Het belangrijkste doel van Helix Jump is om een stuiterende bal door een spiraalvormig torendoolhof te leiden en de bodem te bereiken.
Spelers bepalen de richting van de bal door naar links of rechts over het scherm te vegen. Er zijn geen andere bedieningselementen, waardoor het gemakkelijk op te pakken en te spelen is.
De toren bestaat uit verschillende gekleurde platforms en de speler moet de bal door gaten in deze platforms navigeren. Als de bal een platform raakt, breekt deze en blijft de speler naar beneden stuiteren.
Punten worden verdiend naarmate de bal door het doolhof vordert. Het breken van meerdere platforms in één val of het landen op speciale platforms kan de score verhogen.
Helix Jump biedt eindeloze gameplay, wat betekent dat er geen ultiem doel of eindniveau is. Spelers blijven spelen en proberen hun eigen hoogste score te verbeteren.