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Sobre este app
Explore os níveis de expressão gênica em diferentes células do sistema imunológico de camundongos. Comece inserindo um nome de gene (ou alias) na barra de pesquisa para ver uma lista de resultados que você pode percorrer.
A pesquisa exibirá um "código de barras de mapa de calor" que mostra a expressão quente ou fria desse gene em diferentes linhagens de células do sistema imunológico (células B, células T, células mieloides, etc.). Alterne entre conjuntos de dados gerados em 2 plataformas diferentes: RNAseq e microarray.
Pressione um ícone de linhagem de célula para ver os mesmos dados de expressão visualizados como um gráfico de barras. Use o menu de configurações no canto superior direito para alternar entre um eixo logarítmico e linear. Nos dados do microarray, os valores de expressão baixos são parcialmente ocluídos.
De volta à tela principal do "código de barras do mapa de calor", se você pressionar o botão "Mostrar genes relacionados", verá uma exibição de "constelação de genes". Isso mostra seus genes mais correlacionados dentro de certos grupos populacionais. Por padrão, a correlação é mostrada em relação às populações-chave — essas são populações-chave em todo o sistema imunológico.
Entre em contato com immgen@gmail.com para comentários ou solicitações de recursos!
Os dados são gerados pelo Projeto Genoma Imunológico, um consórcio internacional apoiado pelos Institutos Nacionais de Saúde (NIAID).
A pesquisa exibirá um "código de barras de mapa de calor" que mostra a expressão quente ou fria desse gene em diferentes linhagens de células do sistema imunológico (células B, células T, células mieloides, etc.). Alterne entre conjuntos de dados gerados em 2 plataformas diferentes: RNAseq e microarray.
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O que há de novo
- New human RNA-seq data
- Various small improvements
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Sobre o desenvolvedor
PRESIDENT AND FELLOWS OF HARVARD COLLEGE
ImmGen@hms.harvard.edu
25 Shattuck St
Boston, MA 02115
United States
+1 617-432-7741
