White Lilies Code is een visuele roman. Een gewone technicus inspecteert een station dat zelden wordt gebruikt. Plots vindt hij daar een onbekend meisje. Het bleek dat ze een vertegenwoordiger is van de uitgedoofde beschaving. Haar thuisland werd vernietigd door het Zwarte Rijk. Het lijkt erop dat ze werd gered toen ze de aarde bereikte. Maar dat is niet zo. Het Zwarte Rijk is hier in het geheim al. De soldaten vechten ongezien tegen mensen. De hoofdpersoon is actief betrokken bij het draaien van gebeurtenissen. Hij probeert een aantal problemen op te lossen. Naarmate het verhaal zich ontvouwt, moet het personage veel moeilijke keuzes maken en moed tonen in een kosmische strijd. Het spelplot is rijk aan thrillerelementen.
Het ontrafelen van de plot verloopt snel en niet te lang. De uitkomst blijft tot het einde toe onduidelijk. Het geweldige ontwerp vangt de sfeer van de verre toekomst. De goede muziek- en geluidsselectie draagt bij aan het effect.