easy Primer Design
100+
Stahování
Všichni (E)
info
Informace o aplikaci
easy Primer Design je nástroj, který vám pomůže navrhnout vaše primery PCR kdekoli a časově efektivním způsobem: na lavičce při čekání na experiment, na cestě do práce nebo z práce nebo v kanceláři. Jednoduše vložte svou nukleotidovou sekvenci a specifikujte své požadavky na vytvoření sekvencí primerů pro vaši aplikaci klonování PCR.
Funkce:
- Pomocí tlačítka Vložit zadejte svou sekvenci. Zadaný CDS/sekvence obsahuje čísla, mezery, zalomení řádků, velká nebo malá písmena? To je jedno! easy Primer Design odstraňuje čísla, mezery a zalomení řádků a mění vše na velká písmena!
-zadejte svou sekvenci bez startovacího a stop kodonu (a dostanete varovnou zprávu, pokud jste jeden z nich zapomněli odstranit), abyste byli flexibilní pro návrh primeru pro plazmidy s N-terminálními nebo C-terminálními značkami.
-vyberte si z více než 20 různých míst pro restrikční enzymy, klonování Golden Gate je podporováno prostřednictvím BsaI a BsbI, můžete dokonce zadat přesah
-Získejte varovné zprávy, pokud by vámi vybraný enzym přerušil zadanou sekvenci
-maximální flexibilita díky možnosti restrikčních enzymů 'jiné', zadejte své místo pro restrikční enzym, pokud není v seznamu - jsou podporovány nepalindromické sekvence! Pokud je zadané místo restrikce přítomno ve vámi zadané sekvenci nebo v opačném doplňku, zobrazí se varovná zpráva!
-získáte varovnou zprávu, abyste se vyhnuli běžným chybám při kopírování a vkládání, pokud zadaná sekvence obsahuje neúplný kodon!
-zahrnout sekvenci KOZAK do dopředného primeru, pokud jej chcete
-vyberte, zda potřebujete startovací kodon a zda potřebujete stop kodon (lze vybrat všechny 3 běžné stop kodony)
-zadejte teplotu tání pro vaše základní nátěry, vypočítá se pomocí teploty tání upravené soli
- zadejte koncentraci soli (Na+)
-zadejte 5'-end prodloužení pro oba vaše primery
-primery jsou generovány tak, aby končily G nebo C
-tavení Zobrazí se teplota, obsah G/C a délka primeru
-transparentní proces navrhování! zobrazí se všechny mezikroky! Vámi vybrané možnosti se zobrazí pod konečnými výsledky!
- tlačítko kopírovat pro zkopírování celého výstupu a jeho odeslání e-mailem na váš stolní počítač pro další návrhové kroky nebo jej uložit jako soubor!
-Aktualizace verze 0.03: nová funkce 'DeletionIn': pomáhá vám navrhnout primery pro překrývající se extenzní PCR pro odstranění specifických vnitřních oblastí ze sekvence (např. odstranění domén)
-Aktualizace verze 0.045: nová funkce 'Mutace' vám pomůže navrhnout primery pro překryvnou extenzní PCR pro mutaci specifického kodonu ve vaší sekvenci tak, aby kódoval jinou aminokyselinu
- Aktualizace verze 0.060: nová funkce: 'DeletionNC' - pomáhá vám navrhnout primery pro odstranění N(5')- nebo C(3')-terminálních oblastí z vaší sekvence
-Aktualizace verze 0.080: nová funkce: 'Insertion' - přejeďte doleva v horní hlavní nabídce a najděte nápovědu pro návrh primerů pro překryvnou extenzní PCR pro vložení sekvence inzertu do vaší sekvence
- Aktualizace verze 0.085: nová Funkce: 'Nahradit' - přejetím doleva v horní hlavní nabídce získáte nápovědu pro návrh primerů pro překryvnou extenzní PCR, které nahrazují vnitřní oblast zadanou sekvencí inzertu
Upozornění: mobilní aplikace Easy Primer Design neposkytuje sekvence primerů připravené k použití, podporuje vás pouze během procesu návrhu primeru. Uživatel musí pečlivě ověřit správnost každé části generovaného výsledku a provést všechny další potřebné testy!
Šťastné klonování! -Doufám, že to pomůže :)
Funkce:
- Pomocí tlačítka Vložit zadejte svou sekvenci. Zadaný CDS/sekvence obsahuje čísla, mezery, zalomení řádků, velká nebo malá písmena? To je jedno! easy Primer Design odstraňuje čísla, mezery a zalomení řádků a mění vše na velká písmena!
-zadejte svou sekvenci bez startovacího a stop kodonu (a dostanete varovnou zprávu, pokud jste jeden z nich zapomněli odstranit), abyste byli flexibilní pro návrh primeru pro plazmidy s N-terminálními nebo C-terminálními značkami.
-vyberte si z více než 20 různých míst pro restrikční enzymy, klonování Golden Gate je podporováno prostřednictvím BsaI a BsbI, můžete dokonce zadat přesah
-Získejte varovné zprávy, pokud by vámi vybraný enzym přerušil zadanou sekvenci
-maximální flexibilita díky možnosti restrikčních enzymů 'jiné', zadejte své místo pro restrikční enzym, pokud není v seznamu - jsou podporovány nepalindromické sekvence! Pokud je zadané místo restrikce přítomno ve vámi zadané sekvenci nebo v opačném doplňku, zobrazí se varovná zpráva!
-získáte varovnou zprávu, abyste se vyhnuli běžným chybám při kopírování a vkládání, pokud zadaná sekvence obsahuje neúplný kodon!
-zahrnout sekvenci KOZAK do dopředného primeru, pokud jej chcete
-vyberte, zda potřebujete startovací kodon a zda potřebujete stop kodon (lze vybrat všechny 3 běžné stop kodony)
-zadejte teplotu tání pro vaše základní nátěry, vypočítá se pomocí teploty tání upravené soli
- zadejte koncentraci soli (Na+)
-zadejte 5'-end prodloužení pro oba vaše primery
-primery jsou generovány tak, aby končily G nebo C
-tavení Zobrazí se teplota, obsah G/C a délka primeru
-transparentní proces navrhování! zobrazí se všechny mezikroky! Vámi vybrané možnosti se zobrazí pod konečnými výsledky!
- tlačítko kopírovat pro zkopírování celého výstupu a jeho odeslání e-mailem na váš stolní počítač pro další návrhové kroky nebo jej uložit jako soubor!
-Aktualizace verze 0.03: nová funkce 'DeletionIn': pomáhá vám navrhnout primery pro překrývající se extenzní PCR pro odstranění specifických vnitřních oblastí ze sekvence (např. odstranění domén)
-Aktualizace verze 0.045: nová funkce 'Mutace' vám pomůže navrhnout primery pro překryvnou extenzní PCR pro mutaci specifického kodonu ve vaší sekvenci tak, aby kódoval jinou aminokyselinu
- Aktualizace verze 0.060: nová funkce: 'DeletionNC' - pomáhá vám navrhnout primery pro odstranění N(5')- nebo C(3')-terminálních oblastí z vaší sekvence
-Aktualizace verze 0.080: nová funkce: 'Insertion' - přejeďte doleva v horní hlavní nabídce a najděte nápovědu pro návrh primerů pro překryvnou extenzní PCR pro vložení sekvence inzertu do vaší sekvence
- Aktualizace verze 0.085: nová Funkce: 'Nahradit' - přejetím doleva v horní hlavní nabídce získáte nápovědu pro návrh primerů pro překryvnou extenzní PCR, které nahrazují vnitřní oblast zadanou sekvencí inzertu
Upozornění: mobilní aplikace Easy Primer Design neposkytuje sekvence primerů připravené k použití, podporuje vás pouze během procesu návrhu primeru. Uživatel musí pečlivě ověřit správnost každé části generovaného výsledku a provést všechny další potřebné testy!
Šťastné klonování! -Doufám, že to pomůže :)
Datum aktualizace
Bezpečnost začíná pochopením toho, jak vývojáři shromažďují a sdílejí vaše data. Postupy ochrany soukromí a zabezpečení dat se mohou lišit podle způsobu používání, oblasti a věku. Tyto informace poskytl vývojář a může je průběžně aktualizovat.
S třetími stranami nejsou sdílena žádná data
Další informace o tom, jak vývojáři deklarují sdílení
Aplikace neshromažďuje žádná data
Další informace o tom, jak vývojáři deklarují shromažďování
Novinky
Update for current Android versions
minor bug fixes
minor bug fixes
Podpora aplikace
O vývojáři
Nikolas Furthmann
easyprimerdesign@gmail.com
Germany
undefined
