Varaždin fylke er et av de eldste kroatiske fylkene, og det ble nevnt allerede i 1181 i charteret til den kroatisk-ungarske kong Bela III. Toma II skiller seg ut i historien til Varaždin fylke. Erdődy, som var den første arvelige storprefekten i Varaždin County. Han mottok denne æren fordi han viste seg i kampen mot ottomanerne, så kongen, sammen med æren av å arve stillingen som stor prefekt, ga ham også Varaždin-festningen, dagens gamleby, i 1607. Etterkommere av Tom II. Erdődy bodde i gamlebyen til 1925, da gamlebyen ble museum.
Gullalderen til Varaždin fylke er andre halvdel av 1700-tallet, da Varaždin fylke er sentrum for begivenheter og statsmakt, og det kroatiske parlamentet sitter på fylkets territorium hele 30 ganger. På den tiden ble det bygget mange slott, herregårder, kapeller, kirker, palasser og til og med fylkespalasset, som fortsatt er prefektens sete. Fylkespalasset ble opprettet i dronning Maria Theresias tid, for mer enn 250 år siden, og det offisielle våpenskjoldet og banneret ble opprettet på den tiden, og overtok våpenskjoldet til Erdődy-familien. I dag er Varaždin fylke et av de mindre, men tettest befolkede kroatiske fylkene, bestående av 22 kommuner og 6 byer. Varaždin fylkes besøkssenter ligger i kjelleren på fylkespalasset. Velkommen til Varaždin fylke.