Helix Jumpin päätavoite on ohjata pomppiva pallo kierteisen tornisokkelon läpi ja päästä pohjaan.
Pelaajat ohjaavat pallon suuntaa pyyhkäisemällä vasemmalle tai oikealle näytöllä. Muita ohjaimia ei ole, joten se on helppo ottaa ja pelata.
Torni koostuu erivärisistä alustoista, ja pelaajan on navigoitava pallo näiden alustojen aukkojen läpi. Jos pallo osuu alustaan, se rikkoutuu ja pelaaja jatkaa pomppimista alaspäin.
Pisteitä ansaitaan, kun pallo etenee sokkelossa. Useiden alustojen rikkominen yhdessä putoamisessa tai erityisille alustoille laskeutuminen voi lisätä pisteitä.
Helix Jump sisältää loputtoman pelattavuuden, mikä tarkoittaa, että perimmäistä tavoitetta tai viimeistä tasoa ei ole. Pelaajat jatkavat pelaamista ja yrittävät voittaa omat huippupisteensä.