easy Primer Design
100+
Atsisiuntimai
Visiems
info
Apie šią programą
Easy Primer Design yra įrankis, padedantis sukurti PGR pradmenis bet kur ir efektyviai naudoti laiką: ant stendo, kol laukiate eksperimento, keliaujate į darbą, iš darbo ar biure. Tiesiog įklijuokite savo nukleotidų seką ir nurodykite reikalavimus, kad sukurtumėte pradmenų sekas jūsų PGR klonavimo programai.
Funkcijos:
- Norėdami įvesti savo seką, naudokite įklijavimo mygtuką. Įvestame CDS / sekoje yra skaičiai, tarpai, eilučių lūžiai, didžiosios arba mažosios raidės? Tai nesvarbu! Easy Primer Design pašalina skaičius, tarpus ir eilučių pertraukas ir viską pakeičia į didžiąsias raides!
- Įveskite savo seką be pradžios ir pabaigos kodono (ir gaukite įspėjamąjį pranešimą, jei pamiršote vieną iš jų pašalinti), kad būtų lankstus pradmenų projektavimas plazmidėms su N-galo arba C-galo žymomis.
-Pasirinkite iš daugiau nei 20 skirtingų restrikcijos fermentų vietų, Golden Gate klonavimas palaikomas per BsaI ir BsbI, netgi galite patekti į iškyšą
-Gaukite įspėjimo pranešimus, jei jūsų pasirinktas fermentas nutrauktų jūsų įvestą seką
- Maksimalus lankstumas naudojant restrikcijos fermento parinktį „kita“, įveskite savo restrikcijos fermento vietą, jei jos nėra sąraše – palaikomos nepalindrominės sekos! Jei įvesta ribojimų svetainė yra jūsų įvestoje sekoje arba jos atvirkštiniame papildyme, gausite įspėjamąjį pranešimą!
-Gaukite įspėjamąjį pranešimą, kad išvengtumėte įprastų „copy-paste“ klaidų, jei įvestoje sekoje yra neužbaigtas kodonas!
- Jei norite, įtraukite KOZAK seką į pirminį pradmenį
- pasirinkite, ar jums reikia pradžios kodono, o jei jums reikia Stop kodono (galimi pasirinkti visi 3 įprastiniai kodonai)
- Įveskite pradmenų lydymosi temperatūrą, kuri apskaičiuojama naudojant druskos sureguliuotą lydymosi temperatūrą
- įveskite druskos koncentraciją (Na+)
- Įveskite abiejų pradmenų 5' galo plėtinį
- generuojami pradmenys, kurie baigiasi G arba C
- Rodoma lydymosi temperatūra, G/C kiekis ir grunto ilgis
- Skaidrus projektavimo procesas! rodomi visi tarpiniai žingsniai! Jūsų pasirinktos parinktys rodomos po galutiniais rezultatais!
-kopijuoti mygtuką, kad nukopijuotumėte visą išvestį ir išsiųstumėte ją el. paštu į savo stalinį kompiuterį tolesniems projektavimo žingsniams arba išsaugotumėte kaip failą!
- 0.03 versijos naujinimas: nauja funkcija „DeletionIn“: padeda sukurti pradmenis, skirtus sutapimo išplėtimui PGR, kad iš sekos būtų ištrinti tam tikri vidiniai regionai (pvz., ištrinti domenus)
- 0.045 versijos atnaujinimas: nauja funkcija „Mutacija“ padeda sukurti pradmenis, skirtus sutapimo išplėtimo PGR, kad mutuotų konkretus kodonas jūsų sekoje, kad būtų koduojama kita aminorūgštis
- 0.060 versijos atnaujinimas: nauja funkcija: „DeletionNC“ – padeda sukurti pradmenis, kad iš savo sekos būtų pašalintos N(5') arba C(3') galinės dalys
– 0.080 versijos naujinimas: nauja funkcija: „Įterpimas“ – viršutiniame pagrindiniame meniu braukite kairėn ir raskite pagalbos kuriant pradmenis, skirtus sutapimo išplėtimo PGR, kad į savo seką įterptumėte įterpimo seką
– 0.085 versijos naujinimas: nauja funkcija: „Pakeisti“ – viršutiniame pagrindiniame meniu braukite kairėn, kad gautumėte pagalbos kuriant pradmenis, skirtus sutapimo išplėtimo PGR, kurie pakeičia vidinę sritį įvestu įterpimo seka
Atkreipkite dėmesį: „easy Primer Design“ programa mobiliesiems nepateikia paruoštų naudoti pradmenų sekų, ji palaiko tik pradmenų projektavimo procesą. Vartotojas turi atidžiai patikrinti kiekvienos sugeneruoto rezultato dalies teisingumą ir atlikti visus kitus būtinus testus!
Laimingo klonavimo! - Tikiuosi padės :)
Funkcijos:
- Norėdami įvesti savo seką, naudokite įklijavimo mygtuką. Įvestame CDS / sekoje yra skaičiai, tarpai, eilučių lūžiai, didžiosios arba mažosios raidės? Tai nesvarbu! Easy Primer Design pašalina skaičius, tarpus ir eilučių pertraukas ir viską pakeičia į didžiąsias raides!
- Įveskite savo seką be pradžios ir pabaigos kodono (ir gaukite įspėjamąjį pranešimą, jei pamiršote vieną iš jų pašalinti), kad būtų lankstus pradmenų projektavimas plazmidėms su N-galo arba C-galo žymomis.
-Pasirinkite iš daugiau nei 20 skirtingų restrikcijos fermentų vietų, Golden Gate klonavimas palaikomas per BsaI ir BsbI, netgi galite patekti į iškyšą
-Gaukite įspėjimo pranešimus, jei jūsų pasirinktas fermentas nutrauktų jūsų įvestą seką
- Maksimalus lankstumas naudojant restrikcijos fermento parinktį „kita“, įveskite savo restrikcijos fermento vietą, jei jos nėra sąraše – palaikomos nepalindrominės sekos! Jei įvesta ribojimų svetainė yra jūsų įvestoje sekoje arba jos atvirkštiniame papildyme, gausite įspėjamąjį pranešimą!
-Gaukite įspėjamąjį pranešimą, kad išvengtumėte įprastų „copy-paste“ klaidų, jei įvestoje sekoje yra neužbaigtas kodonas!
- Jei norite, įtraukite KOZAK seką į pirminį pradmenį
- pasirinkite, ar jums reikia pradžios kodono, o jei jums reikia Stop kodono (galimi pasirinkti visi 3 įprastiniai kodonai)
- Įveskite pradmenų lydymosi temperatūrą, kuri apskaičiuojama naudojant druskos sureguliuotą lydymosi temperatūrą
- įveskite druskos koncentraciją (Na+)
- Įveskite abiejų pradmenų 5' galo plėtinį
- generuojami pradmenys, kurie baigiasi G arba C
- Rodoma lydymosi temperatūra, G/C kiekis ir grunto ilgis
- Skaidrus projektavimo procesas! rodomi visi tarpiniai žingsniai! Jūsų pasirinktos parinktys rodomos po galutiniais rezultatais!
-kopijuoti mygtuką, kad nukopijuotumėte visą išvestį ir išsiųstumėte ją el. paštu į savo stalinį kompiuterį tolesniems projektavimo žingsniams arba išsaugotumėte kaip failą!
- 0.03 versijos naujinimas: nauja funkcija „DeletionIn“: padeda sukurti pradmenis, skirtus sutapimo išplėtimui PGR, kad iš sekos būtų ištrinti tam tikri vidiniai regionai (pvz., ištrinti domenus)
- 0.045 versijos atnaujinimas: nauja funkcija „Mutacija“ padeda sukurti pradmenis, skirtus sutapimo išplėtimo PGR, kad mutuotų konkretus kodonas jūsų sekoje, kad būtų koduojama kita aminorūgštis
- 0.060 versijos atnaujinimas: nauja funkcija: „DeletionNC“ – padeda sukurti pradmenis, kad iš savo sekos būtų pašalintos N(5') arba C(3') galinės dalys
– 0.080 versijos naujinimas: nauja funkcija: „Įterpimas“ – viršutiniame pagrindiniame meniu braukite kairėn ir raskite pagalbos kuriant pradmenis, skirtus sutapimo išplėtimo PGR, kad į savo seką įterptumėte įterpimo seką
– 0.085 versijos naujinimas: nauja funkcija: „Pakeisti“ – viršutiniame pagrindiniame meniu braukite kairėn, kad gautumėte pagalbos kuriant pradmenis, skirtus sutapimo išplėtimo PGR, kurie pakeičia vidinę sritį įvestu įterpimo seka
Atkreipkite dėmesį: „easy Primer Design“ programa mobiliesiems nepateikia paruoštų naudoti pradmenų sekų, ji palaiko tik pradmenų projektavimo procesą. Vartotojas turi atidžiai patikrinti kiekvienos sugeneruoto rezultato dalies teisingumą ir atlikti visus kitus būtinus testus!
Laimingo klonavimo! - Tikiuosi padės :)
Atnaujinta
Norint užtikrinti saugą pirmiausia reikia suprasti, kaip kūrėjai renka ir bendrina jūsų duomenis. Duomenų privatumo ir saugos praktika gali skirtis, atsižvelgiant į jūsų naudojimą, regioną ir amžių. Kūrėjas pateikė šią informaciją ir gali atnaujinti per laiką.
Jokie duomenys nėra bendrinami su trečiosiomis šalimis
Sužinokite daugiau, kaip kūrėjai apibrėžia bendrinimą
Nerenkami jokie duomenys
Sužinokite daugiau, kaip kūrėjai apibrėžia rinkimą
Kas naujo
Update for current Android versions
minor bug fixes
minor bug fixes
Programos palaikymas
Apie kūrėją
Nikolas Furthmann
easyprimerdesign@gmail.com
Germany
undefined
