Mens de er ude på patrulje, finder Matman og Boy Wonder den onde Chronos, der udklækker en ny ondskabsordning med en tidskorrupter.
De springer ud i handling, angriber de hans loyale kronomitter - hopper, glider og kapoverer sig tættere på Chronos.
Ligesom de er ved at nå ham - ødelægger Chronos selv sin korruptur og spreder alle gennem tiden.
Hjælp Boy Wonder med at springe tilbage gennem tiden ved at samle tidsperlerne og sende Chronomites tilbage til hovedtidslinjen og i sidste ende besejre Chronos og redde Matman!