easy Primer Design
100+
பதிவிறக்கியவை
அனைவருக்குமானது
info
இந்த ஆப்ஸ் பற்றி
ஈஸி ப்ரைமர் டிசைன் என்பது உங்கள் PCR ப்ரைமர்களை எந்த நேரத்திலும் திறமையான முறையில் வடிவமைக்க உதவும் ஒரு கருவியாகும்: பெஞ்சில் பரிசோதனைக்காக காத்திருக்கும் போது, நீங்கள் செல்லும் வழியில், அல்லது வேலைக்குச் செல்லும் போது அல்லது அலுவலகத்தில். உங்கள் நியூக்ளியோடைடு வரிசையை ஒட்டவும் மற்றும் உங்கள் PCR குளோனிங் பயன்பாட்டிற்கான ப்ரைமர் தொடர்களை உருவாக்க உங்கள் தேவைகளைக் குறிப்பிடவும்.
அம்சங்கள்:
உங்கள் வரிசையை உள்ளிட பேஸ்ட் பொத்தானைப் பயன்படுத்தவும். உள்ளிட்ட CDS/வரிசை எண்கள், இடைவெளிகள், வரி முறிவுகள், மேல் அல்லது சிறிய எழுத்துக்கள் உள்ளதா? பரவாயில்லை! எளிதான ப்ரைமர் வடிவமைப்பு எண்கள், இடைவெளிகள் மற்றும் வரி முறிவுகளை நீக்குகிறது மற்றும் எல்லாவற்றையும் பெரிய எழுத்துகளாக மாற்றுகிறது!
N-டெர்மினல் அல்லது சி-டெர்மினல் குறிச்சொற்கள் கொண்ட பிளாஸ்மிட்களுக்கான ப்ரைமர் வடிவமைப்பிற்கு நெகிழ்வானதாக இருக்க, உங்கள் வரிசையை ஸ்டார்ட் மற்றும் ஸ்டாப் கோடான் இல்லாமல் உள்ளிடவும் (அதில் ஒன்றை நீக்க மறந்துவிட்டால் எச்சரிக்கை செய்தியைப் பெறவும்).
20 க்கும் மேற்பட்ட வெவ்வேறு கட்டுப்பாடு என்சைம் தளங்களிலிருந்து தேர்வு செய்யவும், கோல்டன் கேட் குளோனிங் BsaI மற்றும் BSbI வழியாக ஆதரிக்கப்படுகிறது, நீங்கள் ஓவர்ஹாங்கிலும் நுழையலாம்
-உங்கள் தேர்ந்தெடுத்த நொதி நீங்கள் உள்ளிட்ட வரிசையைக் குறைத்தால் எச்சரிக்கை செய்திகளைப் பெறவும்
-அதிகபட்ச நெகிழ்வுத்தன்மை கட்டுப்பாடு என்சைம் விருப்பமான 'பிற', பட்டியலில் இல்லை என்றால் உங்கள் கட்டுப்பாட்டு நொதி தளத்தை உள்ளிடவும் - பாலிண்ட்ரோமிக் அல்லாத தொடர்கள் ஆதரிக்கப்படுகின்றன! நீங்கள் உள்ளிட்ட கட்டுப்பாடு தளம் நீங்கள் உள்ளிட்ட வரிசையிலோ அல்லது அதன் தலைகீழ் நிரப்பிலோ இருந்தால் எச்சரிக்கை செய்தியைப் பெறுவீர்கள்!
-உங்கள் உள்ளிட்ட வரிசை முழுமையற்ற கோடானைக் கொண்டிருந்தால், பொதுவான 'நகல்-பேஸ்ட்' பிழைகளைத் தவிர்க்க எச்சரிக்கை செய்தியைப் பெறுங்கள்!
நீங்கள் விரும்பினால், முன்னோக்கி ப்ரைமரில் ஒரு KOZAK வரிசையைச் சேர்க்கவும்
உங்களுக்கு ஸ்டார்ட் கோடன் தேவையா, மற்றும் ஸ்டாப் கோடான் தேவைப்பட்டால் தேர்வு செய்யவும் (அனைத்து 3 பொதுவான ஸ்டாப் கோடன்களும் தேர்ந்தெடுக்கக்கூடியவை)
-உங்கள் ப்ரைமர்களுக்கான உருகும் வெப்பநிலையை உள்ளிடவும், அது உப்பு சரிசெய்யப்பட்ட உருகும் வெப்பநிலையைப் பயன்படுத்தி கணக்கிடப்படுகிறது
உப்பு செறிவை உள்ளிடவும் (Na+)
உங்கள் இரண்டு ப்ரைமர்களுக்கும் 5'-எண்ட் நீட்டிப்பை உள்ளிடவும்
-பிரைமர்கள் G அல்லது C உடன் முடிவடையும் வகையில் உருவாக்கப்படுகின்றன
-உருகும் வெப்பநிலை, ஜி/சி உள்ளடக்கம் மற்றும் ப்ரைமர் நீளம் காட்டப்படும்
- வெளிப்படையான வடிவமைப்பு செயல்முறை! அனைத்து இடைநிலை படிகளும் காட்டப்படும்! நீங்கள் தேர்ந்தெடுத்த விருப்பங்கள் இறுதி முடிவுகளின் கீழ் காட்டப்படும்!
முழு வெளியீட்டையும் நகலெடுக்க நகலெடுக்கும் பொத்தான் மற்றும் அடுத்த வடிவமைப்பு படிகளுக்காக உங்கள் டெஸ்க்டாப் பிசிக்கு மின்னஞ்சல் மூலம் அனுப்பவும் அல்லது கோப்பாக சேமிக்கவும்!
-பதிப்பு 0.03 புதுப்பிப்பு: புதிய அம்சம் 'DeletionIn': ஒரு வரிசையிலிருந்து குறிப்பிட்ட உள் பகுதிகளை நீக்க (எ.கா. டொமைன்களை நீக்க) மேல்படிப்பு நீட்டிப்பு PCRக்கான ப்ரைமர்களை வடிவமைக்க உதவுகிறது.
-பதிப்பு 0.045 புதுப்பிப்பு: புதிய அம்சம் 'பிறழ்வு' உங்கள் வரிசையில் உள்ள ஒரு குறிப்பிட்ட கோடானை மற்றொரு அமினோ அமிலத்திற்கான குறியீடாக மாற்ற, மேல்படிப்பு நீட்டிப்பு PCRக்கான ப்ரைமர்களை வடிவமைக்க உதவுகிறது.
-பதிப்பு 0.060 புதுப்பிப்பு: புதிய அம்சம்: 'DeletionNC' - உங்கள் வரிசையில் இருந்து N(5')- அல்லது C(3')-டெர்மினல் பகுதிகளை நீக்க ப்ரைமர்களை வடிவமைக்க உதவுகிறது.
-பதிப்பு 0.080 புதுப்பிப்பு: புதிய அம்சம்: 'செருகுதல்' - மேல் பிரதான மெனுவில் இடதுபுறமாக ஸ்வைப் செய்து, உங்கள் வரிசையில் செருகும் வரிசையைச் செருகுவதற்கு மேல்நிலை நீட்டிப்பு PCRக்கான ப்ரைமர்களை வடிவமைப்பதற்கான உதவியைக் கண்டறியவும்
- பதிப்பு 0.085 புதுப்பிப்பு: புதிய அம்சம்: 'மாற்று' - மேல் மெயின் மெனுவில் இடதுபுறமாக ஸ்வைப் செய்து, மேல்புற நீட்டிப்பு PCRக்கான ப்ரைமர்களை வடிவமைப்பதற்கான உதவியைப் பெறவும், இது உள் பகுதியை உள்ளிடப்பட்ட செருகும் வரிசையுடன் மாற்றும்.
தயவு செய்து கவனிக்கவும்: எளிதான ப்ரைமர் டிசைன் மொபைல் பயன்பாடு பயன்படுத்தத் தயாராக இருக்கும் ப்ரைமர் சீக்வென்ஸை வழங்காது, இது ப்ரைமர் வடிவமைப்பின் போது மட்டுமே உங்களுக்கு ஆதரவளிக்கும். உருவாக்கப்பட்ட முடிவின் ஒவ்வொரு பகுதியின் சரியான தன்மையையும் பயனர் கவனமாக சரிபார்க்க வேண்டும் மற்றும் தேவையான அனைத்து சோதனைகளையும் மேற்கொள்ள வேண்டும்!
மகிழ்ச்சியான குளோனிங்! - இது உதவும் என்று நம்புகிறேன் :)
அம்சங்கள்:
உங்கள் வரிசையை உள்ளிட பேஸ்ட் பொத்தானைப் பயன்படுத்தவும். உள்ளிட்ட CDS/வரிசை எண்கள், இடைவெளிகள், வரி முறிவுகள், மேல் அல்லது சிறிய எழுத்துக்கள் உள்ளதா? பரவாயில்லை! எளிதான ப்ரைமர் வடிவமைப்பு எண்கள், இடைவெளிகள் மற்றும் வரி முறிவுகளை நீக்குகிறது மற்றும் எல்லாவற்றையும் பெரிய எழுத்துகளாக மாற்றுகிறது!
N-டெர்மினல் அல்லது சி-டெர்மினல் குறிச்சொற்கள் கொண்ட பிளாஸ்மிட்களுக்கான ப்ரைமர் வடிவமைப்பிற்கு நெகிழ்வானதாக இருக்க, உங்கள் வரிசையை ஸ்டார்ட் மற்றும் ஸ்டாப் கோடான் இல்லாமல் உள்ளிடவும் (அதில் ஒன்றை நீக்க மறந்துவிட்டால் எச்சரிக்கை செய்தியைப் பெறவும்).
20 க்கும் மேற்பட்ட வெவ்வேறு கட்டுப்பாடு என்சைம் தளங்களிலிருந்து தேர்வு செய்யவும், கோல்டன் கேட் குளோனிங் BsaI மற்றும் BSbI வழியாக ஆதரிக்கப்படுகிறது, நீங்கள் ஓவர்ஹாங்கிலும் நுழையலாம்
-உங்கள் தேர்ந்தெடுத்த நொதி நீங்கள் உள்ளிட்ட வரிசையைக் குறைத்தால் எச்சரிக்கை செய்திகளைப் பெறவும்
-அதிகபட்ச நெகிழ்வுத்தன்மை கட்டுப்பாடு என்சைம் விருப்பமான 'பிற', பட்டியலில் இல்லை என்றால் உங்கள் கட்டுப்பாட்டு நொதி தளத்தை உள்ளிடவும் - பாலிண்ட்ரோமிக் அல்லாத தொடர்கள் ஆதரிக்கப்படுகின்றன! நீங்கள் உள்ளிட்ட கட்டுப்பாடு தளம் நீங்கள் உள்ளிட்ட வரிசையிலோ அல்லது அதன் தலைகீழ் நிரப்பிலோ இருந்தால் எச்சரிக்கை செய்தியைப் பெறுவீர்கள்!
-உங்கள் உள்ளிட்ட வரிசை முழுமையற்ற கோடானைக் கொண்டிருந்தால், பொதுவான 'நகல்-பேஸ்ட்' பிழைகளைத் தவிர்க்க எச்சரிக்கை செய்தியைப் பெறுங்கள்!
நீங்கள் விரும்பினால், முன்னோக்கி ப்ரைமரில் ஒரு KOZAK வரிசையைச் சேர்க்கவும்
உங்களுக்கு ஸ்டார்ட் கோடன் தேவையா, மற்றும் ஸ்டாப் கோடான் தேவைப்பட்டால் தேர்வு செய்யவும் (அனைத்து 3 பொதுவான ஸ்டாப் கோடன்களும் தேர்ந்தெடுக்கக்கூடியவை)
-உங்கள் ப்ரைமர்களுக்கான உருகும் வெப்பநிலையை உள்ளிடவும், அது உப்பு சரிசெய்யப்பட்ட உருகும் வெப்பநிலையைப் பயன்படுத்தி கணக்கிடப்படுகிறது
உப்பு செறிவை உள்ளிடவும் (Na+)
உங்கள் இரண்டு ப்ரைமர்களுக்கும் 5'-எண்ட் நீட்டிப்பை உள்ளிடவும்
-பிரைமர்கள் G அல்லது C உடன் முடிவடையும் வகையில் உருவாக்கப்படுகின்றன
-உருகும் வெப்பநிலை, ஜி/சி உள்ளடக்கம் மற்றும் ப்ரைமர் நீளம் காட்டப்படும்
- வெளிப்படையான வடிவமைப்பு செயல்முறை! அனைத்து இடைநிலை படிகளும் காட்டப்படும்! நீங்கள் தேர்ந்தெடுத்த விருப்பங்கள் இறுதி முடிவுகளின் கீழ் காட்டப்படும்!
முழு வெளியீட்டையும் நகலெடுக்க நகலெடுக்கும் பொத்தான் மற்றும் அடுத்த வடிவமைப்பு படிகளுக்காக உங்கள் டெஸ்க்டாப் பிசிக்கு மின்னஞ்சல் மூலம் அனுப்பவும் அல்லது கோப்பாக சேமிக்கவும்!
-பதிப்பு 0.03 புதுப்பிப்பு: புதிய அம்சம் 'DeletionIn': ஒரு வரிசையிலிருந்து குறிப்பிட்ட உள் பகுதிகளை நீக்க (எ.கா. டொமைன்களை நீக்க) மேல்படிப்பு நீட்டிப்பு PCRக்கான ப்ரைமர்களை வடிவமைக்க உதவுகிறது.
-பதிப்பு 0.045 புதுப்பிப்பு: புதிய அம்சம் 'பிறழ்வு' உங்கள் வரிசையில் உள்ள ஒரு குறிப்பிட்ட கோடானை மற்றொரு அமினோ அமிலத்திற்கான குறியீடாக மாற்ற, மேல்படிப்பு நீட்டிப்பு PCRக்கான ப்ரைமர்களை வடிவமைக்க உதவுகிறது.
-பதிப்பு 0.060 புதுப்பிப்பு: புதிய அம்சம்: 'DeletionNC' - உங்கள் வரிசையில் இருந்து N(5')- அல்லது C(3')-டெர்மினல் பகுதிகளை நீக்க ப்ரைமர்களை வடிவமைக்க உதவுகிறது.
-பதிப்பு 0.080 புதுப்பிப்பு: புதிய அம்சம்: 'செருகுதல்' - மேல் பிரதான மெனுவில் இடதுபுறமாக ஸ்வைப் செய்து, உங்கள் வரிசையில் செருகும் வரிசையைச் செருகுவதற்கு மேல்நிலை நீட்டிப்பு PCRக்கான ப்ரைமர்களை வடிவமைப்பதற்கான உதவியைக் கண்டறியவும்
- பதிப்பு 0.085 புதுப்பிப்பு: புதிய அம்சம்: 'மாற்று' - மேல் மெயின் மெனுவில் இடதுபுறமாக ஸ்வைப் செய்து, மேல்புற நீட்டிப்பு PCRக்கான ப்ரைமர்களை வடிவமைப்பதற்கான உதவியைப் பெறவும், இது உள் பகுதியை உள்ளிடப்பட்ட செருகும் வரிசையுடன் மாற்றும்.
தயவு செய்து கவனிக்கவும்: எளிதான ப்ரைமர் டிசைன் மொபைல் பயன்பாடு பயன்படுத்தத் தயாராக இருக்கும் ப்ரைமர் சீக்வென்ஸை வழங்காது, இது ப்ரைமர் வடிவமைப்பின் போது மட்டுமே உங்களுக்கு ஆதரவளிக்கும். உருவாக்கப்பட்ட முடிவின் ஒவ்வொரு பகுதியின் சரியான தன்மையையும் பயனர் கவனமாக சரிபார்க்க வேண்டும் மற்றும் தேவையான அனைத்து சோதனைகளையும் மேற்கொள்ள வேண்டும்!
மகிழ்ச்சியான குளோனிங்! - இது உதவும் என்று நம்புகிறேன் :)
புதுப்பிக்கப்பட்டது:
டெவெலப்பர்கள் உங்கள் தரவை எப்படிச் சேகரிக்கிறார்கள் பகிர்கிறார்கள் என்பதைப் புரிந்துகொள்வதிலிருந்தே 'பாதுகாப்பு' தொடங்குகிறது. உங்கள் உபயோகம், பிராந்தியம், வயது ஆகியவற்றின் அடிப்படையில் தரவுத் தனியுரிமை மற்றும் பாதுகாப்பு நடைமுறைகள் வேறுபடலாம். இந்தத் தகவலை டெவெலப்பர் வழங்கியுள்ளார். அவர் காலப்போக்கில் இதைப் புதுப்பிக்கக்கூடும்.
தரவு எதுவும் மூன்றாம் தரப்புடன் பகிரப்படாது
பகிர்தலை டெவெலப்பர்கள் எப்படி அறிவிக்கிறார்கள் என்பது குறித்து மேலும் அறிக
தரவு சேகரிக்கப்படாது
சேகரிப்பதை டெவெலப்பர்கள் எப்படி அறிவிக்கிறார்கள் என்பது குறித்து மேலும் அறிக
புதிய அம்சங்கள்
Update for current Android versions
minor bug fixes
minor bug fixes
ஆப்ஸ் உதவி
டெவெலப்பர் குறித்த தகவல்கள்
Nikolas Furthmann
easyprimerdesign@gmail.com
Germany
