MGIMO yra vienas iš seniausių akademinių centrų šalyje tarptautinio profilio specialistų rengimo. Įsisteigimo universiteto data laikoma spalio 1944 14, kai Liaudies Komisarų transformuotos sukurta prieš metus Tarptautinio departamento Maskvos valstybinio Lomonosovo universiteto kaip nepriklausoma institucija. Pirmoji MGIMO buvo 200 mokiniai. Nuo 1946 studentų iš užsienio šalių buvo nukreipti studijuoti MGIMO. Pirmaisiais metais buvo trys fakultetai universitete: tarptautinės, ekonominės ir teisinės. 1954 metais, rytinė šaka buvo atidaryta MGIMO. Tai buvo susijungimo su viena iš seniausių Rusijos universitetuose rezultatas - Maskvos institutas Orientalistikos studijų įpėdinis Lazar mokykla, įsteigta 1815 Iki MGIMO persikėlė Lozorių ir garsiąją biblioteką, kuri neturėjo lygus nuo rytietiškos literatūros sudėties Maskvoje.
1958 MGIMO susijungė su užsienio prekybos TSRS MW institutas, įsteigtas 1934 metais Leningrade, tada išversti į Maskvą. Rezultatas buvo žymiai išplėtė Ekonomikos fakulteto, suaktyvino savo dėmesio specialistų rengimo užsienio prekybos ir užsienio prekybos. 1969, Tarptautinė Teisės fakulteto ir Tarptautinės žurnalistikos fakultetą buvo įkurta.
1991 metais iš Tarptautinio verslo ir verslo administravimo fakulteto institutas, o 1998 m įsteigė Politikos mokslų katedros.
Nuo 1994 metais Rusijos universiteto Vyriausybės sprendimas patikėtas specialistų mokymui valstybės ir savivaldybių valdymo iš asmenų, turinčių aukštojo mokslo srityje, darbo viešojo administravimo. Šios mokymo programos įgyvendinamos naują struktūrinį padalinį Universiteto - Tarptautinės vadybos institutas.
2000 vasario, remiantis didžiausių naftos, dujų ir energetikos bendrovių Rusijoje MGIMO struktūros iniciatyva buvo sudaryta pagal Tarptautinės energetikos instituto politikos ir diplomatijos. Instituto tikslas buvo už tarptautinio bendradarbiavimo energetikos srityje plėtrą mokymą.
1994 metais institutas gavo universitetinį statusą.
Septynis dešimtmečius Maskvos valstybinis tarptautinių santykių institutas tapo pagrindine akademinių ir mokslinių tyrimų centras, kuris įgyvendina edukacines programas bakalauro ir magistro programų ir 16 sričių mokymo (valstybės ir savivaldybės administracijos, Žurnalistika, užsienio kraštotyros, Lingvistika, tarptautinių santykių, valdymo, Mokytojų ugdymas, Politologija, reklamos ir viešųjų ryšių, socialinės ir kultūrinės veiklos, sociologija, prekybos, finansų ir kredito, eq logijos ir aplinkos vadyba, ekonomika, teisė), atliko po studijų mokymus 28 specialybių (septynios disertacijos tarybomis), atliko intensyvius kalbos mokymas 53 užsienio kalbų (20 kalbų departamentų). Iš universiteto aštuonių departamentų, penki institutai ir verslo mokyklos ir tarptautinių kompetencijų struktūra.
Paruošimas MGIMO magistro prasidėjo 1994 metais, kai buvo atidaryta pirmoji programa Pasaulio politikos ir vadybos. Šiuo metu yra 48 magistro MGIMO 13 sričių mokymo programas.
Liepos 2013 MGIMO gavo tarptautinę akreditaciją švietimo programas trijose švietimo, tapdamas pirmuoju ir kol kas vienintelis universitetas Rusijoje įgyvendinti tokį didelio masto projektą.