Koledž inženjerstva, Anantapur, pokrenut je u Guindyju, Madras 1946. i premješten u Anantapur 1948. Koledž je isprva bio pridružen Sveučilištu Madras tijekom 1946.-1955. i Sveučilištu Sri Venkateswara, Tirupathi tijekom 1955.-1972. Godine 1972., Zakonom državnog zakonodavstva, JNT Sveučilište je osnovano u Hyderabadu, a College of Engineering, Anantapur je otišao u okrilje JNTU. Kasnije u 2008., Zakonom državnog zakonodavstva AP, JNTU je podijeljen u tri neovisna sveučilišta, naime, JNTU, Hyderabad, JNTU, Kakinada i JNTU Anantapur. JNTU College of Engineering, Anantapur postao je sastavni koledž JNTUA i preimenovan je u JNTUA College of Engineering, Anantapur.