easy Primer Design

easy Primer Design

このアプリについて

easy Primer Design は、実験を待つベンチ、通勤中、オフィスからの移動中など、どこでも時間効率よく PCR プライマーをデザインできるツールです。ヌクレオチド配列を貼り付けて要件を指定するだけで、PCR クローニング アプリケーション用のプライマー配列を生成できます。

特徴：
-ペーストボタンを使用してシーケンスを入力します。入力された CDS/シーケンスには、数字、スペース、改行、大文字または小文字が含まれていますか?それは問題ではありません！ easy Primer Design は数字、スペース、改行を削除し、すべてを大文字に変更します。
- N 末端タグまたは C 末端タグを持つプラスミドのプライマー設計に柔軟に対応できるように、開始コドンと終止コドンを含まない配列を入力します (いずれかの削除を忘れた場合は警告メッセージが表示されます)。
- 20 を超える異なる制限酵素サイトから選択、ゴールデン ゲート クローニングは BsaI および BsbI 経由でサポートされ、オーバーハングに入力することもできます
-選択した酵素が入力した配列を切断する場合の警告メッセージを取得します
- 制限酵素オプション「other」による最大の柔軟性、リストにない場合は制限酵素サイトを入力 - 非回文配列もサポートされています。入力した制限部位が入力した配列またはその逆相補配列に存在する場合は、警告メッセージが表示されます。
- 入力した配列に不完全なコドンが含まれている場合、一般的な「コピー＆ペースト」エラーを回避するための警告メッセージが表示されます。
-必要に応じてフォワードプライマーにKOZAK配列を含めます
- 開始コドンが必要かどうか、および停止コドンが必要かどうかを選択します (3 つの一般的な停止コドンがすべて選択可能です)
- プライマーの融解温度を入力します。塩調整された融解温度を使用して計算されます。
-塩分濃度（Na+）を入力します
-両方のプライマーの 5' 末端拡張子を入力します
- プライマーは G または C で終わるように生成されます
-融解温度、G/C含有量、プライマー長が表示されます
-透明な設計プロセス!すべての中間ステップが表示されます。選択したオプションが最終結果の下に表示されます。
- コピー ボタンを使用して出力全体をコピーし、次の設計ステップのために電子メールでデスクトップ PC に送信するか、ファイルとして保存します。
-バージョン 0.03 アップデート: 新機能「DeletionIn」: 配列から特定の内部領域を削除する (ドメインの削除など) オーバーラップ エクステンション PCR 用のプライマーを設計するのに役立ちます。
-バージョン 0.045 アップデート: 新機能「ミューテーション」は、配列内の特定のコドンを変異させて別のアミノ酸をコードするオーバーラップ エクステンション PCR 用のプライマーを設計するのに役立ちます。
-バージョン 0.060 アップデート: 新機能: 「DeletionNC」 - 配列から N(5') または C(3') 末端領域を削除するプライマーの設計に役立ちます。
- バージョン 0.080 アップデート: 新機能: 「挿入」 - 上部のメイン メニューを左にスワイプすると、配列に挿入配列を挿入するためのオーバーラップ エクステンション PCR 用のプライマー設計に関するヘルプが表示されます。
- バージョン 0.085 アップデート: 新機能: 「置換」 - 上部のメイン メニューを左にスワイプすると、内部領域を入力された挿入配列で置き換えるオーバーラップ エクステンション PCR 用のプライマー設計のヘルプが表示されます。

注意してください: easy Primer Design モバイル アプリは、すぐに使用できるプライマー シーケンスを提供するものではなく、プライマー設計のプロセス中にのみサポートします。ユーザーは、生成された結果のすべての部分が正しいことを注意深く検証し、その他の必要なテストをすべて実行する必要があります。

クローン作成を成功させましょう! -それが役に立てば幸い ：）

新機能

Update for current Android versions
minor bug fixes