Partioidessaan Matman ja Boy Wonder löytävät pahan Chronosin, joka hauduttaa uuden pahan järjestelmän aikakorruptoituneen kanssa.
Astuessaan toimintaan he hyökkäävät hänen uskollisille kronomiteilleen - hyppäämällä, liu'uttamalla ja kaappaamalla matkansa lähemmäksi Chronosia.
Aivan kuin he tavoittavat hänet - Chronos itse tuhoaa aikansa korruptoituneeksi ja hajottaa kaikki ajan myötä.
Auta Boy Wonderia hyppäämään ajassa taaksepäin keräämällä aikajalokiviä ja lähettämällä kronomitit takaisin pääajaajalle, ja lopulta voittamaan Chronos ja pelastamaan Matman!