PHREEQC plus
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關於這個應用程式
說明及用途：
PHREEQC（作者：David L. Parkhurst、C.A.J. Appelo）是一種最受歡迎的用於形態建模的地球化學程式碼。我們的應用程式透過整合 MOPAC（作者：James JP Stewart）、CHEMSOL（作者：Jan Florián、Arieh Warshel）、XTB（作者：C. Bannwarth、E. Caldeweyher、S. Ehlert、 A. Hansen、P. Pracht、 J. Seibert、S. Spicher、S. Grimme、P. Shushkov、M. Stahn、H. Neugebauer、J.-M. Mewes、V. Asgeirsson、C. Bauer、J. Koopman ）和DFTB+（作者：B. Hourahine、B. Aradi、V. Blum、F. Bonafé、A. Buccheri、C. Camacho、C. Cevallos、M. Y. Deshaye、T. Dumitrică、A. Dominguez、S. Ehlert、M Elstner、T. van der Heide、A. Dominguez、S. Ehlert、M Elstner、T. van der Heide、 J. Hermann、S. Irle、J. J. Kranz、C. Köhler、T. Kowalczyk、T. Kubař、I. S. Lee、V. Lutsker、R. J. Maurer、S. K. Min、I. Mitchell、C . Negre、T. A. Niehaus、A. M. N. A. J. Page、A. Pecchia、G. Penazzi、M. P. Persson、J. Řezáč、C. G. Sánchez、M. Sternberg、M. Stöhr、F. Stuckenberg、A. Tkatchenko、V. W.-z。代碼。內建資料庫中不存在的任何自訂物種都可以在應用程式中計算，並在模型中使用結果（換句話說，可以在每次運行中單獨建立一個新的特定資料庫）。此外，目前軟體包包含許多非常規資料庫，利用來自大型資料庫（例如 CHNOSZ、ModelSEED、Alexandria 庫、KEGG 和其他文字來源）的實驗數據以及預測/計算數據。
除了平衡態之外，程式碼還支援動力學建模，可以根據先前的過渡態計算自動產生相應的關鍵字區塊。作為非水系統的替代方案，FastChem Cond 形態建模也可用。所有程式功能均可離線使用。
關於計算精度的警告：MOPAC 代表了設備功率/計算時間和從小分子到中型分子的多種化合物類型的預測精度之間的合理折衷。然而，準確性是有限的。為了調整產生的能量，整合了 MOPAC 的 COSMO 模型以及 CHEMSOL 溶劑化模型，儘管 CHEMSOL 最初旨在與在更高理論水平上計算的結構和電荷結合使用。因此，在沒有實驗數據（來自所包含的資料庫）可用的情況下，應謹慎對待所有計算的平衡和速率常數，並將其視為粗略估計。
重要的 ！
儘管該應用程式由開源程式碼和資源組成，但某些元件的許可證要求使用者在發布結果時引用原始參考文獻。請檢查「許可證」和「關於應用程式」按鈕下的所有許可資訊。
PHREEQC PLUS 應用程式的所有使用者透過下載、安裝和使用該應用程式來遵守各個軟體元件的所有許可條件，並負責保留它們。
應用程式原始碼：https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus
接觸：
Android 原始碼的編譯以及 Android 應用程式的開發由 J. Heyrovský 研究所的 Alan Liška (alan.liska@jh-inst.cas.cz) 和 Veronika Růžičková (sucha.ver@gmail.com) 完成。 ，v.v.i.，Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8，捷克共和國。
網址：http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm
使用的第三方軟體清單：
ACPDFVIEW、ANDROID SHELL、ARPACK、BLAS、CHEMSOL、CHIMESCALC、CPCM-X、CREST、DFTB+、DFTD4、EIGEN3、FASTCHEM Cond、GMP、GraphVIEW、LAPACK、LWONIOM、MBD、MCTC-LIB、MOPAC、MSTORE、MULTI. OPENBABEL、OPENBLAS、OPENMOPAC、OPSIN、PHREEQC、PLOTMS、PYTHON、QCXMS、S-DFTD3、STDA、TBLITE、試駕、TOML-F、TRANSPOSE、X11-BASIC、XTB、XTB4STDA。
有關許可證和參考的更多資訊 - 請參閱應用程式內部的許可資訊。
PHREEQC（作者：David L. Parkhurst、C.A.J. Appelo）是一種最受歡迎的用於形態建模的地球化學程式碼。我們的應用程式透過整合 MOPAC（作者：James JP Stewart）、CHEMSOL（作者：Jan Florián、Arieh Warshel）、XTB（作者：C. Bannwarth、E. Caldeweyher、S. Ehlert、 A. Hansen、P. Pracht、 J. Seibert、S. Spicher、S. Grimme、P. Shushkov、M. Stahn、H. Neugebauer、J.-M. Mewes、V. Asgeirsson、C. Bauer、J. Koopman ）和DFTB+（作者：B. Hourahine、B. Aradi、V. Blum、F. Bonafé、A. Buccheri、C. Camacho、C. Cevallos、M. Y. Deshaye、T. Dumitrică、A. Dominguez、S. Ehlert、M Elstner、T. van der Heide、A. Dominguez、S. Ehlert、M Elstner、T. van der Heide、 J. Hermann、S. Irle、J. J. Kranz、C. Köhler、T. Kowalczyk、T. Kubař、I. S. Lee、V. Lutsker、R. J. Maurer、S. K. Min、I. Mitchell、C . Negre、T. A. Niehaus、A. M. N. A. J. Page、A. Pecchia、G. Penazzi、M. P. Persson、J. Řezáč、C. G. Sánchez、M. Sternberg、M. Stöhr、F. Stuckenberg、A. Tkatchenko、V. W.-z。代碼。內建資料庫中不存在的任何自訂物種都可以在應用程式中計算，並在模型中使用結果（換句話說，可以在每次運行中單獨建立一個新的特定資料庫）。此外，目前軟體包包含許多非常規資料庫，利用來自大型資料庫（例如 CHNOSZ、ModelSEED、Alexandria 庫、KEGG 和其他文字來源）的實驗數據以及預測/計算數據。
除了平衡態之外，程式碼還支援動力學建模，可以根據先前的過渡態計算自動產生相應的關鍵字區塊。作為非水系統的替代方案，FastChem Cond 形態建模也可用。所有程式功能均可離線使用。
關於計算精度的警告：MOPAC 代表了設備功率/計算時間和從小分子到中型分子的多種化合物類型的預測精度之間的合理折衷。然而，準確性是有限的。為了調整產生的能量，整合了 MOPAC 的 COSMO 模型以及 CHEMSOL 溶劑化模型，儘管 CHEMSOL 最初旨在與在更高理論水平上計算的結構和電荷結合使用。因此，在沒有實驗數據（來自所包含的資料庫）可用的情況下，應謹慎對待所有計算的平衡和速率常數，並將其視為粗略估計。
重要的 ！
儘管該應用程式由開源程式碼和資源組成，但某些元件的許可證要求使用者在發布結果時引用原始參考文獻。請檢查「許可證」和「關於應用程式」按鈕下的所有許可資訊。
PHREEQC PLUS 應用程式的所有使用者透過下載、安裝和使用該應用程式來遵守各個軟體元件的所有許可條件，並負責保留它們。
應用程式原始碼：https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus
接觸：
Android 原始碼的編譯以及 Android 應用程式的開發由 J. Heyrovský 研究所的 Alan Liška (alan.liska@jh-inst.cas.cz) 和 Veronika Růžičková (sucha.ver@gmail.com) 完成。 ，v.v.i.，Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8，捷克共和國。
網址：http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm
使用的第三方軟體清單：
ACPDFVIEW、ANDROID SHELL、ARPACK、BLAS、CHEMSOL、CHIMESCALC、CPCM-X、CREST、DFTB+、DFTD4、EIGEN3、FASTCHEM Cond、GMP、GraphVIEW、LAPACK、LWONIOM、MBD、MCTC-LIB、MOPAC、MSTORE、MULTI. OPENBABEL、OPENBLAS、OPENMOPAC、OPSIN、PHREEQC、PLOTMS、PYTHON、QCXMS、S-DFTD3、STDA、TBLITE、試駕、TOML-F、TRANSPOSE、X11-BASIC、XTB、XTB4STDA。
有關許可證和參考的更多資訊 - 請參閱應用程式內部的許可資訊。
更新日期
新功能
Bug in structure transfer into the MolCanvas editor fixed
應用程式支援
開發人員資訊
Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i.
alan.liska@jh-inst.cas.cz
2155/3 Dolejškova
182 00 Praha
Czechia
+420 266 053 287
