GenoScore

Maxence Younsi

Informace o aplikaci

Genetické skórování (GenoScore: aplikace relativního skórování DNA) je aplikace pro Android, která hodnotí potenciální kombinace biologických příbuzných pomocí stupňovitého systému a algoritmu. Umožňuje výběr generických souprav STR a poskytuje barevně kódovaný indikátor, který naznačuje, zda je nutný další odběr nebo analýza. Zelená znamená, že není potřeba další odběr, oranžová doporučuje odběr od dalších příbuzných nebo použití dalších analýz a červená znamená nízký střední LR. Bodování je založeno na očekávaném středním LR pro každý scénář, upravené pro sadu STR a kombinaci příbuzných. GenoScore poskytuje návod, které příbuzné sbírat, ale skutečný výsledek případu poskytne pouze analýza DNA.

GenoScore je mobilní aplikace pro platformy Android. GenoScore hodnotí potenciální kombinace biologických příbuzných 1., 2. a 3. stupně na základě stupňovitého systému a skórovacího algoritmu, který zahrnuje více možných příbuzných, jako jsou manželé, nevlastní sourozenci a sestřenice. GenoScore umožňuje výběr generických souprav STR na základě očekávaného počtu lokusů v každé soupravě a přizpůsobení starším a novějším technologiím STR.
Aplikace poskytuje obecné skóre pro každého příbuzného nebo kombinaci příbuzných a převádí toto skóre do barevně označeného indikátoru (zelená, oranžová nebo červená), který naznačuje, zda je nutný další sběr biologických příbuzných nebo další analýzy STR.
Zelený indikátor ukazuje, že vybraní příbuzní a STR lokusy by typicky vedly k mediánu LR = 1 000 000 nebo vyšším a pravděpodobně není zapotřebí žádný další sběr dalších příbuzných. Medián LR 1 000 000 je ve většině případů velmi konzervativní a sběratelé/laboratoř by ho měli vzít v úvahu.
Žlutý indikátor indikuje, že vybraní příbuzní a STR lokusy by typicky vedly k mediánu LR = od 100 do ~999 999, a doporučuje se odebírat od dalších blízkých biologických příbuzných nebo použít další analýzy STR.
Červený indikátor znamená, že vybrané příbuzné a STR lokusy by typicky vedly k mediánu LR < 100.
Bodování rodokmenu/příbuzných je částečně založeno na předchozím systému bodování příbuzných, ale aktualizováno tak, aby zahrnovalo mnoho dalších možných příbuzných, jako jsou manželé (pokud jsou k dispozici děti), teta/strýc, neteř/synovec, nevlastní sourozenci a sestřenice, včetně jejich kombinací .
Bodování je založeno na očekávaném středním pravděpodobnostním poměru (LR) pro každý scénář původu upraveného pro každý typ soupravy STR. Jak sada STR, tak kombinace příbuzného (příbuzných) ovlivní očekávaný střední LR. Bodování je založeno na rozsáhlých simulacích provedených na mnoha rodokmenech, napříč více soupravami STR (dosud nepublikované).
Ačkoli GenoScore poskytuje praktické rady ohledně toho, které biologické příbuzné je nejvhodnější shromažďovat, uživatelé by měli předvídat řadu poměrů pravděpodobnosti pro každý scénář rodokmenu a pouze analýza a shoda DNA poskytne skutečný výsledek daného případu.

Novinky

Initial version. Fill, evaluate, save, edit and share via e-mail your relative scoring forms.