PHREEQC plus
50+
Lượt tải xuống
Tất cả mọi người
info
Thông tin về ứng dụng này
Mô tả & Sử dụng:
PHREEQC (tác giả: David L. Parkhurst, C.A.J. Appelo) là một mã địa hóa được ưa chuộng sử dụng cho mô hình hóa sự hình thành. Ứng dụng của chúng tôi mang đến cho người dùng trải nghiệm về các khả năng mở rộng nhờ tích hợp MOPAC (tác giả: James JP Stewart), CHEMSOL (tác giả: Jan Florián, Arieh Warshel), XTB (tác giả: C. Bannwarth, E. Caldeweyher, S. Ehlert, A. Hansen, P. Pracht, J. Seibert, S. Spicher, S. Grimme, P. Shushkov, M. Stahn, H. Neugebauer, J.-M. Mewes, V. Asgeirsson, C. Bauer, J. Koopman ) và DFTB+ (tác giả: B. Hourahine, B. Aradi, V. Blum, F. Bonafé, A. Buccheri, C. Camacho, C. Cevallos, M. Y. Deshaye, T. Dumitrică, A. Dominguez, S. Ehlert, M . Elstner, T. van der Heide, J. Hermann, S. Irle, J. J. Kranz, C. Köhler, T. Kowalczyk, T. Kubař, I. S. Lee, V. Lutsker, R. J. Maurer, S. K. Min, I. Mitchell, C . Negre, T. A. Niehaus, A. M. N. Niklasson, A. J. Page, A. Pecchia, G. Penazzi, M. P. Persson, J. Řezáč, C. G. Sánchez, M. Sternberg, M. Stöhr, F. Stuckenberg, A. Tkatchenko, V. W.-z. Yu, T. Frauenheim). Bất kỳ loài tùy chỉnh nào không có trong cơ sở dữ liệu tích hợp đều có thể được tính toán trong ứng dụng và kết quả được sử dụng trong mô hình (nói cách khác, cơ sở dữ liệu cụ thể, mới có thể được xây dựng trong mỗi lần chạy riêng biệt). Hơn nữa, gói hiện tại chứa nhiều cơ sở dữ liệu không thông thường sử dụng cả dữ liệu thử nghiệm cũng như dự đoán/tính toán từ các cơ sở dữ liệu lớn như CHNOSZ, ModelSEED, thư viện Alexandria, KEGG và các nguồn thông thường khác.
Ngoại trừ trạng thái cân bằng, mã này cũng hỗ trợ mô hình động học, trong đó các khối từ khóa tương ứng có thể được tạo tự động dựa trên tính toán trạng thái chuyển tiếp trước đó. Là một giải pháp thay thế cho các hệ thống không chứa nước, mô hình phân tích FastChem Cond cũng có sẵn. Tất cả các tính năng của chương trình đều khả dụng khi ngoại tuyến.
Cảnh báo về độ chính xác tính toán: MOPAC thể hiện sự thỏa hiệp hợp lý giữa công suất của thiết bị/thời gian tính toán và độ chính xác dự đoán đối với nhiều loại hợp chất khác nhau, từ phân tử nhỏ đến cỡ trung bình. Tuy nhiên, độ chính xác còn hạn chế. Để điều chỉnh năng lượng thu được, mô hình COSMO từ MOPAC cũng như các mô hình hòa tan CHEMSOL được tích hợp, mặc dù CHEMSOL ban đầu được dự định sử dụng cùng với các cấu trúc và điện tích được tính toán ở cấp độ lý thuyết cao hơn. Do đó, tất cả các hằng số cân bằng và tốc độ được tính toán phải được xử lý một cách thận trọng và được coi là ước tính sơ bộ trong trường hợp không có sẵn dữ liệu thực nghiệm (từ cơ sở dữ liệu đi kèm). Việc tích hợp XTB và DFTB+ cho đến nay vẫn đang ở giai đoạn thử nghiệm.
QUAN TRỌNG !!!
Mặc dù ứng dụng này bao gồm các tài nguyên và mã nguồn mở nhưng giấy phép cho một số thành phần yêu cầu người dùng trích dẫn tài liệu tham khảo gốc khi xuất bản kết quả. Vui lòng kiểm tra tất cả thông tin cấp phép trong các nút 'Giấy phép' và 'Giới thiệu về ứng dụng'.
Tất cả người dùng ứng dụng PHREEQC PLUS đều tuân thủ bằng cách tải xuống, cài đặt và sử dụng ứng dụng này với tất cả các điều kiện cấp phép của từng thành phần phần mềm riêng lẻ và chịu trách nhiệm lưu giữ chúng.
Mã nguồn ứng dụng: https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus
Liên hệ:
Việc biên soạn mã nguồn cho Android cũng như phát triển ứng dụng Android được thực hiện bởi Alan Liška (alan.liska@jh-inst.cas.cz) và Veronika Růžičková (sucha.ver@gmail.com), Viện J. Heyrovský Hóa lý của CAS, v.v.i., Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8, Cộng hòa Séc.
Trang web: http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm
Danh sách phần mềm của bên thứ ba được sử dụng:
ACPDFVIEW, ANDROID SHELL, BLAS, CHEMSOL, DFTB+, DFTD4, EIGEN3, FASTCHEM Cond, GMP, GRAPHVIEW, LAPACK, MCTC-LIB, MOPAC, MSTORE, MULTICHARGE, OPENBABEL, OPENBLAS, OPENMOPAC, OPSIN, PHREEQC, PLOTMS, PYTHON, QCXMS, S-DFTD3, STDA, TBLITE, THỬ NGHIỆM, TOML-F, TRANSPOSE, X11-BASIC, XTB, XTB4STDA.
Thông tin thêm về giấy phép và tài liệu tham khảo - vui lòng tham khảo thông tin cấp phép bên trong ứng dụng.
PHREEQC (tác giả: David L. Parkhurst, C.A.J. Appelo) là một mã địa hóa được ưa chuộng sử dụng cho mô hình hóa sự hình thành. Ứng dụng của chúng tôi mang đến cho người dùng trải nghiệm về các khả năng mở rộng nhờ tích hợp MOPAC (tác giả: James JP Stewart), CHEMSOL (tác giả: Jan Florián, Arieh Warshel), XTB (tác giả: C. Bannwarth, E. Caldeweyher, S. Ehlert, A. Hansen, P. Pracht, J. Seibert, S. Spicher, S. Grimme, P. Shushkov, M. Stahn, H. Neugebauer, J.-M. Mewes, V. Asgeirsson, C. Bauer, J. Koopman ) và DFTB+ (tác giả: B. Hourahine, B. Aradi, V. Blum, F. Bonafé, A. Buccheri, C. Camacho, C. Cevallos, M. Y. Deshaye, T. Dumitrică, A. Dominguez, S. Ehlert, M . Elstner, T. van der Heide, J. Hermann, S. Irle, J. J. Kranz, C. Köhler, T. Kowalczyk, T. Kubař, I. S. Lee, V. Lutsker, R. J. Maurer, S. K. Min, I. Mitchell, C . Negre, T. A. Niehaus, A. M. N. Niklasson, A. J. Page, A. Pecchia, G. Penazzi, M. P. Persson, J. Řezáč, C. G. Sánchez, M. Sternberg, M. Stöhr, F. Stuckenberg, A. Tkatchenko, V. W.-z. Yu, T. Frauenheim). Bất kỳ loài tùy chỉnh nào không có trong cơ sở dữ liệu tích hợp đều có thể được tính toán trong ứng dụng và kết quả được sử dụng trong mô hình (nói cách khác, cơ sở dữ liệu cụ thể, mới có thể được xây dựng trong mỗi lần chạy riêng biệt). Hơn nữa, gói hiện tại chứa nhiều cơ sở dữ liệu không thông thường sử dụng cả dữ liệu thử nghiệm cũng như dự đoán/tính toán từ các cơ sở dữ liệu lớn như CHNOSZ, ModelSEED, thư viện Alexandria, KEGG và các nguồn thông thường khác.
Ngoại trừ trạng thái cân bằng, mã này cũng hỗ trợ mô hình động học, trong đó các khối từ khóa tương ứng có thể được tạo tự động dựa trên tính toán trạng thái chuyển tiếp trước đó. Là một giải pháp thay thế cho các hệ thống không chứa nước, mô hình phân tích FastChem Cond cũng có sẵn. Tất cả các tính năng của chương trình đều khả dụng khi ngoại tuyến.
Cảnh báo về độ chính xác tính toán: MOPAC thể hiện sự thỏa hiệp hợp lý giữa công suất của thiết bị/thời gian tính toán và độ chính xác dự đoán đối với nhiều loại hợp chất khác nhau, từ phân tử nhỏ đến cỡ trung bình. Tuy nhiên, độ chính xác còn hạn chế. Để điều chỉnh năng lượng thu được, mô hình COSMO từ MOPAC cũng như các mô hình hòa tan CHEMSOL được tích hợp, mặc dù CHEMSOL ban đầu được dự định sử dụng cùng với các cấu trúc và điện tích được tính toán ở cấp độ lý thuyết cao hơn. Do đó, tất cả các hằng số cân bằng và tốc độ được tính toán phải được xử lý một cách thận trọng và được coi là ước tính sơ bộ trong trường hợp không có sẵn dữ liệu thực nghiệm (từ cơ sở dữ liệu đi kèm). Việc tích hợp XTB và DFTB+ cho đến nay vẫn đang ở giai đoạn thử nghiệm.
QUAN TRỌNG !!!
Mặc dù ứng dụng này bao gồm các tài nguyên và mã nguồn mở nhưng giấy phép cho một số thành phần yêu cầu người dùng trích dẫn tài liệu tham khảo gốc khi xuất bản kết quả. Vui lòng kiểm tra tất cả thông tin cấp phép trong các nút 'Giấy phép' và 'Giới thiệu về ứng dụng'.
Tất cả người dùng ứng dụng PHREEQC PLUS đều tuân thủ bằng cách tải xuống, cài đặt và sử dụng ứng dụng này với tất cả các điều kiện cấp phép của từng thành phần phần mềm riêng lẻ và chịu trách nhiệm lưu giữ chúng.
Mã nguồn ứng dụng: https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus
Liên hệ:
Việc biên soạn mã nguồn cho Android cũng như phát triển ứng dụng Android được thực hiện bởi Alan Liška (alan.liska@jh-inst.cas.cz) và Veronika Růžičková (sucha.ver@gmail.com), Viện J. Heyrovský Hóa lý của CAS, v.v.i., Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8, Cộng hòa Séc.
Trang web: http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm
Danh sách phần mềm của bên thứ ba được sử dụng:
ACPDFVIEW, ANDROID SHELL, BLAS, CHEMSOL, DFTB+, DFTD4, EIGEN3, FASTCHEM Cond, GMP, GRAPHVIEW, LAPACK, MCTC-LIB, MOPAC, MSTORE, MULTICHARGE, OPENBABEL, OPENBLAS, OPENMOPAC, OPSIN, PHREEQC, PLOTMS, PYTHON, QCXMS, S-DFTD3, STDA, TBLITE, THỬ NGHIỆM, TOML-F, TRANSPOSE, X11-BASIC, XTB, XTB4STDA.
Thông tin thêm về giấy phép và tài liệu tham khảo - vui lòng tham khảo thông tin cấp phép bên trong ứng dụng.
Lần cập nhật gần đây nhất
Sự an toàn bắt đầu từ việc nắm được cách nhà phát triển thu thập và chia sẻ dữ liệu của bạn. Các biện pháp bảo vệ quyền riêng tư và bảo mật dữ liệu có thể thay đổi tuỳ theo cách sử dụng, khu vực và độ tuổi. Nhà phát triển đã cung cấp thông tin này và có thể sẽ cập nhật theo thời gian.
Không chia sẻ dữ liệu với bên thứ ba
Tìm hiểu thêm về cách nhà phát triển khai báo thông tin về hoạt động chia sẻ dữ liệu
Không thu thập dữ liệu nào
Tìm hiểu thêm về cách nhà phát triển khai báo thông tin về hoạt động thu thập dữ liệu
Tính năng mới
Fixed compatibilty of the plotting options on Android 7 devices.
