეფასებად იმ შემთხვევებში, როდესაც არ არის ხელმისაწვდომი ექსპერიმენტული მონაცემები (ჩართული მონაცემთა ბაზებიდან). XTB და DFTB+ ინტეგრაცია ჯერჯერობით ექსპერიმენტულია.
ᲛᲜᲘᲨᲕᲜᲔᲚᲝᲕᲐᲜᲘ !!!
მიუხედავად იმისა, რომ ეს აპი შედგება ღია კოდის კოდებისა და რესურსებისგან, ზოგიერთი კომპონენტის ლიცენზიები მომხმარებლებს ავალდებულებს ორიგინალური ცნობების ციტირებას შედეგების გამოქვეყნებისას. გთხოვთ, შეამოწმოთ ყველა ლიცენზირების ინფორმაცია ღილაკების „ლიცენზია“ და „აპლიკაციის შესახებ“.
PHREEQC PLUS აპლიკაციის ყველა მომხმარებელი მისი ჩამოტვირთვის, ინსტალაციისა და გამოყენებით შეესაბამება პროგრამული უზრუნველყოფის ცალკეული კომპონენტების ლიცენზირების ყველა პირობას და იღებს პასუხისმგებლობას მათ შენარჩუნებაზე.
აპლიკაციის წყაროს კოდი: https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus
კონტაქტი:
ანდროიდისთვის წყაროს კოდის შედგენა, ასევე ანდროიდის აპლიკაციის შემუშავება განხორციელდა ალან ლიშკას (alan.liska@jh-inst.cas.cz) და ვერონიკა რიჟიჩკოვას (sucha.ver@gmail.com), ჯ. ჰეიროვსკის ინსტიტუტის მიერ. Physical Chemistry of the CAS, v.v.i., Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8, ჩეხეთის რესპუბლიკა.
საიტი: http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm
გამოყენებული მესამე მხარის პროგრამული უზრუნველყოფის სია:
ACPDFVIEW, ANDROID SHELL, BLAS, CHEMSOL, DFTB+, DFTD4, EIGEN3, FASTCHEM Cond, GMP, GRAPHVIEW, LAPACK, MCTC-LIB, MOPAC, MSTORE, MULTICHARGE, OPENBABEL, OPENMOPLAS, OPSCHEM, PENMOPLAS QCXMS, S-DFTD3, STDA, TBLITE, TEST-DRIVE, TOML-F, TRANSPOSE, X11-BASIC, XTB, XTB4STDA.
დამატებითი ინფორმაცია ლიცენზიებისა და მითითებების შესახებ - გთხოვთ, გაეცნოთ ლიცენზირების ინფორმაციას აპლიკაციის შიგნით.
განახლდა:
უსაფრთხოება იწყება დეველოპერების მიერ თქვენი მონაცემების შეგროვებისა და გაზიარების წესების გაცნობით. მონაცემთა კონფიდენციალურობისა და უსაფრთხოების პრაქტიკები შეიძლება განსხვავდებოდეს თქვენი აპის ვერსიის, გამოყენების, რეგიონის და ასაკის მიხედვით. ეს ინფორმაცია მოწოდებულია დეველოპერის მიერ და შეიძლება დროთა განმავლობაში განახლდეს.
მონაცემები არ ზიარდება მესამე მხარეებთან
შეიტყვეთ მეტი დეველოპერების მიერ პუბლიკაციების გამოქვეყნების შესახებ
მონაცემები შეგროვებული არ არის
შეიტყვეთ მეტი დეველოპერების მიერ კოლექციის გამოქვეყნების შესახებ
რა არის ახალი
Fixed compatibilty of the plotting options on Android 7 devices.
