Исследуйте уровни экспрессии генов в различных клетках иммунной системы мыши. Начните с ввода имени гена (или псевдонима) в строку поиска, чтобы увидеть список совпадений, которые вы можете пролистать.
Поиск отобразит «штрих-код тепловой карты», который показывает, насколько горячая или холодная экспрессия этого гена проявляется в различных линиях клеток иммунной системы (В-клетках, Т-клетках, миелоидных клетках и т. д.). Переключайтесь между наборами данных, сгенерированными на двух разных платформах: RNAseq и microarray.
Нажмите на значок клеточной линии, чтобы увидеть те же данные экспрессии, визуализированные в виде гистограммы. Используйте меню настроек в правом верхнем углу для переключения между логарифмической и линейной осью. В данных микрочипа низкие значения экспрессии частично скрыты.
Вернувшись на главный экран «тепловая карта штрих-кода», если вы вместо этого нажмете кнопку «Показать связанные гены», вы увидите представление «созвездие генов». Это показывает его наиболее коррелированные гены в определенных группах населения. По умолчанию корреляция показана по отношению к ключевым популяциям — это ключевые популяции по всей иммунной системе.
Пожалуйста, свяжитесь с immgen@gmail.com для отзывов или запросов функций!
Данные генерируются международным консорциумом Immunological Genome Project, поддерживаемым Национальными институтами здравоохранения (NIAID).
Последнее обновление
3 июл. 2023 г.