Preskúmajte hladiny génovej expresie v rôznych bunkách imunitného systému myší. Začnite zadaním názvu génu (alebo aliasu) do vyhľadávacieho panela, aby ste videli zoznam zásahov, ktoré môžete prechádzať.
Pri vyhľadávaní sa zobrazí „čiarový kód teplotnej mapy“, ktorý ukazuje, aká je horúca alebo studená expresia tohto génu v rôznych bunkových líniách imunitného systému (B bunky, T bunky, myeloidné bunky atď.). Prepínajte medzi súbormi údajov generovanými na 2 rôznych platformách: RNAseq a microarray.
Stlačením ikony bunkovej línie nadol zobrazíte rovnaké údaje výrazu vizualizované ako stĺpcový graf. Pomocou ponuky nastavení vpravo hore môžete prepínať medzi logaritmickou a lineárnou osou. V údajoch microarray sú nízke hodnoty expresie čiastočne okludované.
Ak sa vrátite na hlavnú obrazovku „čiarového kódu teplotnej mapy“, ak namiesto toho stlačíte tlačidlo „Zobraziť súvisiace gény“, zobrazí sa zobrazenie „konštelácie génov“. To ukazuje jeho najviac korelované gény v rámci určitých skupín populácie. V predvolenom nastavení sa korelácia zobrazuje s ohľadom na kľúčové populácie – to sú kľúčové populácie v rámci celého imunitného systému.
Ak potrebujete spätnú väzbu alebo požiadavky na funkcie, obráťte sa na immgen@gmail.com!
Údaje generuje Immunological Genome Project, medzinárodné konzorcium podporované National Institutes of Health (NIAID).