Alien Xonix on, kuten nimestä voi päätellä, arcade-pulmapeli, joka on luotu legendaarisen Xonix-pelin vaikutuksen alaisena, mutta alienien värillä ja lisäelementeillä, jotka estävät tätä peliä kutsumasta toiseksi kasvottomaksi Xonix-klooniksi.
Alien Xonixin juonen mukaan olet asuttamassa planeettaa syvässä avaruudessa. Valitettavasti jalo tehtäväsi ei miellytä kaikkia. Erityisesti vihamieliset muukalaiset häiritsevät sinua aktiivisesti.
Ehkä tällä on jotain tekemistä sen kanssa, että et vain halua tehdä tästä planeetasta kotisi, vaan myös kerätä aktiivisesti korvaamattomia resursseja, joita muukalaiset pitävät omakseen, joten he haluavat tuhota sinut.
Tämä taistelu tulee olemaan jännittävä, sillä siirtyäksesi seuraavalle tasolle sinun on kerättävä kartta tästä planeettasta, muukalaisten kristalleja ja asutettava tarpeeksi maata välttäen huolellisesti muukalaisia ja heidän vaarallisia ansojaan. Palkintona jokaisen tason lopussa löydät mehukkaita kuvia tältä tuntemattomalta planeetalta.
Alkuperäinen konsepti ei muuten kuulu Xonixille, vaan toiseen Japanissa kehitettyyn peliin (Qix). Siitä huolimatta Xonixista tuli suosittu kaikkialla maailmassa, mikä synnytti kokonaisen videopelilajin.