ImmGen
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Acerca de esta app
Explore los niveles de expresión génica en diferentes células del sistema inmunitario de ratones. Comience ingresando un nombre de gen (o alias) en la barra de búsqueda para ver una lista de aciertos que puede recorrer.
La búsqueda mostrará un "código de barras de mapa de calor" que muestra qué tan caliente o fría es la expresión de ese gen en diferentes linajes de células del sistema inmunitario (células B, células T, células mieloides, etc.). Alterne entre conjuntos de datos generados en 2 plataformas diferentes: RNAseq y microarray.
Presione hacia abajo en un icono de linaje de celda para ver los mismos datos de expresión visualizados como un gráfico de barras. Utilice el menú de configuración en la parte superior derecha para alternar entre un registro y un eje lineal. En los datos de micromatrices, los valores de expresión bajos están parcialmente ocluidos.
De vuelta en la pantalla principal de "código de barras del mapa de calor", si en su lugar presiona el botón "Mostrar genes relacionados", verá una vista de "constelación de genes". Esto muestra sus genes más correlacionados dentro de ciertos grupos de población. De forma predeterminada, la correlación se muestra con respecto a las poblaciones clave: estas son poblaciones clave en todo el sistema inmunitario.
Comuníquese con immgen@gmail.com para recibir comentarios o solicitar funciones.
Los datos son generados por el Proyecto Genoma Inmunológico, un consorcio internacional respaldado por los Institutos Nacionales de Salud (NIAID).
La búsqueda mostrará un "código de barras de mapa de calor" que muestra qué tan caliente o fría es la expresión de ese gen en diferentes linajes de células del sistema inmunitario (células B, células T, células mieloides, etc.). Alterne entre conjuntos de datos generados en 2 plataformas diferentes: RNAseq y microarray.
Presione hacia abajo en un icono de linaje de celda para ver los mismos datos de expresión visualizados como un gráfico de barras. Utilice el menú de configuración en la parte superior derecha para alternar entre un registro y un eje lineal. En los datos de micromatrices, los valores de expresión bajos están parcialmente ocluidos.
De vuelta en la pantalla principal de "código de barras del mapa de calor", si en su lugar presiona el botón "Mostrar genes relacionados", verá una vista de "constelación de genes". Esto muestra sus genes más correlacionados dentro de ciertos grupos de población. De forma predeterminada, la correlación se muestra con respecto a las poblaciones clave: estas son poblaciones clave en todo el sistema inmunitario.
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- New human RNA-seq data
- Various small improvements
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ImmGen@hms.harvard.edu
25 Shattuck St
Boston, MA 02115
United States
+1 617-432-7741
