Den dype, mørke underverdenen er et sted hvor rester av teknologi forlatt for lenge siden og spor av tapt magi eksisterer side om side. Den avanserte mekaniske sivilisasjonen til den tynne undergrunnen og den mystiske sjeleenergien til den dype undergrunnen har utviklet seg på forskjellige måter, men en dag begynner den onde ånden Magellan, født i den dype ‘Raul’, å drive hele undergrunnen ut i kaos. Påvirkningen strekker seg til lysets helligdom, Luminarie, og «lyset» i underverdenen forsvinner gradvis.
Spilleren legger ut på en reise for å kjempe mot Magellans mørke med "Drill Girls" samlet rundt Siren. Lidenskapelige krigere fra slummen, mystiske vesener som bruker sjelesverd, overlevende fra giftige soner, istrollmenn, mekanikere, vitenskapsmenn, ninjaer og andre unike jenter har sin egen fortid, kampstiler og mål, og renser mørket med kraftige borevåpen og unike evner.
Spillet dreier seg om et unikt verdensbilde der handling og strategi, vitenskap og magi, og fortid og fremtid krysser hverandre. Når spillerne utforsker hvert område, opplever de kamper som kombinerer maskineri og magi, og kommer gradvis nærmere sannheten gjennom relasjonene og fortellingene mellom karakterene. Det skiftende underjordiske landskapet og karakterer med forskjellige personligheter gir spillerne en dyp følelse av fordypning.