Prozkoumejte hladiny genové exprese v různých buňkách imunitního systému myší. Začněte zadáním názvu genu (nebo aliasu) do vyhledávacího pole, abyste viděli seznam zásahů, kterými můžete procházet.
Vyhledávání zobrazí "čárový kód teplotní mapy", který ukazuje, jak horká nebo studená je exprese tohoto genu v různých buněčných liniích imunitního systému (B buňky, T buňky, myeloidní buňky atd.). Přepínání mezi datovými sadami generovanými na 2 různých platformách: RNAseq a microarray.
Stisknutím ikony buněčné linie zobrazíte stejná data výrazu vizualizovaná jako sloupcový graf. Pomocí nabídky nastavení vpravo nahoře můžete přepínat mezi log a lineární osou. V datech microarray jsou nízké hodnoty exprese částečně okludovány.
Pokud se vrátíte na hlavní obrazovku „čárového kódu teplotní mapy“, pokud místo toho stisknete tlačítko „Zobrazit související geny“, zobrazí se zobrazení „konstelace genů“. To ukazuje jeho nejvíce korelované geny v rámci určitých skupin populace. Ve výchozím nastavení je korelace zobrazena s ohledem na klíčové populace – to jsou klíčové populace v celém imunitním systému.
Kontaktujte prosím immgen@gmail.com pro zpětnou vazbu nebo požadavky na funkce!
Data jsou generována Immunological Genome Project, mezinárodním konsorciem podporovaným National Institutes of Health (NIAID).
Datum aktualizace
3. 7. 2023