Izpētiet gēnu ekspresijas līmeņus dažādās peles imūnsistēmas šūnās. Sāciet, ievadot gēna nosaukumu (vai aizstājvārdu) meklēšanas joslā, lai skatītu trāpījumu sarakstu, kurā varat pārvilkt.
Veicot meklēšanu, tiks parādīts "siltuma kartes svītrkods", kas parāda, cik karsta vai auksta ir šī gēna ekspresija dažādās imūnsistēmas šūnu līnijās (B šūnās, T šūnās, mieloīdās šūnās utt.). Pārslēdzieties starp datu kopām, kas ģenerētas 2 dažādās platformās: RNAseq un microarray.
Nospiediet uz leju šūnu līnijas ikonas, lai redzētu tos pašus izteiksmes datus, kas vizualizēti kā joslu diagramma. Izmantojiet iestatījumu izvēlni augšējā labajā stūrī, lai pārslēgtos starp žurnāla asi un lineāro asi. Mikromasīva datos zemas izteiksmes vērtības ir daļēji aizsegtas.
Atgriežoties galvenajā “siltumkartes svītrkoda” ekrānā, nospiežot pogu “Rādīt saistītos gēnus”, tiks parādīts skats “gēnu konstelācija”. Tas parāda tās visvairāk korelētos gēnus noteiktās iedzīvotāju grupās. Pēc noklusējuma korelācija tiek parādīta attiecībā uz galvenajām populācijām — tās ir galvenās populācijas visā imūnsistēmā.
Lūdzu, sazinieties ar immgen@gmail.com, lai saņemtu atsauksmes vai funkciju pieprasījumus!
Datus ģenerē Imunoloģiskā genoma projekts, starptautisks konsorcijs, ko atbalsta Nacionālie veselības institūti (NIAID).
Atjaunināta
2023. gada 3. jūl.