GenoScore

Maxence Younsi

Par šo lietotni

Ģenētiskā vērtēšana (GenoScore: DNS relatīvās vērtēšanas lietotne) ir Android lietotne, kas novērtē iespējamās bioloģisko radinieku kombinācijas, izmantojot daudzpakāpju sistēmu un algoritmu. Tas ļauj izvēlēties vispārīgus STR komplektus un nodrošina krāsu kodētu indikatoru, kas norāda, vai ir nepieciešama turpmāka vākšana vai analīze. Zaļš norāda, ka turpmāka vākšana nav nepieciešama, dzintara krāsa iesaka vākt no citiem radiniekiem vai izmantot papildu analīzes, un sarkanā krāsa norāda uz zemu vidējo LR. Vērtēšanas pamatā ir paredzamā vidējā LR katram scenārijam, kas pielāgots STR komplektam un radinieku kombinācijai. GenoScore sniedz norādījumus par to, kurus radiniekus savākt, bet tikai DNS analīze sniegs lietas patieso iznākumu.

GenoScore ir mobilā lietojumprogramma Android platformām. GenoScore novērtē iespējamās 1., 2. un 3. pakāpes bioloģisko radinieku kombinācijas, pamatojoties uz daudzpakāpju sistēmu un vērtēšanas algoritmu, kurā ir iekļauti vairāki iespējamie radinieki, piemēram, laulātie, pusbrāļi un māsīcas. GenoScore ļauj atlasīt vispārīgus STR komplektus, pamatojoties uz paredzamo lokusu skaitu katrā komplektā, un pielāgot vecākas un jaunākas STR tehnoloģijas.
Lietojumprogramma nodrošina vispārīgu punktu skaitu katram radiniekam vai radinieku kombinācijai un pārvērš šo rezultātu ar krāsu kodētu indikatoru (zaļš, dzintars vai sarkans), kas norāda, vai ir nepieciešama turpmāka bioloģisko radinieku apkopošana vai papildu STR analīzes.
Zaļš indikators norāda, ka atlasītie radinieki un STR loki parasti radītu vidējo LR = 1 000 000 vai augstāku, un papildu radinieku apkopošana, visticamāk, nav nepieciešama. Vidējais LR 1 000 000 vairumā gadījumu ir ļoti konservatīvs, un tas jāņem vērā savācējiem/laboratorijām.
Dzintarkrāsas indikators norāda, ka atlasītie radinieki un STR loki parasti radītu vidējo LR = no 100 līdz ~ 999 999, un ir ieteicams vākt no papildu tuviem bioloģiskiem radiniekiem vai izmantot papildu STR analīzes.
Sarkans indikators norāda, ka atlasītie radinieki un STR loki parasti radītu vidējo LR < 100.
Ciltsrakstu/radinieku vērtēšana daļēji ir balstīta uz iepriekšējo radinieku vērtēšanas sistēmu, bet atjaunināta, lai iekļautu daudzus citus iespējamos radiniekus, piemēram, laulātos (ja ir bērni), tanti/onkuli, brāļameitu/brāļas dēlu, pusbrāļus un māsīcas, tostarp to kombinācijas. .
Vērtēšana ir balstīta uz paredzamo vidējo iespējamības koeficientu (LR) katram ciltsraksta scenārijam, kas pielāgots katram STR komplekta veidam. Gan STR komplekts, gan radinieku(-u) kombinācija ietekmēs paredzamo vidējo LR. Vērtējums ir balstīts uz plašām simulācijām, kas veiktas ar daudziem ciltsrakstiem vairākos STR komplektos (vēl nav publicēti).
Lai gan GenoScore sniedz praktiķiem norādījumus par to, kuri bioloģiskie radinieki ir vispiemērotākie, lietotājiem ir jāparedz iespējamības koeficientu diapazons katram ciltsraksta scenārijam, un tikai DNS analīze un atbilstība sniegs konkrētā gadījuma patieso iznākumu.

Jaunumi

Initial version. Fill, evaluate, save, edit and share via e-mail your relative scoring forms.