გამოიკვლიეთ გენის გამოხატვის დონე თაგვის იმუნური სისტემის სხვადასხვა უჯრედებში. დაიწყეთ გენის სახელის (ან მეტსახელის) შეყვანით საძიებო ზოლში, რათა ნახოთ იმ ჰიტების სია, რომლებითაც შეგიძლიათ გადაფურცლეთ.
ძიება აჩვენებს "სითბოს რუქის შტრიხ-კოდს", რომელიც გვიჩვენებს, თუ როგორია ამ გენის ცხელი ან ცივი გამოხატულება იმუნური სისტემის უჯრედების სხვადასხვა ხაზებში (B უჯრედები, T უჯრედები, მიელოიდური უჯრედები და ა.შ.). გადართეთ მონაცემთა ნაკრებებს შორის, რომლებიც გენერირებულია 2 სხვადასხვა პლატფორმაზე: RNAseq და microarray.
დააჭირეთ ქვემოთ უჯრედის ხაზის ხატულას, რომ ნახოთ იგივე გამოხატვის მონაცემები ვიზუალურად, როგორც სვეტოვანი დიაგრამა. გამოიყენეთ პარამეტრების მენიუ ზედა მარჯვენა კუთხეში, რათა გადახვიდეთ ჟურნალსა და ხაზოვან ღერძს შორის. მიკრომასივების მონაცემებში დაბალი გამოხატვის მნიშვნელობები ნაწილობრივ დაბლოკილია.
დაბრუნდით მთავარ "სითბოს რუქის შტრიხკოდის" ეკრანზე, თუ სანაცვლოდ დააჭირეთ ღილაკს "დაკავშირებული გენების ჩვენება", დაინახავთ "გენების თანავარსკვლავედის" ხედს. ეს აჩვენებს მის ყველაზე კორელაციურ გენებს პოპულაციის გარკვეულ ჯგუფებში. ნაგულისხმევად, კორელაცია ნაჩვენებია ძირითად პოპულაციებთან მიმართებაში - ეს არის ძირითადი პოპულაციები მთელ იმუნურ სისტემაში.
გთხოვთ, დაუკავშირდეთ immgen@gmail.com გამოხმაურების ან ფუნქციის მოთხოვნებისთვის!
მონაცემები გენერირებულია იმუნოლოგიური გენომის პროექტის მიერ, საერთაშორისო კონსორციუმი, რომელსაც მხარს უჭერს ჯანმრთელობის ეროვნული ინსტიტუტი (NIAID).