Plantsygdomsepidemiologi er undersøgelsen af sygdomme hos plantepopulationer. Ligesom sygdomme hos mennesker og andre dyr forekommer plantesygdomme på grund af patogener såsom bakterier, vira, svampe, oomycetes, nematoder, phytoplasmas, protozoer og parasitære planter. Plantsygdomsepidemiologer stræber efter en forståelse af årsagen og virkningerne af sygdommen og udvikler strategier til at gribe ind i situationer, hvor afgrødetab kan forekomme. Typisk vellykket indgriben vil føre til et lavt niveau af sygdom til at være acceptabelt afhængigt af værdien af afgrøden.
Plantsygdomsepidemiologi ses ofte fra en tværfaglig tilgang, der kræver biologiske, statistiske, agronomiske og økologiske perspektiver. Biologi er nødvendig for at forstå patogenet og dets livscyklus. Det er også nødvendigt for at forstå afgrødens fysiologi og hvordan patogenet påvirker den negativt. Agronomisk praksis har ofte indflydelse på sygdomsforekomst på godt og ondt. Økologiske påvirkninger er mange. Indfødte plantearter kan tjene som reservoirer for patogener, der forårsager sygdom i afgrøder. Statistiske modeller anvendes ofte for at sammenfatte og beskrive kompleksiteten af plantesygdomsepidemiologi, så sygdomsprocesser lettere kan forstås. For eksempel kan sammenligninger mellem sygdomsfremskridt med forskellige sygdomme, sorter, forvaltningsstrategier eller miljømæssige indstillinger hjælpe med at bestemme, hvordan plantesygdomme bedst kan håndteres. Politik kan være indflydelsesrig i forekomsten af sygdomme gennem handlinger såsom restriktioner på import fra kilder, hvor en sygdom opstår.