ImmGen
1k+
Nedlastinger
Alle
info
Om denne appen
Utforsk genuttrykksnivåer i forskjellige museimmunsystemceller. Start med å skrive inn et gennavn (eller alias) i søkefeltet for å se en liste over treff du kan sveipe gjennom.
Søking vil vise en "varmekart-strekkode" som viser hvor varmt eller kaldt uttrykk for det genet er på tvers av forskjellige immunsystemcellelinjer (B-celler, T-celler, Myeloidceller, etc). Veksle mellom datasett generert på 2 forskjellige plattformer: RNAseq og microarray.
Trykk ned på et cellelinjeikon for å se de samme uttrykksdataene visualisert som et stolpediagram. Bruk innstillingsmenyen øverst til høyre for å veksle mellom en logg og lineær akse. I mikroarray-dataene er lave uttrykksverdier delvis okkludert.
Tilbake på hovedskjermen for "varmekartstrekkode", hvis du i stedet trykker på "Vis relaterte gener"-knappen, vil du se en "genkonstellasjon". Dette viser de mest korrelerte gener innen visse befolkningsgrupper. Som standard vises korrelasjon med hensyn til nøkkelpopulasjoner - dette er nøkkelpopulasjoner over hele immunsystemet.
Ta kontakt med immgen@gmail.com for tilbakemelding eller funksjonsforespørsler!
Dataene er generert av Immunological Genome Project, et internasjonalt konsortium støttet av National Institutes of Health (NIAID).
Søking vil vise en "varmekart-strekkode" som viser hvor varmt eller kaldt uttrykk for det genet er på tvers av forskjellige immunsystemcellelinjer (B-celler, T-celler, Myeloidceller, etc). Veksle mellom datasett generert på 2 forskjellige plattformer: RNAseq og microarray.
Trykk ned på et cellelinjeikon for å se de samme uttrykksdataene visualisert som et stolpediagram. Bruk innstillingsmenyen øverst til høyre for å veksle mellom en logg og lineær akse. I mikroarray-dataene er lave uttrykksverdier delvis okkludert.
Tilbake på hovedskjermen for "varmekartstrekkode", hvis du i stedet trykker på "Vis relaterte gener"-knappen, vil du se en "genkonstellasjon". Dette viser de mest korrelerte gener innen visse befolkningsgrupper. Som standard vises korrelasjon med hensyn til nøkkelpopulasjoner - dette er nøkkelpopulasjoner over hele immunsystemet.
Ta kontakt med immgen@gmail.com for tilbakemelding eller funksjonsforespørsler!
Dataene er generert av Immunological Genome Project, et internasjonalt konsortium støttet av National Institutes of Health (NIAID).
Oppdatert
Sikkerhet starter med en forståelse av hvordan utviklere samler inn og deler dataene dine. Fremgangsmåtene for personvern og datasikkerhet kan variere basert på bruk, region og alder. Utvikleren har oppgitt denne informasjonen og kan oppdatere den over tid.
Ingen data deles med tredjeparter
Finn ut mer om hvordan utviklere deklarerer deling
Ingen data samles inn
Finn ut mer om hvordan utviklere deklarerer innsamling
Hva er nytt?
- New human RNA-seq data
- Various small improvements
- Various small improvements
Appstøtte
Om utvikleren
PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE
ImmGen@hms.harvard.edu
25 Shattuck St
Boston, MA 02115
United States
+1 617-432-7741
