PHREEQC plus
50+
Nedladdningar
Ingen åldersgräns
info
Om appen
Beskrivning och användning:
PHREEQC (författare: David L. Parkhurst, C.A.J. Appelo) är en favorit geokemisk kod som används för speciationsmodellering. Vår applikation ger användarna upplevelsen av utökade möjligheter på grund av integration av MOPAC (författare: James JP Stewart), CHEMSOL (författare: Jan Florián, Arieh Warshel), XTB (författare: C. Bannwarth, E. Caldeweyher, S. Ehlert, A. Hansen, P. Pracht, J. Seibert, S. Spicher, S. Grimme, P. Shushkov, M. Stahn, H. Neugebauer, J.-M. Mewes, V. Asgeirsson, C. Bauer, J. Koopman ) och DFTB+ (författare: B. Hourahine, B. Aradi, V. Blum, F. Bonafé, A. Buccheri, C. Camacho, C. Cevallos, M. Y. Deshaye, T. Dumitrică, A. Dominguez, S. Ehlert, M. Elstner, T. van der Heide, J. Hermann, S. Irle, J. J. Kranz, C. Köhler, T. Kowalczyk, T. Kubař, I. S. Lee, V. Lutsker, R. J. Maurer, S. K. Min, I. Mitchell, C. Negre, T. A. Niehaus, A. M. N. Niklasson, A. J. Page, A. Pecchia, G. Penazzi, M. P. Persson, J. Řezáč, C. G. Sánchez, M. Sternberg, M. Stöhr, F. Stuckenberg, A. Tkatchenko, V. W. Yu, T. Frauenheim). Alla anpassade arter som inte finns i de inbyggda databaserna kan beräknas i appen och resultaten användas i modellen (med andra ord kan en ny, specifik databas konstrueras i varje körning separat). Dessutom innehåller det aktuella paketet många icke-konventionella databaser som använder både experimentella såväl som förutspådda/beräknade data från stora databaser som CHNOSZ, ModelSEED, Alexandria bibliotek, KEGG och andra bokstavliga källor.
Förutom jämviktstillståndet stöder koden även kinetikmodellering, för vilken respektive nyckelordsblock kan genereras automatiskt baserat på den tidigare övergångstillståndsberäkningen. Som ett alternativ för icke-vattenhaltiga system finns även FastChem Cond-specieringsmodellering tillgänglig. Alla programfunktioner är tillgängliga offline.
Varning om beräkningsnoggrannheten: MOPAC representerar en rimlig kompromiss mellan enhetens kraft/beräkningstid och prediktionsnoggrannhet för ett stort antal föreningstyper, från små till medelstora molekyler. Noggrannheten är dock begränsad. För att trimma de resulterande energierna integreras såväl COSMO-modeller från MOPAC som CHEMSOL-lösningsmodeller, även om CHEMSOL ursprungligen är tänkt att användas i samband med strukturer och laddningar beräknade på högre teorinivåer. Därför bör alla beräknade jämvikts- och hastighetskonstanter behandlas med försiktighet och betraktas som en grov uppskattning i de fall då inga experimentella data (från de inkluderade databaserna) är tillgängliga. XTB och DFTB+ integration är experimentell än så länge.
VIKTIG !!!
Även om den här appen är sammansatt av öppen källkod och resurser kräver licenser för vissa komponenter att användarna citerar originalreferenserna när resultaten publiceras. Kontrollera all licensinformation under knapparna "Licens" och "Om appen".
Alla användare av PHREEQC PLUS-appen följer alla licensvillkoren för de enskilda programvarukomponenterna genom att ladda ner, installera och använda den och tar ansvar för att behålla dem.
Appens källkod: https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus
Kontakt:
Sammanställningen av källkoden för Android samt utvecklingen av Android-appen gjordes av Alan Liška (alan.liska@jh-inst.cas.cz) och Veronika Růžičková (sucha.ver@gmail.com), J. Heyrovský Institute of Physical Chemistry of the CAS, v.v.i., Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8, Tjeckien.
Webbplats: http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm
Lista över använd programvara från tredje part:
ACPDFVIEW, ANDROID SHELL, BLAS, CHEMSOL, DFTB+, DFTD4, EIGEN3, FASTCHEM Cond, GMP, GRAPHVIEW, LAPACK, MCTC-LIB, MOPAC, MSTORE, MULTICHARGE, OPENBABEL, OPENBLAS, OPENMOPAC, OPS, OPENMOPAC, OPS, OPS. S-DFTD3, STDA, TBLITE, TEST-DRIVE, TOML-F, TRANSPOSE, X11-BASIC, XTB, XTB4STDA.
Mer information om licenser och referenser - se licensinformationen inuti appen.
PHREEQC (författare: David L. Parkhurst, C.A.J. Appelo) är en favorit geokemisk kod som används för speciationsmodellering. Vår applikation ger användarna upplevelsen av utökade möjligheter på grund av integration av MOPAC (författare: James JP Stewart), CHEMSOL (författare: Jan Florián, Arieh Warshel), XTB (författare: C. Bannwarth, E. Caldeweyher, S. Ehlert, A. Hansen, P. Pracht, J. Seibert, S. Spicher, S. Grimme, P. Shushkov, M. Stahn, H. Neugebauer, J.-M. Mewes, V. Asgeirsson, C. Bauer, J. Koopman ) och DFTB+ (författare: B. Hourahine, B. Aradi, V. Blum, F. Bonafé, A. Buccheri, C. Camacho, C. Cevallos, M. Y. Deshaye, T. Dumitrică, A. Dominguez, S. Ehlert, M. Elstner, T. van der Heide, J. Hermann, S. Irle, J. J. Kranz, C. Köhler, T. Kowalczyk, T. Kubař, I. S. Lee, V. Lutsker, R. J. Maurer, S. K. Min, I. Mitchell, C. Negre, T. A. Niehaus, A. M. N. Niklasson, A. J. Page, A. Pecchia, G. Penazzi, M. P. Persson, J. Řezáč, C. G. Sánchez, M. Sternberg, M. Stöhr, F. Stuckenberg, A. Tkatchenko, V. W. Yu, T. Frauenheim). Alla anpassade arter som inte finns i de inbyggda databaserna kan beräknas i appen och resultaten användas i modellen (med andra ord kan en ny, specifik databas konstrueras i varje körning separat). Dessutom innehåller det aktuella paketet många icke-konventionella databaser som använder både experimentella såväl som förutspådda/beräknade data från stora databaser som CHNOSZ, ModelSEED, Alexandria bibliotek, KEGG och andra bokstavliga källor.
Förutom jämviktstillståndet stöder koden även kinetikmodellering, för vilken respektive nyckelordsblock kan genereras automatiskt baserat på den tidigare övergångstillståndsberäkningen. Som ett alternativ för icke-vattenhaltiga system finns även FastChem Cond-specieringsmodellering tillgänglig. Alla programfunktioner är tillgängliga offline.
Varning om beräkningsnoggrannheten: MOPAC representerar en rimlig kompromiss mellan enhetens kraft/beräkningstid och prediktionsnoggrannhet för ett stort antal föreningstyper, från små till medelstora molekyler. Noggrannheten är dock begränsad. För att trimma de resulterande energierna integreras såväl COSMO-modeller från MOPAC som CHEMSOL-lösningsmodeller, även om CHEMSOL ursprungligen är tänkt att användas i samband med strukturer och laddningar beräknade på högre teorinivåer. Därför bör alla beräknade jämvikts- och hastighetskonstanter behandlas med försiktighet och betraktas som en grov uppskattning i de fall då inga experimentella data (från de inkluderade databaserna) är tillgängliga. XTB och DFTB+ integration är experimentell än så länge.
VIKTIG !!!
Även om den här appen är sammansatt av öppen källkod och resurser kräver licenser för vissa komponenter att användarna citerar originalreferenserna när resultaten publiceras. Kontrollera all licensinformation under knapparna "Licens" och "Om appen".
Alla användare av PHREEQC PLUS-appen följer alla licensvillkoren för de enskilda programvarukomponenterna genom att ladda ner, installera och använda den och tar ansvar för att behålla dem.
Appens källkod: https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus
Kontakt:
Sammanställningen av källkoden för Android samt utvecklingen av Android-appen gjordes av Alan Liška (alan.liska@jh-inst.cas.cz) och Veronika Růžičková (sucha.ver@gmail.com), J. Heyrovský Institute of Physical Chemistry of the CAS, v.v.i., Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8, Tjeckien.
Webbplats: http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm
Lista över använd programvara från tredje part:
ACPDFVIEW, ANDROID SHELL, BLAS, CHEMSOL, DFTB+, DFTD4, EIGEN3, FASTCHEM Cond, GMP, GRAPHVIEW, LAPACK, MCTC-LIB, MOPAC, MSTORE, MULTICHARGE, OPENBABEL, OPENBLAS, OPENMOPAC, OPS, OPENMOPAC, OPS, OPS. S-DFTD3, STDA, TBLITE, TEST-DRIVE, TOML-F, TRANSPOSE, X11-BASIC, XTB, XTB4STDA.
Mer information om licenser och referenser - se licensinformationen inuti appen.
Uppdaterades den
Säkerhet börjar med förståelsen av hur utvecklare samlar in och delar din data. Praxis för dataintegritet och säkerhet varierar beroende på användning, region och ålder. Utvecklaren har tillhandahållit denna information och kan uppdatera den med tiden.
Nyheter
Fixed compatibilty of the plotting options on Android 7 devices.
