Uurige geeniekspressiooni taset erinevates hiire immuunsüsteemi rakkudes. Alustuseks sisestage otsinguribale geeninimi (või pseudonüüm), et näha tabamuste loendit, mille kaudu saate pühkida.
Otsing kuvab "soojuskaardi vöötkoodi", mis näitab, kui kuum või külm on selle geeni ekspressioon erinevates immuunsüsteemi rakuliinides (B-rakud, T-rakud, müeloidrakud jne). Lülitage kahel erineval platvormil loodud andmekogumite vahel: RNAseq ja microarray.
Vajutage rakuliini ikooni, et näha samu väljendusandmeid tulpdiagrammina. Logi ja lineaartelje vahel vahetamiseks kasutage paremas ülanurgas olevat seadete menüüd. Mikrokiibi andmetes on madalad ekspressiooniväärtused osaliselt varjatud.
Kui vajutate tagasi põhiekraanile "soojuskaardi vöötkood", kui vajutate selle asemel nuppu "Kuva seotud geenid", näete "geenide tähtkuju" vaadet. See näitab selle kõige enam korrelatsioonis olevaid geene teatud populatsioonirühmades. Vaikimisi näidatakse korrelatsiooni võtmepopulatsioonide suhtes – need on võtmepopulatsioonid kogu immuunsüsteemis.
Tagasiside või funktsioonitaotluste saamiseks võtke ühendust aadressil immgen@gmail.com!
Andmed genereerib Immunological Genome Project, rahvusvaheline konsortsium, mida toetab National Institutes of Health (NIAID).
Värskendatud:
3. juuli 2023