NDKmol - მოლეკულური Viewer for Android
== მომხმარებლის ==
NDKmol არის მოლეკულური მაყურებელს Android. თქვენ შეგიძლიათ ნახოთ სამგანზომილებიანი სტრუქტურების ცილები, ნუკლეინის მჟავები და მცირე მოლეკულების. NDKmol მხარს უჭერს ყველაზე გავრცელებული წარმომადგენლობების მოლეკულების, როგორიცაა ლენტი, კვალი, ჯოხი, სფეროში და ხაზი. NDKmol მხარს უჭერს სიმეტრია ოპერაციებში; ბიოლოგიური შეკრებებისა და ბროლის შეფუთვა შეიძლება ნაჩვენები. თქვენ შეგიძლიათ მოძებნოთ და ჩამოტვირთოთ სტრუქტურებში RCSB PDB და NCBI Pubchem.
NDKmol თითქმის იგივე ფუნქციონალური როგორც GLmol, რომელიც არის დაწერილი
WebGL / Javascript და ეშვება ბრაუზერების. შეგიძლიათ ცდილობენ GLmol at http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html
== თვისებები ==
* წაიკითხე PDB ან SDF / MOL ფაილი
* როტაცია / Translate / Zoom მოდელი თითის
* წარმომადგენლობები
- Line
- Stick
- Sphere (van der Waals რადიუსი)
- Alpha ნახშირბადის კვალი
- Ribbon (თხელი ან სქელი)
- Strand
- B ფაქტორი მილის
- ნუკლეინის მჟავას ასვლა
- ნუკლეინის მჟავას ონლაინ
- გამხსნელი "ვარსკვლავები"
* დამარბილებელი ბეტა-sheets
* Coloring
- By ჯაჭვი
- By საშუალო სტრუქტურა (როდესაც განსაზღვრული SHEET / HELIX ჩანაწერები)
- By ელემენტები
- Gradation (a.k.a chainbow)
- B ფაქტორი
- პოლარული / არაპოლარულ
* Crystallography
- ჩვენების ერთეული საკანში
- Show ბროლის შეფუთვა (როდესაც განისაზღვრება შენიშვნა სექცია)
- ჩვენების ბიოლოგიური ასამბლეის (როდესაც განისაზღვრება შენიშვნა სექცია)
== როგორ გამოვიყენოთ ==
როდესაც დაიწყო, NDKmol ავტომატურად იტვირთება Porin (PDBID: 2POR) როგორც მაგალითად. თქვენ შეგიძლიათ როტაცია მოლეკულაში თითის.
გაადიდეთ და თარგმნა მოლეკულა, დააჭირეთ მენიუს ღილაკს თქვენი ტელეფონი / ტაბლეტი და შეარჩიეთ რეჟიმი. ორი თითის ჟესტები ასევე მხარი დაუჭირა.
ყველაფერი შეიძლება გაკეთდეს მენიუდან.
ჩატვირთვა სხვა PDB ფაილი, გთხოვთ, დააყენა ფაილი "PDB" დირექტორია SD ბარათი და აირჩიეთ "ღია" ბრძანება MENU. თქვენ ასევე შეგიძლიათ ჩამოტვირთოთ სტრუქტურებში პირდაპირ RCSB PDB და NCBI PubChem სერვერზე. აირჩიეთ "ძიება და ჩამოწერა" მენიუში.
== საკონტაქტო ==
პროექტის ვებგვერდზე მდებარეობს http://webglmol.sourceforge.jp/. თქვენ შეგიძლიათ კოდების ამ პროგრამის აქ.
კომენტარები და წინადადებები სტუმარს http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ ან biochem_fan@users.sourceforge.jp
=== ლიცენზია შეტყობინების ===
NDKmol თავად ლიცენზირებულია ქვეშ GNU Lesser General Public License ასეთია.
თუმცა, PDB ფაილი შედის, როგორც მაგალითები სხვადასხვა პირობებში.
გთხოვთ კონსულტაციები
http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html
-------------
NDKmol - მოლეკულური Viewer for Android
(C) Copyright 2011, biochem_fan
ეს პროგრამა არის უფასო პროგრამული უზრუნველყოფა, თქვენ შეგიძლიათ გაავრცელოთ და / ან შეცვალოთ
ის პირობების GNU Lesser General Public License მიერ გამოქვეყნებული
თავისუფალი პროგრამული უზრუნველყოფის ფონდის, ან ვერსია 3 ლიცენზია, ან
(თქვენი სურვილისამებრ) უფრო ახალი.
ეს პროგრამა ვრცელდება იმ იმედით, რომ იგი იქნება საჭირო,
მაგრამ ყოველგვარი გარანტიის გარეშე; გარეშე კი გარანტიის
სავაჭრო ან ფიტნეს კონკრეტული მიზნისთვის. იხილეთ
GNU Lesser General Public ლიცენზიის პირობები.
თქვენ უნდა მიგეღოთ ასლი GNU Lesser General Public License
ამ პროგრამასთან ერთად. თუ არა, რომ .