ImmGen
1K+
Downloads
Iedereen
info
Over deze app
Verken genexpressieniveaus in cellen van het immuunsysteem van verschillende muizen. Begin met het invoeren van een gennaam (of alias) in de zoekbalk om een lijst met treffers te zien waar je doorheen kunt vegen.
Zoeken zal een "heatmap-streepjescode" weergeven die laat zien hoe warm of koud expressie van dat gen is in verschillende cellijnen van het immuunsysteem (B-cellen, T-cellen, myeloïde cellen, enz.). Schakel tussen datasets gegenereerd op 2 verschillende platformen: RNAseq en microarray.
Druk op het pictogram van een cellijn om dezelfde uitdrukkingsgegevens gevisualiseerd te zien als een staafdiagram. Gebruik het instellingenmenu rechtsboven om te schakelen tussen een log- en lineaire as. In de microarray-gegevens zijn lage expressiewaarden gedeeltelijk afgesloten.
Terug op het hoofdscherm van de "heatmap-barcode", als u in plaats daarvan op de knop "Toon gerelateerde genen" drukt, ziet u een "genenconstellatie" -weergave. Dit toont de meest gecorreleerde genen binnen bepaalde bevolkingsgroepen. Standaard wordt correlatie weergegeven met betrekking tot sleutelpopulaties - dit zijn sleutelpopulaties in het hele immuunsysteem.
Neem contact op met immgen@gmail.com voor feedback of functieverzoeken!
De gegevens worden gegenereerd door het Immunological Genome Project, een internationaal consortium ondersteund door de National Institutes of Health (NIAID).
Zoeken zal een "heatmap-streepjescode" weergeven die laat zien hoe warm of koud expressie van dat gen is in verschillende cellijnen van het immuunsysteem (B-cellen, T-cellen, myeloïde cellen, enz.). Schakel tussen datasets gegenereerd op 2 verschillende platformen: RNAseq en microarray.
Druk op het pictogram van een cellijn om dezelfde uitdrukkingsgegevens gevisualiseerd te zien als een staafdiagram. Gebruik het instellingenmenu rechtsboven om te schakelen tussen een log- en lineaire as. In de microarray-gegevens zijn lage expressiewaarden gedeeltelijk afgesloten.
Terug op het hoofdscherm van de "heatmap-barcode", als u in plaats daarvan op de knop "Toon gerelateerde genen" drukt, ziet u een "genenconstellatie" -weergave. Dit toont de meest gecorreleerde genen binnen bepaalde bevolkingsgroepen. Standaard wordt correlatie weergegeven met betrekking tot sleutelpopulaties - dit zijn sleutelpopulaties in het hele immuunsysteem.
Neem contact op met immgen@gmail.com voor feedback of functieverzoeken!
De gegevens worden gegenereerd door het Immunological Genome Project, een internationaal consortium ondersteund door de National Institutes of Health (NIAID).
Geüpdatet op
Veiligheid van gegevens begint met inzicht in de manier waarop ontwikkelaars je gegevens verzamelen en delen. Procedures voor gegevensprivacy en beveiliging kunnen variëren op basis van je gebruik, regio en leeftijd. De ontwikkelaar heeft deze informatie aangeleverd en kan die in de loop van de tijd updaten.
Geen gegevens gedeeld met derden
Meer informatie over hoe ontwikkelaars aangeven welke gegevens ze delen
Geen gegevens verzameld
Meer informatie over hoe ontwikkelaars aangeven welke gegevens ze verzamelen
Wat is er nieuw
- New human RNA-seq data
- Various small improvements
- Various small improvements
App-support
Over de ontwikkelaar
PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE
ImmGen@hms.harvard.edu
25 Shattuck St
Boston, MA 02115
United States
+1 617-432-7741
