Du, en super politimann kalt Mr. Justice, er på et oppdrag for å drepe Mr. Thorne sammen med teamet ditt. Under dette oppdraget havnet du i et bakhold: alle lagkameratene dine gikk seg vill eller ble drept. Men du var i stand til å rømme med en båt til en tapt øy, inkludert en (hemmelig) bunkersleie. Spillet starter her.
Det er to hovedelementer i spillet:
1. Forsvar øya/bunkeren din og oppgrader den for å forsvare stuen din mot innkommende fiender.
2. Angrip øyer fanget av Mr. Thorne for å ha mistet politiet/gisler, finne forsyninger og til slutt drepe Mr. Thorne selv.
I løpet av spillet finner du nye lagkamerater, som du kan kontrollere selv eller gi oppgaver for å forsvare øya din, speide etter nye forsyninger eller gi ingeniøroppgaver.