Syvä, synkkä alamaailma on paikka, jossa kauan sitten hylätyn teknologian jäänteet ja kadonneen taikuuden jäljet elävät rinnakkain. Ohuen maanalaisen kehittynyt mekaaninen sivilisaatio ja syvän maanalaisen salaperäinen sieluenergia ovat kehittyneet eri tavoin, mutta eräänä päivänä syvässä 'Raulissa' syntynyt paha henki Magellan alkaa ajaa koko maanalaisen kaaokseen. Vaikutus ulottuu valon pyhäkköön, Luminarieen, ja alamaailman "valo" katoaa vähitellen.
Pelaaja lähtee matkalle taistelemaan Magellanin pimeyttä vastaan Sirenin ympärille kokoontuneiden 'Drill Girls'ien kanssa. Intohimoisilla slummejen sotureilla, sielumiekkoja käyttävillä salaperäisillä olennoilla, myrkyllisistä alueista selviytyneillä, jäävelhoilla, mekaanikoilla, tiedemiehillä, ninjoilla ja muilla ainutlaatuisilla tytöillä on oma menneisyytensä, taistelutyylinsä ja tavoitteensa, ja ne puhdistavat pimeyttä tehokkailla pora-aseilla ja ainutlaatuisilla kyvyillä.
Peli pyörii ainutlaatuisen maailmankuvan ympärillä, jossa toiminta ja strategia, tiede ja magia sekä menneisyys ja tulevaisuus kohtaavat. Kun pelaajat tutkivat jokaista aluetta, he kokevat taisteluita, joissa yhdistyvät koneisto ja taikuutta, ja pääsevät vähitellen lähemmäs totuutta hahmojen välisten suhteiden ja tarinoiden kautta. Vaihtuva maanalainen maisema ja eri persoonallisuudet omaavat hahmot tarjoavat pelaajille syvän uppoamisen tunteen.