easy Primer Design
10+
Nedlastinger
Alle
info
Om denne appen
easy Primer Design er et verktøy som hjelper deg med å designe PCR-primerne hvor som helst på en tidseffektiv måte: ved benken mens du venter på et eksperiment, på vei til eller fra jobb eller på kontoret. Bare lim inn nukleotidsekvensen og spesifiser kravene dine for å generere primersekvenser for PCR-kloningsapplikasjonen.
Egenskaper:
-Bruk lim-knappen for å angi sekvensen din. Den angitte CDS/sekvensen inneholder tall, mellomrom, linjeskift, store eller små bokstaver? Det spiller ingen rolle! easy Primer Design fjerner tall, mellomrom og linjeskift og endrer alt til store bokstaver!
-skriv inn sekvensen din uten start- og stoppkodon (og få en advarsel hvis du glemte å fjerne en av den) for å være fleksibel for primerdesign for plasmider med N-terminale eller C-terminale tagger.
-velg fra mer enn 20 forskjellige restriksjonsenzymsteder, Golden Gate-kloning støttes via BsaI og BsbI, du kan til og med gå inn i overhenget
-få advarselsmeldinger hvis ditt valgte enzym ville kutte den angitte sekvensen
-maksimal fleksibilitet via restriksjonsenzymalternativet "annet", skriv inn restriksjonsenzymstedet ditt hvis det ikke er på listen - ikke-palindromiske sekvenser støttes! Hvis det angitte restriksjonsstedet er tilstede i den angitte sekvensen eller i motsatt komplement, vil du få en advarsel!
-få en advarsel for å unngå vanlige 'copy-paste'-feil, hvis den angitte sekvensen inneholder et ufullstendig kodon!
-inkluder en KOZAK-sekvens i den fremre primeren hvis du vil ha en
-velg om du trenger et startkodon, og om du trenger et stoppkodon (alle 3 vanlige stoppkodoner kan velges)
- angi en smeltetemperatur for primerne, den beregnes ved hjelp av den saltjusterte smeltetemperaturen
-skriv inn saltkonsentrasjonen (Na+)
-skriv inn en 5'-ende forlengelse for begge primerne dine
-primere genereres for å slutte med G eller C
-smeltetemperatur, G/C-innhold og primerlengde vises
-transparent designprosess! alle mellomtrinn vises! De valgte alternativene vises under de endelige resultatene!
-kopi-knappen for å kopiere hele utdataene og sende den via e-post til din stasjonære PC for de neste designtrinnene eller lagre den som en fil!
-Versjon 0.03-oppdatering: ny funksjon 'DeletionIn': hjelper deg med å designe primere for overlappende utvidelses-PCR for å slette spesifikke interne regioner fra en sekvens (f.eks. slette domener)
-Versjon 0.045-oppdatering: ny funksjon 'Mutation' hjelper deg med å designe primere for overlappende forlengelses-PCR for å mutere et spesifikt kodon i sekvensen din for å kode for en annen aminosyre
-Versjon 0.060-oppdatering: ny funksjon: 'DeletionNC' - hjelper deg med å designe primere for å slette N(5')- eller C(3')-terminale regioner fra sekvensen din
-Versjon 0.080-oppdatering: ny funksjon: 'Innsetting' - sveip til venstre i den øverste hovedmenyen og finn hjelp til å designe primere for overlappende forlengelses-PCR for å sette inn en innsettingssekvens i sekvensen din
- Versjon 0.085-oppdatering: ny funksjon: 'Erstatt' - sveip til venstre i den øverste hovedmenyen for å få hjelp til å designe primere for overlappende forlengelses-PCR, som erstatter en intern region med en angitt innsettingssekvens
Merk: easy Primer Design-mobilappen leverer ikke klare til bruk primersekvenser, den støtter deg bare under prosessen med primerdesign. Brukeren må validere riktigheten av hver del av det genererte resultatet nøye og utføre alle andre nødvendige tester!
Lykke til med kloning! -Håper det hjelper :)
Egenskaper:
-Bruk lim-knappen for å angi sekvensen din. Den angitte CDS/sekvensen inneholder tall, mellomrom, linjeskift, store eller små bokstaver? Det spiller ingen rolle! easy Primer Design fjerner tall, mellomrom og linjeskift og endrer alt til store bokstaver!
-skriv inn sekvensen din uten start- og stoppkodon (og få en advarsel hvis du glemte å fjerne en av den) for å være fleksibel for primerdesign for plasmider med N-terminale eller C-terminale tagger.
-velg fra mer enn 20 forskjellige restriksjonsenzymsteder, Golden Gate-kloning støttes via BsaI og BsbI, du kan til og med gå inn i overhenget
-få advarselsmeldinger hvis ditt valgte enzym ville kutte den angitte sekvensen
-maksimal fleksibilitet via restriksjonsenzymalternativet "annet", skriv inn restriksjonsenzymstedet ditt hvis det ikke er på listen - ikke-palindromiske sekvenser støttes! Hvis det angitte restriksjonsstedet er tilstede i den angitte sekvensen eller i motsatt komplement, vil du få en advarsel!
-få en advarsel for å unngå vanlige 'copy-paste'-feil, hvis den angitte sekvensen inneholder et ufullstendig kodon!
-inkluder en KOZAK-sekvens i den fremre primeren hvis du vil ha en
-velg om du trenger et startkodon, og om du trenger et stoppkodon (alle 3 vanlige stoppkodoner kan velges)
- angi en smeltetemperatur for primerne, den beregnes ved hjelp av den saltjusterte smeltetemperaturen
-skriv inn saltkonsentrasjonen (Na+)
-skriv inn en 5'-ende forlengelse for begge primerne dine
-primere genereres for å slutte med G eller C
-smeltetemperatur, G/C-innhold og primerlengde vises
-transparent designprosess! alle mellomtrinn vises! De valgte alternativene vises under de endelige resultatene!
-kopi-knappen for å kopiere hele utdataene og sende den via e-post til din stasjonære PC for de neste designtrinnene eller lagre den som en fil!
-Versjon 0.03-oppdatering: ny funksjon 'DeletionIn': hjelper deg med å designe primere for overlappende utvidelses-PCR for å slette spesifikke interne regioner fra en sekvens (f.eks. slette domener)
-Versjon 0.045-oppdatering: ny funksjon 'Mutation' hjelper deg med å designe primere for overlappende forlengelses-PCR for å mutere et spesifikt kodon i sekvensen din for å kode for en annen aminosyre
-Versjon 0.060-oppdatering: ny funksjon: 'DeletionNC' - hjelper deg med å designe primere for å slette N(5')- eller C(3')-terminale regioner fra sekvensen din
-Versjon 0.080-oppdatering: ny funksjon: 'Innsetting' - sveip til venstre i den øverste hovedmenyen og finn hjelp til å designe primere for overlappende forlengelses-PCR for å sette inn en innsettingssekvens i sekvensen din
- Versjon 0.085-oppdatering: ny funksjon: 'Erstatt' - sveip til venstre i den øverste hovedmenyen for å få hjelp til å designe primere for overlappende forlengelses-PCR, som erstatter en intern region med en angitt innsettingssekvens
Merk: easy Primer Design-mobilappen leverer ikke klare til bruk primersekvenser, den støtter deg bare under prosessen med primerdesign. Brukeren må validere riktigheten av hver del av det genererte resultatet nøye og utføre alle andre nødvendige tester!
Lykke til med kloning! -Håper det hjelper :)
Oppdatert
Sikkerhet starter med en forståelse av hvordan utviklere samler inn og deler dataene dine. Fremgangsmåtene for personvern og datasikkerhet kan variere basert på bruk, region og alder. Utvikleren har oppgitt denne informasjonen og kan oppdatere den over tid.
Ingen data deles med tredjeparter
Finn ut mer om hvordan utviklere deklarerer deling
Ingen data samles inn
Finn ut mer om hvordan utviklere deklarerer innsamling
Nyheter
-New Feature: Replace - swipe left in the top main menu to get help for designing primers for overlap extension PCR, that replace an internal region with an entered insert-sequence
-help section updated
-help section updated