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PHREEQC plus
J. Heyrovsky Institute Prague
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关于此应用
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说明及用途:
PHREEQC(作者:David L. Parkhurst、C.A.J. Appelo)是一种最受欢迎的用于形态建模的地球化学代码。我们的应用程序通过集成 MOPAC(作者:James JP Stewart)、CHEMSOL(作者:Jan Florián、Arieh Warshel)、XTB(作者:C. Bannwarth、E. Caldeweyher、S. Ehlert、 A. Hansen、P. Pracht、J. Seibert、S. Spicher、S. Grimme、P. Shushkov、M. Stahn、H. Neugebauer、J.-M. Mewes、V. Asgeirsson、C. Bauer、J. Koopman )和 DFTB+(作者:B. Hourahine、B. Aradi、V. Blum、F. Bonafé、A. Buccheri、C. Camacho、C. Cevallos、M. Y. Deshaye、T. Dumitrică、A. Dominguez、S. Ehlert、M Elstner、T. van der Heide、J. Hermann、S. Irle、J. J. Kranz、C. Köhler、T. Kowalczyk、T. Kubař、I. S. Lee、V. Lutsker、R. J. Maurer、S. K. Min、I. Mitchell、C . Negre、T. A. Niehaus、A. M. N. Niklasson、A. J. Page、A. Pecchia、G. Penazzi、M. P. Persson、J. Řezáč、C. G. Sánchez、M. Sternberg、M. Stöhr、F. Stuckenberg、A. Tkatchenko、V. W.-z。 Yu,T. Frauenheim)和其他开源代码。内置数据库中不存在的任何自定义物种都可以在应用程序中计算,并在模型中使用结果(换句话说,可以在每次运行中单独构建一个新的特定数据库)。此外,当前软件包包含许多非常规数据库,利用来自大型数据库(例如 CHNOSZ、ModelSEED、Alexandria 库、KEGG 和其他文字来源)的实验数据以及预测/计算数据。
除了平衡态之外,代码还支持动力学建模,可以根据之前的过渡态计算自动生成相应的关键字块。作为非水系统的替代方案,FastChem Cond 形态建模也可用。所有程序功能均可离线使用。
关于计算精度的警告:MOPAC 代表了设备功率/计算时间和从小分子到中型分子的多种化合物类型的预测精度之间的合理折衷。然而,准确性是有限的。为了调整产生的能量,集成了 MOPAC 的 COSMO 模型以及 CHEMSOL 溶剂化模型,尽管 CHEMSOL 最初旨在与在更高理论水平上计算的结构和电荷结合使用。因此,在没有实验数据(来自所包含的数据库)可用的情况下,应谨慎对待所有计算的平衡和速率常数,并将其视为粗略估计。
重要的 !!!
尽管该应用程序由开源代码和资源组成,但某些组件的许可证要求用户在发布结果时引用原始参考文献。请检查“许可”和“关于应用程序”按钮下的所有许可信息。
PHREEQC PLUS 应用程序的所有用户通过下载、安装和使用该应用程序来遵守各个软件组件的所有许可条件,并负责保留它们。
应用程序源代码:https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus
接触:
Android 源代码的编译以及 Android 应用程序的开发由 J. Heyrovský 研究所的 Alan Liška (alan.liska@jh-inst.cas.cz) 和 Veronika Růžičková (sucha.ver@gmail.com) 完成。 CAS 物理化学,v.v.i.,Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8,捷克共和国。
网站:http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm
使用的第三方软件列表:
ACPDFVIEW、ANDROID SHELL、ARPACK、BLAS、CHEMSOL、CHIMESCALC、CPCM-X、CREST、DFTB+、DFTD4、EIGEN3、FASTCHEM Cond、GMP、GraphVIEW、LAPACK、LWONIOM、MBD、MCTC-LIB、MOPAC、MSTORE、MULTICHARGE、NUMSA、 OPENBABEL、OPENBLAS、OPENMOPAC、OPSIN、PHREEQC、PLOTMS、PYTHON、QCXMS、S-DFTD3、STDA、TBLITE、试驾、TOML-F、TRANSPOSE、X11-BASIC、XTB、XTB4STDA。
有关许可证和参考的更多信息 - 请参阅应用程序内部的许可信息。
更新日期
2025年6月26日
工具
数据安全
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Bug in structure transfer into the MolCanvas editor fixed
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支持团队邮箱
alan.liska@jh-inst.cas.cz
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隐私权政策
开发者信息
Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i.
alan.liska@jh-inst.cas.cz
2155/3 Dolejškova 182 00 Praha Czechia
+420 266 053 287
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