easy Primer Design
10+
Преземања
Сите
info
За апликацијава
easy Primer Design е алатка која ви помага да ги дизајнирате вашите PCR прајмери насекаде на временски ефикасен начин: на клупа додека чекате експеримент, на пат до или од работа или во канцеларија. Едноставно залепете ја вашата нуклеотидна секвенца и наведете ги вашите барања за генерирање прајмерни секвенци за вашата апликација за клонирање PCR.
Карактеристики:
-Користете го копчето за залепување за да ја внесете вашата секвенца. Внесениот CDS/секвенца содржи броеви, празни места, прекини на линии, големи или мали букви? Не е важно! Easy Primer Design отстранува броеви, празни места и прекини на линии и менува сè во големи букви!
-внесете ја вашата секвенца без кодон за почеток и стоп (и добијте предупредувачка порака ако сте заборавиле да отстраните еден од него) за да бидете флексибилни за дизајн на прајмер за плазмиди со N-терминални или C-терминални ознаки.
-изберете од повеќе од 20 различни локации на рестриктивни ензими, клонирањето на Golden Gate е поддржано преку BsaI и BsbI, можете дури и да влезете во настрешницата
-добијте предупредувачки пораки ако избраниот ензим би ја пресекол внесената низа
-максимална флексибилност преку опцијата за рестриктивен ензим „друго“, внесете ја вашата локација за рестриктивен ензим ако не е во списокот - поддржани се непалиндромски секвенци! Ако внесената локација за ограничување е присутна во внесената низа или во нејзиниот обратен комплемент, ќе добиете предупредувачка порака!
-добијте предупредувачка порака за да избегнете вообичаени грешки „copy-paste“, доколку вашата внесена низа содржи нецелосен кодон!
-вклучете низа KOZAK во предниот прајмер доколку сакате
-изберете дали ви треба Старт кодон и ако ви треба Стоп-кодон (сите 3 вообичаени стоп-кодони се избираат)
-внесете температура на топење за вашите прајмери, пресметана со помош на температурата на топење прилагодена со сол
-внесете ја концентрацијата на сол (Na+)
-внесете екстензија со 5'-крај за двата ваши прајмери
- се создаваат прајмери за да завршат со G или C
-Се прикажуваат температурата на топење, содржината на G/C и должината на прајмерот
-транспарентен процес на дизајнирање! се прикажуваат сите средни чекори! Вашите избрани опции се прикажани под конечните резултати!
-копче за копирање за да го копирате целиот излез и да го испратите преку е-пошта на вашиот десктоп компјутер за следните чекори за дизајнирање или да го зачувате како датотека!
-Ажурирање на верзијата 0.03: нова функција „DeletionIn“: ви помага да дизајнирате прајмери за PCR продолжување со преклопување за да избришете одредени внатрешни региони од низа (на пр. бришење домени)
-Ажурирање на верзијата 0.045: новата функција „Мутација“ ви помага да дизајнирате прајмери за PCR продолжување на преклопување за да мутирате специфичен кодон во вашата секвенца за да кодирате друга амино киселина
-Ажурирање на верзијата 0.060: нова функција: „DeletionNC“ - ви помага да дизајнирате прајмери за да ги избришете N(5')- или C(3')-терминалните региони од вашата секвенца
-Ажурирање на верзијата 0.080: нова функција: „Вметнување“ - поминете налево во горното главно мени и најдете помош за дизајнирање прајмери за PCR продолжување со преклопување за да вметнете низа за вметнување во вашата секвенца
- Ажурирање на верзијата 0.085: нова карактеристика: „Замени“ - поминете налево во горното главно мени за да добиете помош за дизајнирање прајмери за PCR продолжување со преклопување, кои заменуваат внатрешен регион со внесена секвенца за вметнување
Ве молиме запомнете: мобилната апликација Easy Primer Design не испорачува спремни за употреба секвенци на прајмер, таа ве поддржува само за време на процесот на дизајнирање на прајмер. Корисникот треба внимателно да ја потврди исправноста на секој дел од генерираниот резултат и да ги спроведе сите други потребни тестови!
Среќно клонирање! - Се надевам дека помага :)
Карактеристики:
-Користете го копчето за залепување за да ја внесете вашата секвенца. Внесениот CDS/секвенца содржи броеви, празни места, прекини на линии, големи или мали букви? Не е важно! Easy Primer Design отстранува броеви, празни места и прекини на линии и менува сè во големи букви!
-внесете ја вашата секвенца без кодон за почеток и стоп (и добијте предупредувачка порака ако сте заборавиле да отстраните еден од него) за да бидете флексибилни за дизајн на прајмер за плазмиди со N-терминални или C-терминални ознаки.
-изберете од повеќе од 20 различни локации на рестриктивни ензими, клонирањето на Golden Gate е поддржано преку BsaI и BsbI, можете дури и да влезете во настрешницата
-добијте предупредувачки пораки ако избраниот ензим би ја пресекол внесената низа
-максимална флексибилност преку опцијата за рестриктивен ензим „друго“, внесете ја вашата локација за рестриктивен ензим ако не е во списокот - поддржани се непалиндромски секвенци! Ако внесената локација за ограничување е присутна во внесената низа или во нејзиниот обратен комплемент, ќе добиете предупредувачка порака!
-добијте предупредувачка порака за да избегнете вообичаени грешки „copy-paste“, доколку вашата внесена низа содржи нецелосен кодон!
-вклучете низа KOZAK во предниот прајмер доколку сакате
-изберете дали ви треба Старт кодон и ако ви треба Стоп-кодон (сите 3 вообичаени стоп-кодони се избираат)
-внесете температура на топење за вашите прајмери, пресметана со помош на температурата на топење прилагодена со сол
-внесете ја концентрацијата на сол (Na+)
-внесете екстензија со 5'-крај за двата ваши прајмери
- се создаваат прајмери за да завршат со G или C
-Се прикажуваат температурата на топење, содржината на G/C и должината на прајмерот
-транспарентен процес на дизајнирање! се прикажуваат сите средни чекори! Вашите избрани опции се прикажани под конечните резултати!
-копче за копирање за да го копирате целиот излез и да го испратите преку е-пошта на вашиот десктоп компјутер за следните чекори за дизајнирање или да го зачувате како датотека!
-Ажурирање на верзијата 0.03: нова функција „DeletionIn“: ви помага да дизајнирате прајмери за PCR продолжување со преклопување за да избришете одредени внатрешни региони од низа (на пр. бришење домени)
-Ажурирање на верзијата 0.045: новата функција „Мутација“ ви помага да дизајнирате прајмери за PCR продолжување на преклопување за да мутирате специфичен кодон во вашата секвенца за да кодирате друга амино киселина
-Ажурирање на верзијата 0.060: нова функција: „DeletionNC“ - ви помага да дизајнирате прајмери за да ги избришете N(5')- или C(3')-терминалните региони од вашата секвенца
-Ажурирање на верзијата 0.080: нова функција: „Вметнување“ - поминете налево во горното главно мени и најдете помош за дизајнирање прајмери за PCR продолжување со преклопување за да вметнете низа за вметнување во вашата секвенца
- Ажурирање на верзијата 0.085: нова карактеристика: „Замени“ - поминете налево во горното главно мени за да добиете помош за дизајнирање прајмери за PCR продолжување со преклопување, кои заменуваат внатрешен регион со внесена секвенца за вметнување
Ве молиме запомнете: мобилната апликација Easy Primer Design не испорачува спремни за употреба секвенци на прајмер, таа ве поддржува само за време на процесот на дизајнирање на прајмер. Корисникот треба внимателно да ја потврди исправноста на секој дел од генерираниот резултат и да ги спроведе сите други потребни тестови!
Среќно клонирање! - Се надевам дека помага :)
Ажуриранa на
Безбедноста започнува со разбирање како програмерите ги прибираат и споделуваат вашите податоци. Праксата во однос на приватноста и заштитата на податоците може да се разликува според користењето, регионот и вашата возраст. Програмерот ги обезбедил информацииве и може да ги ажурира во иднина.
Не се споделуваат податоци со трети страни
Дознајте повеќе како програмерите изјавуваат споделување податоци
Не се прибираат податоци
Дознајте повеќе како програмерите изјавуваат прибирање податоци
Што има ново
-New Feature: Replace - swipe left in the top main menu to get help for designing primers for overlap extension PCR, that replace an internal region with an entered insert-sequence
-help section updated
-help section updated