IMF er avviklet og Ethan (Tom Cruise) er ute i kulden, men teamet hans står nå overfor et nettverk av topptrente spesialagenter, Syndikatet. Med et økende antall terroristangrep er de fast bestemte på å innføre en ny verdensorden. Ethan samler sammen teamet sitt og slår seg sammen med den avviste britiske agenten Ilsa Faust (Rebecca Ferguson), som også kan være medlem av denne egenrådige nasjonen, og gruppen står overfor sitt vanskeligste oppdrag hittil.