easy Primer Design

easy Primer Design

Sobre l'aplicació

easy Primer Design és una eina que us ajuda a dissenyar els vostres imprimadors de PCR a qualsevol lloc de manera eficient en el temps: al banc mentre espereu un experiment, de camí cap a la feina o des de la feina o a l'oficina. Simplement enganxeu la vostra seqüència de nucleòtids i especifiqueu els vostres requisits per generar seqüències d'imprimació per a la vostra aplicació de clonació de PCR.

Característiques:
-Utilitzeu el botó d'enganxar per introduir la vostra seqüència. El CDS/seqüència introduït conté números, espais, salts de línia, lletres majúscules o minúscules? No importa! Easy Primer Design elimina números, espais i salts de línia i ho canvia tot a majúscules!
-introduïu la vostra seqüència sense codó d'inici i aturada (i obteniu un missatge d'advertència si n'heu oblidat d'eliminar-ne un) per ser flexible per al disseny d'imprimació per a plasmidis amb etiquetes N-terminal o C-terminal.
-trieu entre més de 20 llocs diferents d'enzims de restricció, la clonació Golden Gate és compatible amb BsaI i BsbI, fins i tot podeu entrar a l'encavalcament
-Rebeu missatges d'advertència si l'enzim escollit talla la seqüència introduïda
-Màxima flexibilitat mitjançant l'opció d'enzim de restricció "altre", introduïu el vostre lloc d'enzim de restricció si no està a la llista - s'admeten seqüències no palindròmiques! Si el lloc de restricció introduït està present en la seqüència introduïda o en el seu complement invers, rebreu un missatge d'advertència!
-obté un missatge d'advertència per evitar errors habituals de "copiar i enganxar" si la seqüència introduïda conté un codó incomplet!
-Inclou una seqüència KOZAK a l'imprimació directa si en voleu una
-trieu si necessiteu un codó d'inici i si necessiteu un codó d'aturada (es poden seleccionar els 3 codons de parada comuns)
-Introduïu una temperatura de fusió per a les vostres imprimacions, es calcula mitjançant la temperatura de fusió ajustada a la sal
-introduir la concentració de sal (Na+)
-introduïu una extensió d'extrem 5' per als dos imprimadors
-Es generen cebadors per acabar amb G o C
- Es mostren la temperatura de fusió, el contingut de G/C i la longitud de la imprimació
-procés de disseny transparent! es mostren tots els passos intermedis! Les vostres opcions seleccionades es mostren als resultats finals!
-botó de còpia per copiar tota la sortida i enviar-la per correu electrònic al vostre ordinador d'escriptori per als propers passos de disseny o desar-la com a fitxer!
-Actualització de la versió 0.03: nova característica "DeletionIn": us ajuda a dissenyar primers per a PCR d'extensió solapada per eliminar regions internes específiques d'una seqüència (per exemple, suprimir dominis)
-Actualització de la versió 0.045: la nova característica "Mutació" us ajuda a dissenyar cebadors per a PCR d'extensió solapada per mutar un codó específic de la vostra seqüència per codificar un altre aminoàcid
-Actualització de la versió 0.060: nova característica: 'DeletionNC': us ajuda a dissenyar cebadors per eliminar les regions terminals N(5')- o C(3') de la vostra seqüència
-Actualització de la versió 0.080: nova funció: "Inserció": llisqueu cap a l'esquerra al menú principal superior i trobeu ajuda per dissenyar cebadors per a PCR d'extensió de solapament per inserir una seqüència d'inserció a la vostra seqüència
- Actualització de la versió 0.085: nova característica: "Reemplaça": llisca cap a l'esquerra al menú principal superior per obtenir ajuda per dissenyar imprimadors per a PCR d'extensió de solapament, que substitueixen una regió interna per una seqüència d'inserció introduïda

Tingueu en compte: l'aplicació mòbil Easy Primer Design no ofereix seqüències d'imprimació llestes per utilitzar, només us dóna suport durant el procés de disseny de la imprimació. L'usuari ha de validar acuradament la correcció de cada part del resultat generat i realitzar totes les altres proves necessàries!

Feliç clonació! -Espero que ajudi :)

Novetats

Update for current Android versions
minor bug fixes