GenoScore

Maxence Younsi

O ovoj aplikaciji

Генетско бодовање (ГеноСцоре: апликација за релативно бодовање ДНК) је Андроид апликација која бодује потенцијалне комбинације биолошких сродника користећи вишеслојни систем и алгоритам. Омогућава избор генеричких СТР комплета и обезбеђује индикатор бојом који указује на то да ли је потребно даље прикупљање или анализа. Зелено означава да није потребно даље прикупљање, жуто препоручује прикупљање од додатних рођака или коришћење додатних анализа, а црвено означава ниску медијану ЛР. Бодовање се заснива на очекиваном средњем ЛР за сваки сценарио, прилагођено за СТР комплет и комбинацију рођака. ГеноСцоре пружа смернице о томе које рођаке треба прикупити, али само ДНК анализа ће дати прави исход случаја.

ГеноСцоре је мобилна апликација за Андроид платформе. ГеноСцоре оцењује потенцијалне комбинације биолошких сродника 1., 2. и 3. степена на основу вишеслојног система и алгоритма бодовања који укључује више могућих рођака, као што су супружници, полубраћа и сестре и рођаци. ГеноСцоре омогућава избор генеричких СТР комплета, на основу очекиваног броја локуса у сваком комплету, и за прилагођавање старијих и новијих СТР технологија.
Апликација обезбеђује општи резултат за сваког рођака или комбинацију рођака и преводи овај резултат у индикатор означен бојом (зелена, жута или црвена) који сугерише да ли је потребно даље прикупљање биолошких сродника или додатне СТР анализе.
Зелени индикатор указује на то да би одабрани сродници и СТР локуси обично резултирали средњим ЛР = 1.000.000 или више, и вероватно није потребно даље прикупљање додатних сродника. Медијан ЛР од 1.000.000 је веома конзервативан у већини случајева и сакупљачи/лабораторија би га требало узети у обзир.
Жути индикатор указује да би одабрани сродници и СТР локуси обично резултирали средњим ЛР = од 100 до ~999,999, и препоручује се прикупљање од додатних блиских биолошких рођака или коришћење додатних СТР анализа.
Црвени индикатор указује да би одабрани сродници и СТР локуси обично резултирали средњим ЛР < 100.
Бодовање педигреа/рођака је делимично засновано на претходном систему бодовања рођака, али је ажурирано тако да укључује многе друге могуће рођаке као што су супружници (ако су деца доступна), тетка/ујак, нећака/нећак, полубраћа и сестре и рођаци, укључујући њихове комбинације .
Бодовање се заснива на очекиваном средњем коефицијенту вероватноће (ЛР) за сваки сценарио педигреа прилагођен за сваки тип СТР комплета. И СТР комплет и комбинација рођака ће утицати на очекивани средњи ЛР. Бодовање се заснива на опсежним симулацијама изведеним на многим педигреима, у више СТР комплета (још необјављених).
Иако ГеноСцоре пружа упутства практичарима о томе које биолошке сроднике је најприкладније прикупити, корисници би требало да предвиде низ односа вероватноће за сваки сценарио педигреа, а само анализа ДНК и упаривање ће обезбедити прави исход датог случаја.

Šta je novo

Initial version. Fill, evaluate, save, edit and share via e-mail your relative scoring forms.