easy Primer Design
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Über diese App
easy Primer Design ist ein Tool, mit dem Sie Ihre PCR-Primer überall und zeiteffizient entwerfen können: am Labortisch, während Sie auf ein Experiment warten, auf dem Weg zur oder von der Arbeit oder im Büro. Fügen Sie einfach Ihre Nukleotidsequenz ein und geben Sie Ihre Anforderungen an, um Primersequenzen für Ihre PCR-Klonierungsanwendung zu generieren.
Merkmale:
-Verwenden Sie die Schaltfläche „Einfügen“, um Ihre Sequenz einzugeben. Das eingegebene CDS/die eingegebene Sequenz enthält Zahlen, Leerzeichen, Zeilenumbrüche, Groß- oder Kleinbuchstaben? Es spielt keine Rolle! easy Primer Design entfernt Zahlen, Leerzeichen und Zeilenumbrüche und wandelt alles in Großbuchstaben um!
- Geben Sie Ihre Sequenz ohne Start- und Stoppcodon ein (und erhalten Sie eine Warnmeldung, wenn Sie vergessen haben, eines davon zu entfernen), um beim Primerdesign für Plasmide mit N-terminalen oder C-terminalen Tags flexibel zu sein.
- Wählen Sie aus mehr als 20 verschiedenen Restriktionsenzymstellen, das Golden Gate-Klonen wird über BsaI und BsbI unterstützt, Sie können sogar den Überhang eingeben
-Erhalten Sie Warnmeldungen, wenn Ihr ausgewähltes Enzym Ihre eingegebene Sequenz schneiden würde
- maximale Flexibilität durch die Restriktionsenzym-Option „Sonstige“, geben Sie Ihre Restriktionsenzym-Site ein, falls diese nicht in der Liste enthalten ist – nicht-palindromische Sequenzen werden unterstützt! Wenn Ihre eingegebene Restriktionsstelle in Ihrer eingegebenen Sequenz oder in ihrem umgekehrten Komplement vorhanden ist, erhalten Sie eine Warnmeldung!
- Erhalten Sie eine Warnmeldung, um häufige Fehler beim Kopieren und Einfügen zu vermeiden, wenn Ihre eingegebene Sequenz ein unvollständiges Codon enthält!
- Fügen Sie eine KOZAK-Sequenz in den Vorwärtsprimer ein, wenn Sie eine möchten
-Wählen Sie, ob Sie ein Startcodon benötigen und ob Sie ein Stoppcodon benötigen (alle drei gemeinsamen Stoppcodons sind wählbar).
- Geben Sie eine Schmelztemperatur für Ihre Grundierungen ein. Diese wird anhand der salzangepassten Schmelztemperatur berechnet
- Geben Sie die Salzkonzentration (Na+) ein.
-Geben Sie für beide Primer eine 5'-Endverlängerung ein
-Primer werden so generiert, dass sie mit G oder C enden
-Schmelztemperatur, G/C-Gehalt und Primerlänge werden angezeigt
-Transparenter Designprozess! alle Zwischenschritte werden angezeigt! Ihre ausgewählten Optionen werden unter den Endergebnissen angezeigt!
Klicken Sie auf die Schaltfläche „Kopieren“, um die gesamte Ausgabe zu kopieren und sie für die nächsten Entwurfsschritte per E-Mail an Ihren Desktop-PC zu senden oder als Datei zu speichern!
-Update auf Version 0.03: Neue Funktion „DeletionIn“: hilft Ihnen beim Entwerfen von Primern für die Overlap-Extension-PCR, um bestimmte interne Regionen aus einer Sequenz zu löschen (z. B. Domänen löschen).
-Update auf Version 0.045: Die neue Funktion „Mutation“ hilft Ihnen beim Entwerfen von Primern für die Overlap-Extension-PCR, um ein bestimmtes Codon in Ihrer Sequenz zu mutieren, um für eine andere Aminosäure zu kodieren
-Update Version 0.060: Neue Funktion: „DeletionNC“ – hilft Ihnen beim Entwerfen von Primern zum Löschen von N(5')- oder C(3')-terminalen Regionen aus Ihrer Sequenz
-Update Version 0.080: Neue Funktion: „Einfügung“ – wischen Sie im oberen Hauptmenü nach links und finden Sie Hilfe zum Entwerfen von Primern für die Overlap-Extension-PCR, um eine Insert-Sequenz in Ihre Sequenz einzufügen
- Update auf Version 0.085: Neue Funktion: „Ersetzen“ – Wischen Sie im oberen Hauptmenü nach links, um Hilfe zum Entwerfen von Primern für die Overlap-Extension-PCR zu erhalten, die eine interne Region durch eine eingegebene Insert-Sequenz ersetzen
Bitte beachten Sie: Die mobile App „Easy Primer Design“ liefert keine gebrauchsfertigen Primer-Sequenzen, sondern unterstützt Sie nur während des Prozesses des Primer-Designs. Der Benutzer muss die Richtigkeit jedes Teils des generierten Ergebnisses sorgfältig überprüfen und alle anderen erforderlichen Tests durchführen!
Viel Spaß beim Klonen! -Ich hoffe es hilft :)
Merkmale:
-Verwenden Sie die Schaltfläche „Einfügen“, um Ihre Sequenz einzugeben. Das eingegebene CDS/die eingegebene Sequenz enthält Zahlen, Leerzeichen, Zeilenumbrüche, Groß- oder Kleinbuchstaben? Es spielt keine Rolle! easy Primer Design entfernt Zahlen, Leerzeichen und Zeilenumbrüche und wandelt alles in Großbuchstaben um!
- Geben Sie Ihre Sequenz ohne Start- und Stoppcodon ein (und erhalten Sie eine Warnmeldung, wenn Sie vergessen haben, eines davon zu entfernen), um beim Primerdesign für Plasmide mit N-terminalen oder C-terminalen Tags flexibel zu sein.
- Wählen Sie aus mehr als 20 verschiedenen Restriktionsenzymstellen, das Golden Gate-Klonen wird über BsaI und BsbI unterstützt, Sie können sogar den Überhang eingeben
-Erhalten Sie Warnmeldungen, wenn Ihr ausgewähltes Enzym Ihre eingegebene Sequenz schneiden würde
- maximale Flexibilität durch die Restriktionsenzym-Option „Sonstige“, geben Sie Ihre Restriktionsenzym-Site ein, falls diese nicht in der Liste enthalten ist – nicht-palindromische Sequenzen werden unterstützt! Wenn Ihre eingegebene Restriktionsstelle in Ihrer eingegebenen Sequenz oder in ihrem umgekehrten Komplement vorhanden ist, erhalten Sie eine Warnmeldung!
- Erhalten Sie eine Warnmeldung, um häufige Fehler beim Kopieren und Einfügen zu vermeiden, wenn Ihre eingegebene Sequenz ein unvollständiges Codon enthält!
- Fügen Sie eine KOZAK-Sequenz in den Vorwärtsprimer ein, wenn Sie eine möchten
-Wählen Sie, ob Sie ein Startcodon benötigen und ob Sie ein Stoppcodon benötigen (alle drei gemeinsamen Stoppcodons sind wählbar).
- Geben Sie eine Schmelztemperatur für Ihre Grundierungen ein. Diese wird anhand der salzangepassten Schmelztemperatur berechnet
- Geben Sie die Salzkonzentration (Na+) ein.
-Geben Sie für beide Primer eine 5'-Endverlängerung ein
-Primer werden so generiert, dass sie mit G oder C enden
-Schmelztemperatur, G/C-Gehalt und Primerlänge werden angezeigt
-Transparenter Designprozess! alle Zwischenschritte werden angezeigt! Ihre ausgewählten Optionen werden unter den Endergebnissen angezeigt!
Klicken Sie auf die Schaltfläche „Kopieren“, um die gesamte Ausgabe zu kopieren und sie für die nächsten Entwurfsschritte per E-Mail an Ihren Desktop-PC zu senden oder als Datei zu speichern!
-Update auf Version 0.03: Neue Funktion „DeletionIn“: hilft Ihnen beim Entwerfen von Primern für die Overlap-Extension-PCR, um bestimmte interne Regionen aus einer Sequenz zu löschen (z. B. Domänen löschen).
-Update auf Version 0.045: Die neue Funktion „Mutation“ hilft Ihnen beim Entwerfen von Primern für die Overlap-Extension-PCR, um ein bestimmtes Codon in Ihrer Sequenz zu mutieren, um für eine andere Aminosäure zu kodieren
-Update Version 0.060: Neue Funktion: „DeletionNC“ – hilft Ihnen beim Entwerfen von Primern zum Löschen von N(5')- oder C(3')-terminalen Regionen aus Ihrer Sequenz
-Update Version 0.080: Neue Funktion: „Einfügung“ – wischen Sie im oberen Hauptmenü nach links und finden Sie Hilfe zum Entwerfen von Primern für die Overlap-Extension-PCR, um eine Insert-Sequenz in Ihre Sequenz einzufügen
- Update auf Version 0.085: Neue Funktion: „Ersetzen“ – Wischen Sie im oberen Hauptmenü nach links, um Hilfe zum Entwerfen von Primern für die Overlap-Extension-PCR zu erhalten, die eine interne Region durch eine eingegebene Insert-Sequenz ersetzen
Bitte beachten Sie: Die mobile App „Easy Primer Design“ liefert keine gebrauchsfertigen Primer-Sequenzen, sondern unterstützt Sie nur während des Prozesses des Primer-Designs. Der Benutzer muss die Richtigkeit jedes Teils des generierten Ergebnisses sorgfältig überprüfen und alle anderen erforderlichen Tests durchführen!
Viel Spaß beim Klonen! -Ich hoffe es hilft :)
Aktualisiert am
Was die Sicherheit angeht, solltest du als Erstes verstehen, wie Entwickler deine Daten erheben und weitergeben. Die Datenschutz- und Sicherheitspraktiken können je nach deiner Verwendung, deiner Region und deinem Alter variieren. Diese Informationen wurden vom Entwickler zur Verfügung gestellt und können jederzeit von ihm geändert werden.
Keine Daten werden mit Drittunternehmen oder -organisationen geteilt
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Neuigkeiten
-New Feature: Replace - swipe left in the top main menu to get help for designing primers for overlap extension PCR, that replace an internal region with an entered insert-sequence
-help section updated
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