еаси Пример Десигн је алатка која вам помаже да дизајнирате своје ПЦР прајмере било где на временски ефикасан начин: на клупи док чекате експеримент, на путу до посла или са посла или у канцеларији. Једноставно налепите своју нуклеотидну секвенцу и одредите своје захтеве за генерисање секвенци прајмера за вашу апликацију за ПЦР клонирање.
Карактеристике:
-Користите дугме за лепљење да бисте унели своју секвенцу. Унети ЦДС/секвенца садржи бројеве, размаке, преломе редова, велика или мала слова? Није битно! једноставан Пример Десигн уклања бројеве, размаке и преломе редова и мења све у велика слова!
-унесите своју секвенцу без стартног и стоп кодона (и добијте поруку упозорења ако сте заборавили да уклоните један од њих) да бисте били флексибилни за дизајн прајмера за плазмиде са ознакама Н-терминала или Ц-терминала.
- бирајте између више од 20 различитих локација рестрикцијских ензима, клонирање Голден Гате-а је подржано преко БсаИ и БсбИ, чак можете ући у превис
-добити поруке упозорења ако би изабрани ензим пресекао унети низ
-максимална флексибилност преко опције рестрикционог ензима 'остало', унесите своје место рестрикционог ензима ако није на листи - подржане су не-палиндромске секвенце! Ако је унети сајт за ограничење присутан у унетом низу или у његовом обрнутом додатку, добићете поруку упозорења!
-добите поруку упозорења да бисте избегли уобичајене грешке 'цопи-пасте', ако ваша унета секвенца садржи некомплетан кодон!
-укључите КОЗАК секвенцу у прајмер ако желите
-одаберите да ли вам треба Старт кодон, и да ли вам је потребан Стоп кодон (сва 3 уобичајена стоп кодона се могу изабрати)
-унесите температуру топљења за ваше прајмере, која се израчунава помоћу температуре топљења прилагођене соли
-унесите концентрацију соли (На+)
-унесите наставак од 5' за оба ваша прајмера
-прајмери се генеришу да завршавају са Г или Ц
-Приказују се температура топљења, садржај Г/Ц и дужина прајмера
-транспарентан процес пројектовања! сви средњи кораци су приказани! Ваше изабране опције су приказане испод коначних резултата!
-цопи дугме да копирате цео резултат и пошаљете га путем е-поште на ваш десктоп рачунар за следеће кораке дизајна или га сачувате као датотеку!
- Ажурирање верзије 0.03: нова функција 'ДелетионИн': помаже вам да дизајнирате прајмере за ПЦР екстензије преклапања за брисање специфичних унутрашњих региона из секвенце (нпр. брисање домена)
- Ажурирање верзије 0.045: нова функција 'Мутација' вам помаже да дизајнирате прајмере за ПЦР екстензије преклапања да бисте мутирали одређени кодон у вашој секвенци како бисте кодирали другу аминокиселину
-Ажурирање верзије 0.060: нова функција: 'ДелетионНЦ' - помаже вам да дизајнирате прајмере за брисање Н(5')- или Ц(3')-терминалних региона из ваше секвенце
- Ажурирање верзије 0.080: нова функција: 'Инсертион' - превуците прстом налево у горњем главном менију и пронађите помоћ за дизајнирање прајмера за ПЦР проширења преклапања да бисте уметнули секвенцу уметања у своју секвенцу
- Ажурирање верзије 0.085: нова карактеристика: 'Замени' - превуците прстом налево у горњем главном менију да бисте добили помоћ за дизајнирање прајмера за ПЦР проширења преклапања, који замењују унутрашњи регион са унетом секвенцом уметања
Имајте на уму: лака мобилна апликација Пример Десигн не испоручује секвенце прајмера спремне за употребу, већ вас подржава само током процеса дизајна прајмера. Корисник мора пажљиво да провери исправност сваког дела генерисаног резултата и изврши све остале неопходне тестове!
Срећно клонирање! -Надам се да помаже :)